Программа определения и анализа ассоциациированности видов в экологических сообществах
Автор: Селезнев Д.Г.
Журнал: Самарская Лука: проблемы региональной и глобальной экологии @ssc-sl
Рубрика: Краткие сообщения
Статья в выпуске: 3 т.32, 2023 года.
Бесплатный доступ
Описана разработанная автором методика выделения ассоциаций видов, которая отличается простотой реализации, устойчивостью и воспроизводимостью результатов. Недостатком методики является использование только качественных данных о наличии или отсутствии вида в пробе, а не его количественных характеристик.
Видовые ассоциации, статистическая методика, общая сила связности
Короткий адрес: https://sciup.org/148327557
IDR: 148327557 | DOI: 10.24412/2073-1035-2023-10498
Список литературы Программа определения и анализа ассоциациированности видов в экологических сообществах
- Blondel V.D., Guillaume J.-L., Lambiotte R., Lefebvre E. Fast unfolding of communities in large networks // Journal of Statistical Mechanics: Theory and Experiment. 2008. P10008. P. 1-12. DOI: 10.1088/1742-5468/2008/10/P10008
- Brandes U., Delling D., Gaertler M., Gorke R., Hoefer M., Nikoloski Z., Wagner D. On Modularity Clustering // IEEE Transactions on Knowledge and Data Engineering. 2008. Vol. 20, iss. 2. P. 172-188. DOI: 10.1109/TKDE.2007.190689
- Chang W., Cheng J., Allaire J., Sievert C., Schloerke B., Xie Y., Allen J., McPherson J., Dipert A., Borges B. shiny: Web Application Framework for R. R package version 1.7.4.1. 2023. [https://CRAN.R-project.org/package=shiny].
- Csardi G., Nepusz T. The igraph software package for complex network research // International journal of complex systems. 2006. Vol. 1695 (5). P. 1-9. [https://igraph.org].
- Golovatyuk L.V., Seleznev D.G., Kurina E.M. Analysis of macrozoobenthos species associations in the eastern european plain under conditions of changing climatic zones // Hydrobiologia. (In press).
- Gotell N.J. Null model analysis of species co-occurrence patterns // Ecology. 2000. Vol. 81, iss. 9. P. 2606-2621. [2606:NMAOSC]2.0.CO;2. DOI: 10.1890/0012-9658(2000)081
- Odum E.P., Barrett G.W. Fundamentals of Ecology. Third edition. Philadelphia: Saunders, 1971. 574 p.
- Traag V.A., Bruggeman J.Community detection in networks with positive and negative links //Physical Review E. 2008. Vol. 80, iss. 3. P036115. DOI: 10.1103/PhysRevE.80.036115
Краткое сообщение
