Разложение моно- и полиароматических соединений новым грамположительным бактериальным штаммом

Автор: Егорова Д.О., Шумкова Е.С., Плотникова Е.Г.

Журнал: Вестник Пермского университета. Серия: Биология @vestnik-psu-bio

Рубрика: Микробиология

Статья в выпуске: 10, 2009 года.

Бесплатный доступ

Из почв, подверженных интенсивному техногенному воздействию, выделен грамположительный бактериальный штамм-деструктор. Штамм идентифицирован как Rhodococcus sp. В7а. Установлено, что штамм утилизирует ряд замещенных и незамещенных моно- и полиароматических углеводородов, использует в качестве ростового субстрата 2- и 4-хлорбензойные кислоты, осуществляет разложение 4-хлорбензойной кислоты через стадии образования пара-гидроксибензойной и протокатеховой кислот, проявляет высокую активность к орто- и пара- замещенным моно-, ди- и трихлорированным бифенилам.

Короткий адрес: https://sciup.org/147204472

IDR: 147204472

Список литературы Разложение моно- и полиароматических соединений новым грамположительным бактериальным штаммом

  • Васильева Г.К. Биоремедиация почв и седиментов, загрязненных полихлорированными бифенилами/Г.К. Васильева, Е.П. Стрижакова//Микробиология. 2007. Т. 76, № 6. С. 725-741.
  • Занавескин Л.Н. Полихлорбифенилы: проблемы загрязнения окружающей среды и технологические методы обезвреживания/Л.Н. Занавескин, В.А. Аверьянов//Успехи химии. 1998. Т. 67, № 8.С. 788-800.
  • Методы общей бактериологии/под ред. Ф. Герхардт и др. М.: Мир, 1983. Т. 1, 2, 3.
  • Методы почвенной микробиологии и биохимии: учеб. пособие/под ред. Д.Г. Звягинцева. М.: Изд-во МГУ, 1991. 304 с.
  • Плотникова Е.Г. Характеристика микроорганизмов, выделенных из техногенных почв Прикамья/Е.Г. Плотникова, Д.О. Рыбкина, Л.Н. Ананьина и др.//Экология. 2006. № 4. С. 261-268.
  • Рыбкина Д.О. Исследование аэробных бактерий, разлагающих полихлорированные бифенилы и хлорбензойные кислоты: дис. на соиск. учен. степ. к. б. н./Д.О. Рыбкина. Пермь, 2003. 181 с.
  • Рыбкина Д.О. Новый аэробный грамположительный микроорганизм с уникальными свойствами деструкции орто-и пара-хлорированных бифенилов/Д.О. Рыбкина, Е.Г. Плотникова, Л.В. Дорофеева и др.//Микробиология. 2003. Т. 72, №. 6. С. 759-765.
  • Хоменков В.Г. Организация метаболических путей и молекулярно-генетические механизмы биодеградации ксенобиотиков у микроорганизмов/В.Г. Хоменков, А.Б. Шевелев, В.Г. Жуков и др.//Прикладная биохимия и микробиология. 2008. Т. 44, № 2. С. 133-152.
  • Шумкова Е.С. Изучение генов, контролирующих реакцию дегалогенирования, бактерий-деструкторов 4-хлорбензоата/Е.С. Шумкова, И.В. Лобова, Л.Н. Ананьина, Е.Г. Плотникова//Вестник Перм. ун-та. 2007. Вып. 5. Биология. С. 117-122.
  • Adebusoye A.S. Cometabolic degradation of polychlorinated biphenyls (PCBs) by axenic cultures of Ralstonia sp. strain SA-5 and Pseudomonas sp. strain SA-6 obtained from Nigerian contaminated soils/A.S. Adebusoye, M.O. Ilory, F.W. Picardal, O.O. Amund//World J. Microbiol. Biotechnol. 2008. Vol. 24. P. 61-68.
  • Adebusoye A.S. Growth on dichlorobipnenyls with chlorine substitution on each ring by bacteria isolated from contaminated African soils/A.S. Adebusoye, F.W. Picardal, M.O. Ilory et al.//Appl. Microbial. Biotechnol. 2007. Vol. 74. P. 484-492.
  • Arensdorf J.J. Formation of chlorocatechol meta cleavage products by a pseudomonad during metabolism of monochlorobiphenyls/J.J. Arensdorf, D.D. Focht//Appl. Environ. Microbiol. 1994. Vol. 60. P. 2884-2889.
  • Ausbel F. M. Short protocols in molecular biology/F. M. Ausbel, R. Brent, R.E. Kingston et al. 1995. 450 p.
  • Bedard D.L. Influence of chlorine substitution pattern on the degradation of polychlorinated biphenyls by eight bacterial strains/D.L. Bedard, M.L. Habel//Microbial Ecology. 1990. Vol. 20. P. 87-102.
  • Billingsley K.A. Studies on the transformation of selected polychlorinated biphenyl congeners by Pseudomonas strain LB400/K.A. Billingsley, S.M. Backus, O.P. Ward//Can. J. Microbiol. 1997. Vol. 43. P. 782-788.
  • Chemical Methods in Bacterial Systematic. M. Goodfellow & D.E.). London: Academic Press. 1985. 412 p.
  • Evtushenko L. I. Leifsonia poae gen. nov., sp. nov., isolated from nematode galls on Poa annua and reclassification of "Corynebacterium aquaticum" Leifson 1962 as Leifsonia aquatica (ex Leifson 1962) gen. nov., nom. rev., comb. nov. and Clavibacter xyli Davis et al. 1984 with two subspecies as Leifsonia xyli (Davis et al. 1984) gen. nov., comb. nov./L. I. Evtushenko, L. V. Dorofeeva, S. A. Subbotin et al.//Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2000. Vol. 50. P. 371-380.
  • Kim S. Microbial growth on dichlorobiphenyls chlorinated on both rings as a sole carbon and energy suorse/S. Kim, F.W. Picardal//Appl. Environ. Microbiol. 2001. Vol. 64. P. 1953-1955.
  • Pieper D.H. Aerobic degradation of polychlorinated biphenyls//Appl. Microbiol. Biotechnol. 2005. Vol. 67. P. 170-191.
  • Schmitz A. Cloning and sequence analysis of genes for dehalogenation of 4-chlorobenzoate from Arthrobacter sp. strain SU/A. Schmitz, K.-N. Gartemann, J. Fielder et al.//Appl. Environ. Microbiol. 1992. Vol. 58. P. 4068-4071
  • Seeger M. Regiospecificity of dioxygenation of dito pentachlorobiphenyls and their degradation to chlorobenzoates by the bph-encoded catabolic pathway of Burkcholderia sp. Strain LB400/M. Seeger, M. Zielinski, K.N. Timmis, B. Hofer//Appl. Environ. Microbiol. 1999. Vol. 65. P. 3614-3621.
  • Suenaga H. Alteration of regiospecificity in biphenyl dioxygenase by active-site engineering/H. Suenaga, T. Watanabe, M. Sato et al.//J. Bacteriol. 2002. Vol. 184. P. 3682-3688.
  • Thompson J.D. CLUSTAL W: improving the sensitivity of progressive multiple sequence alignment son/D.G. Higgins, T.J. Gibson//Nucleic. Acids. Res. 1994. Vol. 22. P. 4673-4680.
  • Tiirola M.A. Isolation and characterization of Novosphingobium sp. Strain MT1, a dominant polychlorophenol-dagrading strain in a groundwater bioremediation system/M.A. Tiirola, M.K. Mannisto, J.A. Puhakka et al.//Appl. Environ. Microbiol. 2002. Vol. 68. P. 173-180.
  • Tsoi T.V. Cloning and expression of the Arthrobacter globiformis KZT1 fcbA gene encoding dehalogenase (4-chlorobenzoate-4-hydrolase) in Escherichia coli/T.V. Tsoi, G.M. Zaitsev, E.G. Plotnikova et al./FEMS Microbiol.Lett. 1991. Vol. 65. P. 165-169.
  • Unterman R. A history of PCB biodegradation//Bioremediation. Principles and Applications/Eds. Crawford R.L., Crawford D.L. Cambridge Univarsity Press: Nyw York. 1996. P. 209-253.
  • Van de Peer Y. TREECON for Windows a software package for the construction and drawing of evolutionary trees for the Microsoft Windows environment/Y. van de Peer, R. DeWachter//Comput. Appl. Biosci. 1994. Vol. 10. P. 569-570.
  • Witzig R. Assessment of toluene/biphenyl dioxygenase gene diversity in benzene-polluted soils: links between benzene biodegradation and genes similar to those encoding isopropyibenzene dioxygenases/R. Witzig, H. Junca, H.-J. Hecht, D.H. Pieper//Appl. Environ. Microbiol. 2006. Vol. 72, № 5. P. 3504-3514.
  • Zaitsev G.M. Genetic control of degradation of chlorinated benzoic acids in Arthrobacter globiformis, Corynebacterium sepedonicum and Pseudomonas cepacia strains/G.M. Zaitsev, T.V. Tsoi, V.G. Grischenkov et al.//FEMS Microbiol. Lett. 1991. Vol. 81. P. 171-176.
Еще
Статья научная