Психрофильные псевдомонады-эндофиты как потенциальные агенты в биоконтроле фитопатогенных и гнилостных микроорганизмов при холодильном хранении картофеля
Автор: Щербаков А.В., Щербакова Е.Н., Мулина С.А., Роц П.Ю., Дарью Р.Ф., Кипрушкина Е.И., Гончар Л.Н., Чеботарь В.К.
Журнал: Сельскохозяйственная биология @agrobiology
Рубрика: Картофелеводство: наука и технологии
Статья в выпуске: 1 т.52, 2017 года.
Бесплатный доступ
При хранении продовольственного и семенного картофеля существенные потери обусловлены высоким фитопатогенным фоном семян и клубней. В связи с этим внимание исследователей привлекают биологические средства защиты на основе биоконтрольных микроорганизмов. Род Pseudomonas бактерий, относящихся к группе PGPR (plant-growth promoting rhizobacteria), включает виды, наиболее эффективно колонизирующие высшие растения и используемые в биопрепаратах. Нами впервые исследованы особенности влияния психрофильного штамма бактерий Pseudo-monas sp. RF13H на сохранность клубней холодоустойчивых промышленных сортов картофеля, рекомендованных для выращивания в Ленинградской области, определена эффективность защиты клубней от ряда фитопатогенных организмов в условиях холодильного хранения, оценена динамика численности интродуцируемого штамма на поверхности клубней в период хранения. С помощью флуоресцентной in situ гибридизации и конфокальной сканирующей лазерной микроскопии впервые изучена локализация клеток бактерий и колонизация ими поверхности клубней при нормальной и пониженной температуре, указывающая на взаимовыгодные условия растительно-микробных отношений. Определив таксономическое положение ряда штаммов псевдомонад методами молекулярно-генетического анализа и охарактеризовав их хозяйственно ценные физиологические свойства (фунгицидная и бактерицидная активность, скорость роста в диапазоне пониженных температур, продукция ауксиноподобных фитогормонов), мы выявили перспективный психрофильный штамм Pseudomonas sp. RF13H и изучили возможности его применения для повышения сохранности и оптимизации биохимических процессов в клубнях картофеля при низкотемпературном хранении. Так, обнаружено снижение частоты фитопатогенных микроорганизмов на поверхности клубней при их обработке Pseudomonas sp. RF13H. Среднее число клубней, пораженных всеми типами инфекций, при такой обработке снизилось более чем на 50 % в сравнении с контролем. Тенденция сохранялась на протяжении 3 мес: в контрольных образцах доля пораженных клубней достигала 30 %, в то время как интродукция биоконтрольного штамма позволила уменьшить этот показатель до 10-13 %. При температуре 4 °С численность биоконтрольного штамма бактерий на поверхности клубней оставалась достаточно стабильной на протяжении 5 мес, существенно снизившись к концу хранения до следовых количеств. Отмечено формирование микроколоний бактерий, которые часто локализованы в углублениях и нишах на поверхности клубня. Кроме того, высокая плотность бактерий была обнаружена на границе между клетками перидермы клубней и в местах экссудации биохимических веществ, которые служат питанием для бактерий. При сравнительном изучении функции ферментов антиоксидантной защиты (каталазы, пероксидазы, супероксиддисмутазы) установлено, что интродукция Pseudomonas sp. RF13H способствует активации окислительно-восстановительных процессов, повышая устойчивость клубней к заражению. Показано, что изучаемый штамм положительно влияет на состав микробиома эпидермиса картофеля. В итоге вследствие индукции собственного иммунитета и создания барьера для проникновения болезнетворного организма заражение клубня снижается.
Картофель, биоконтроль фитопатогенов, флуоресцентная in situ гибридизация
Короткий адрес: https://sciup.org/142214003
IDR: 142214003 | DOI: 10.15389/agrobiology.2017.1.116rus
Список литературы Психрофильные псевдомонады-эндофиты как потенциальные агенты в биоконтроле фитопатогенных и гнилостных микроорганизмов при холодильном хранении картофеля
- Phatak H.C. The role of seed and pollen in the spread of plant pathogens particularly viruses. Tropical Pest Management, 2009, 26(3): 278-285 ( ) DOI: 10.1080/09670878009414413
- Darrasse A., Arnaud Darsonval A., Boureau T., Brisset M.-N., Durand K., Jacques M.-A. Transmission of plant-pathogenic bacteria by nonhost seeds without induction of an associated defense reaction at emergence. Appl. Environ. Microbiol., 2010, 76(20): 6787-6796 ( ) DOI: 10.1128/AEM.01098-10
- Russian Federation. Режим доступа: http://www.fao.org/faostat/en/#country/185. Без даты.
- Bale J.S., van Lenteren J.S., Bigler F. Biological control and sustainable food production. Phil. Trans. R. Soc. B, 2008, 363(1492): 761-776 ( ) DOI: 10.1098/rstb.2007.2182
- Vuro M. Enhancing biocontrol agents and handling risks/M. Vurro, J. Gressel, T. Butt, G.E. Harman, A. Pilgeram, R.J. Leger, D.L. Nuss (eds.). IOS Press, Amsterdam, 2001.
- Rosenblueth M., Martínez-Romero E. Bacterial endophytes and their interactions with hosts. Mol. Plant-Microbe Interact., 2006, 19: 827-837 ( ) DOI: 10.1094/MPMI-19-0827
- Holliday P. A dictionary of plant pathology. Cambridge University Press, Cambridge, 1989 ( ) DOI: 10.1017/S0014479700001393
- Schulz B., Boyle C. What are endophytes? In: Microbial root endophytes/B.J.E. Schulz, C.J.C. Boyle, T.N. Sieber (eds.). Springer-Verlag, Berlin, 2006: 1-13.
- Максимов И.В., Абизгильдина Р.Р., Пусенкова Л.И. Стимулирующие рост растений микроорганизмы как альтернатива химическим средствам защиты от патогенов. Прикладная биохимия и микробиология, 2011, 47: 373-385 ( ) DOI: 10.1134/S0003683811040090
- Manter D.K., Delgado J.A., Holm D.G., Stong R.A. Pyrosequencing reveals a highly diverse and cultivar-specific bacterial endophyte community in potato roots. Microb. Ecol., 2010, 60: 157-166 ( ) DOI: 10.1007/s00248-010-9658-x
- İnceoğlu O., Falcao Salles J., van Elsas J.D. Soil and cultivar type shape the bacterial community in the potato rhizosphere. Microb. Ecol., 2012, 63: 460-470 ( ) DOI: 10.1007/s00248-011-9930-8
- Weinert N., Piceno Y., Ding G.C., Meincke R., Heuer H., Berg G., Schloter M., Andersen G., Smalla K. PhyloChip hybridization uncovered an enormous bacterial diversity in the rhizosphere of different potato cultivars: many common and few cultivar-dependent taxa. FEMS Microbiol. Ecol., 2011, 75: 497-506 ( ) DOI: 10.1111/j.1574-6941.2010.01025.x
- Andreote F.D., Rocha U.N., Araújo W.L., Azevedo J.L., van Overbeek L.S. Effect of bacterial inoculation, plant genotype and developmental stage on root-associated and endophytic bacterial communities in potato (Solanum tuberosum). Antonie Van Leeuwenhoek, 2010, 97: 389-399 ( ) DOI: 10.1007/s10482-010-9421-9
- Reiter B., Pfeifer U., Schwab H., Sessitsch A. Response of endophytic bacterial communities in potato plants to infection with Erwinia carotovora subsp. atroseptica. Appl. Environ. Microbiol., 2002, 68: 2261-2268 ( ) DOI: 10.1128/AEM.68.5.2261-2268.2002
- Garbeva P., Overbeek L.S.S., Vuurde J.W., Elsas J.D.D. Analysis of endophytic bacterial communities of potato by plating and denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) of 16S rDNA based PCR fragments. Microb. Ecol., 2001, 41: 369-383 ( ) DOI: 10.1007/s002480000096
- Perombelon M.C.M., Gullings-Handley J., Kelman A. Population dynamics of Erwinia carotovora and pectolytic Clostridium spp. in relation to decay of potatoes. Phytopathology, 1979, 69: 167-173 ( ) DOI: 10.1038/srep11606
- Koiv V., Roosaare M., Vedler E., Kivistik P.A., Toppi K., Schryer D.W., Remm M., Tenson T., Mae A. Microbial population dynamics in response to Pectobacterium atrosepticum infection in potato tubers. Scientific Reports, 2015, Article number 11606: 1-18 ( ) DOI: 10.1038/srep11606
- Andreote F.D., de Araújo W.L., de Azevedo J.L., van Elsas J.D., da Rocha U.N., van Overbeek L.S. Endophytic colonization of potato (Solanum tuberosum L.) by a novel competent bacterial endophyte, Pseudomonas putida strain P9, and its effect on associated bacterial communities. Appl. Environ. Microbiol., 2009, 75: 3396-3406 ( ) DOI: 10.1128/AEM.00491-09
- Verma V.C., Gange A.C. Advances in endophytic research. Springer Science & Business Media, Berlin, 2013 (ISBN 978-81-322-1575-2).
- Щербаков А.В. Эндофитные сообщества сфагновых мхов как источник бактерий -эффективных ассоциантов сельскохозяйственных культур. Автореф. канд. дис. СПб, 2014.
- Коростик Е.В., Пинаев А.Г., Ахтемова Г.А., Андронов Е.Е. Универсальные 16S-рРНК праймеры для описания генетического разнообразия почвенных прокариот. Экологическая генетика, 2006, 4(4): 32-37.
- Magnusson J., Schnurer, J. Lactobacillus coryniformis subsp. coryniformis strain Si3 produces a broad-spectrum proteinaceous antifungal compound. App. Envir. Microbiol., 2001, 67(1): 1-5 ( ) DOI: 10.1128/AEM.67.1.1-5.2001
- Зенова Г.М., Степанов А.Л., Лихачев А.А., Манучарова Н.А. Практикум по биологии почв. М., 2002.
- Теппер Е.З., Шильникова В.К. Практикум по микробиологии. М., 2004.
- Синькевич М.С., Нарайкина Н.В., Трунова Т.И. Процессы, препятствующие повышению перекисного окисления липидов у холодостойких растений при гипотермии. Физиология растений, 2011, 58: 875-882.
- Kumar G.N., Knowles N.R. Changes in lipid peroxidation and lipolytic and free-radical scavenging enzyme during aging and sprouting of potato (Solanum tuberosum L.) seed-tubers. Plant Physiol., 1993, 102: 115-124 ( ) DOI: 10.1104/pp.102.1.115
- Нарайкина Н.В., Синькевич М.С., Демин И.Н., Селиванов А.А., Мошков И.Е., Трунова Т.И. Изменения активности изоформ СОД при низкотемпературной адаптации у растений картофеля (Solanum tuberosum L.) дикого типа и трансформированных геном 12-ацил-липидной десатуразы. Физиология растений, 2014, 61: 359-366.
- Integrated DNA Technologies. Режим доступа: https://eu.idtdna.com/calc/analyzer. Без даты.
- Cardinale M., Vieira de Castro J., Muller H., Berg G., Grube M. In situ analysis of the bacterial community associated with the reindeer lichen Cladonia arbuscular reveals predominance of Alphaproteobacteria. FEMS Microbiol. Ecol., 2008, 66: 63-71 ( ) DOI: 10.1111/j.1574-6941.2008.00546.x
- Щербаков А.В., Брагина А.В., Кузьмина Е.Ю., Берг К., Мунтян А.Н., Макарова Н.М., Мальфанова Н.В., Кардинале М., Берг Г., Чеботарь В.К., Тихонович И.А. Эндофитные бактерии сфагновых мхов как перспективные объекты сельскохозяйственной микробиологии. Микробиология, 2013, 82(3): 312-322.
- Peix A., Ramírez-Bahena M.H., Velázquez E. Historical evolution and current status of the taxonomy of genus Pseudomonas. Infection, Genetics and Evolution, 2009, 9(6): 1132-1147 ( ) DOI: 10.1016/j.meegid.2009.08.001
- Cornelis P. Pseudomonas: genomics and molecular biology. Horizon Scientific Press, Pool, 2008 (ISBN 978-1-904455-19-6).
- Toth E.M., Borsodi A.K, Felfoldi T., Vajna B., Sipos R., Marialigeti K. Practical microbiology. Eötvös Loránd Tudományegyetem, Budapest, 2013.
- Wegener C.B., Jansen G. Antioxidant capacity in cultivated and wild Solanum species: The effect of wound stress. Food Funct., 2010, 1: 209-218 ( ) DOI: 10.1039/C0FO00063A
- Grace S.C. Phenolics as antioxidants. In: Antioxidants and reactive oxygen species in plants/N. Smirnoff (ed.). Blackwall Publishing Ltd, Oxford, 2005.
- Wegener C.B., Jansen G. Antioxidants in different potato genotypes: effect of drought and wounding etress. Agriculture, 2013, 3: 131-146 ( ) DOI: 10.3390/agriculture3010131
- Верхотуров В.В., Топорищева В.К. Состояние антиоксидантной системы ячменя при замачивании и солодоращении. Хранение и переработка сельхозсырья, 2003, 9: 26-30.
- Кипрушкина Е.И. Воздействие низкой температуры на динамику численности и проявление биоконтролирующего эффекта бактериями родов Pseudomonas и Bacillus. Вестник Международной академии холода, 2007, 3: 34-38.
- Колодязная В.С., Кипрушкина Е.И. Холодильная технология пищевых продуктов (биохимические и физико-химические основы). СПб, 2008.
- Паутов А.А. Морфология и анатомия вегетативных органов растений. СПб, 2012.
- Олескин А.В., Ботвинко И.В. Колониальная организация и межклеточная коммуникация у микроорганизмов. Микробиология, 2000, 69: 309-327