Распространение протеолитических бактерий в холодных источниках Буксыхен (Северное Прибайкалье)

Распространение протеолитических бактерий в холодных источниках Буксыхен (Северное Прибайкалье)

Автор: Банзаракцаева Туяна Геннадьевна, Дамбинова Екатерина Цыдыпжаповна, Муруева Елена Леонидовна, Биджоян Арман Мурадович, Лаврентьева Елена Владимировна

Журнал: Природа Внутренней Азии @nature-inner-asia

Рубрика: Биология

Статья в выпуске: 2 (15), 2020 года.

Бесплатный доступ

В холодных источниках Буксыхен (Северное Прибайкалье) рассмотрено пространственно-временное распространение гетеротрофных бактерий, в частности протеолитической группы. Показано, что воды пяти выходов источников Буксыхен являются постоянно холодными, пресными и слабощелочными и относятся к гидрокарбонатному кальциевому типу. Сравнительный анализ не выявил сезонных изменений в распространении гетеротрофных бактерий. Численность аэробных и анаэробных протеолитических бактерий, независимо от типа пробы, была достаточно высокой и достигала 106 кл/мл. Впервые из источников Буксыхен-щитовидный и Буксыхен-желудочный выделены чистые культуры психротолерантных протеолитических факультативно-анаэробных бактерий родов Janthinobacterium и Yersinia, по предварительным данным, представляющие новые виды данных таксонов.

Еще

Холодные источники, микробное сообщество, гетеротрофные бактерии, протеолитические бактерии, психрофильные и психротолерантные бактерии

Короткий адрес: https://sciup.org/148318041

IDR: 148318041   |   DOI: 10.18101/2542-0623-2020-2-24-36

Список литературы Распространение протеолитических бактерий в холодных источниках Буксыхен (Северное Прибайкалье)

  • Аринушкина Е. В. Руководство по химическому анализу почв. М.: Изд-во Моск. ун-та, 197Ö. 488 с.
  • Ульзетуева И. Д., Хахинов В. В. Гидрохимическая характеристика минеральных источников Юго-Западного Забайкалья // Водные ресурсы. 2Ö11. Т. 38, № 5. С. 585-592.
  • Anesio A. M., Lutz S., Chrismas N. A. M., Benning L. G. The microbiome of glaciers and ice sheets // NPJ Biofilms Microbiomes. 2Ö17. V 3, № 1Ö. D0I:10.1038/s41522-017-0019-0
  • Boetius A., Anesio A. M., Deming J. W., Mikucki J. A., Rapp J. Z. Microbial ecology of the cryosphere: sea ice and glacial habitats // Nat. Rev. Microbiol. 2Ö15. V. 13, № 11. Pp. 677-69ö. doi:10.1038/nrmicro3522
  • Brambilla E. et al. 16S rDNA diversity of cultured and uncultured prokaryotes of a mat sample from Lake Fryxell, McMurdo Dry Valleys, Antarctica // Extremophiles. 2001. V 5, № 1. Pp. 23-33.
  • Brinkmeyer R., Knittel K., Jürgens J., Weyland H., Amann R. Helmke E. Diversity and Structure of Bacterial Communities in Arctic versus Antarctic Pack Ice // Applied and environmental microbiology. 2003. V 69. Pp. 6610-6619. doi:10.1128/AEM.69.11.6610-6619.2003.
  • Camacho A., Rochera C., Silvestre J. José, Vicente E., Hahn M. W. Spatial Dominance and Inorganic Carbon Assimilation by Conspicuous Autotrophic Biofilms in a Physical and Chemical Gradient of a Cold Sulfurous Spring: The Role of Differential Ecological Strategies // Microbial ecology. 2005. V. 50. Pp. 172-184. doi:10.1007/s00248-004-0156-x
  • Chaudhary A., Haack Sh. K., Duris J. W., Marsh T.L. Bacterial and Archaeal Phylogenetic Diversity of a Cold Sulfur-Rich Spring on the Shoreline of Lake Erie, Michigan // Applied and Environmental Microbiology. 2009. V 75, № 15. Pp. 5025-5036. doi:10.1128/AEM.00112-09
  • Gerdes B., Brinkmeyer R., Dieckmann G., Helmke E. Influence of crude oil on changes of bacterial communities in Arctic sea-ice // FEMS Microb. Ecol. 2005. V 53, № 1. Pp. 129-139.
  • Hungate R. E. A roll tube method for cultivation of strict anaerobes // In: Methods in microbiology 13. Eds. Norris J. R., Ribbons D. W. New York: Acad. 1969. V. 1. P. 117.
  • Harder T. Marine epibiosis: concepts, ecological consequences and host defence // Mar. Indust. Biofouling. 2009. V. 4. Pp. 219-231.
  • Hotaling S., Finn D. S., Joseph Giersch J., Weisrock D. W., Jacobsen D. Climate change and alpine stream biology: progress, challenges, and opportunities for the future // Biol Rev Camb Philos Soc. 2017. V. 92. № 4. Pp. 2024-2045. doi:10.1111/brv.12319
  • Kumar S., Stecher G., Li M., Knyaz C., and Tamura K. MEGA X: Molecular Evolutionary Genetics Analysis across computing platforms // Molecular Biology and Evolution. 2018. V. 35. Pp. 1547-1549.
  • Li G.H., Jiang W., Hou S. Wang L., Huang H., Ren S., Deng H., Dong. Microbial diversity in two cold springs on the Qinghai-Tibetan Plateau // Geosci. Front. 2012. V. 3. Pp. 317-325. doi:10.1016/j.gsf.2011.12.004.
  • Margesin R., Miteva V Diversity and ecology of psychrophilic microorganisms // Res. Microbiol. 2011. V. 162, № 3. Pp. 346-361. doi:10.1016/j.resmic.2010.12.004
  • Martin A., McMinn A. Sea ice, extremophiles and life on extra-terrestrial ocean worlds // Int. J. Astrobiol. 2018. V 17, № 1. Pp. 1-16.
  • Perreault N. N., Andersen D. T., Pollard W. H., Greer C. W., Whyte L. G. Characterization of the prokaryotic diversity in cold saline perennial springs of the Canadian high Arctic // Applied and environmental microbiology. 2007. V. 73, № 5. Pp. 1532-1543. doi.org/10.1128/ AEM.01729-06
  • Perreault N. N., Greer C. W., Andersen D. T., Tille S., Lacrampe-Couloume G., Lollar B. Sh., Whyte, L. G. Heterotrophic and Autotrophic Microbial Populations in Cold Perennial Springs of the High Arctic // Applied and Environmental Microbiology. 2008. V. 74. Pp. 68986907. doi:10.1128/AEM.00359-08
  • Rudolph C, Wanner G, Huber R. Natural communities of novel archaea and bacteria growing in cold sulfurous springs with a string-of-pearls-like morphology // Applied and Environmental Microbiology. 2001 V. 67, №. 5. Pp. 2336-2344. doi:10.1128/aem.67.5.2336-2344.2001.
  • Saitou N. and Nei M. The neighbor-joining method: A new method for reconstructing phylogenetic trees // Molecular Biology and Evolution. 1987. V. 4. Pp. 406-425.
  • Shivaji S. Ray, M. K., Kumar, G. S., Reddy G. S. N., Saisree L., Wynn-Williams D. D. Identification of Janthinobacterium lividum from the soils of the islands of Scotia Ridge and from Antarctic peninsula // Polar biology. 1991. V. 11, № 4. Pp. 267-271.
  • Schloss P. D., Allen H. K., Klimowicz A. K., Mlot C., Gross J.A., Savengsuksa S., McEllin J., Clardy J., Ruess R. W., Handelsman J. Psychrotrophic strain of Janthinobacterium lividum from a cold Alaskan soil produces prodigiosin // DNA and cell biology. 2010. V. 29. №. 9. Pp. 533-541.
  • Tamura K., Nei M., and Kumar S. Prospects for inferring very large phylogenies by using the neighbor-joining method // Proceedings of the National Academy of Sciences (USA). 2004. V. 101. Pp. 11030-11035.
Еще
Статья научная
QR-код для установки приложения SciUp Наведите камеру и скачайте бесплатное приложение SciUp