Разработка ПЦР-тест системы для выявления вируса картофеля Y
Автор: Бессолицына Е.А., Тулинов А.Г., Новоселова Н.В., Харина А.В.
Журнал: Известия Коми научного центра УрО РАН @izvestia-komisc
Рубрика: Растениеводство
Статья в выпуске: 7 (65), 2023 года.
Бесплатный доступ
Вирус картофеля Y поражает растения картофеля, нанося серьезный урон сельскому хозяйству за счет снижения урожайности данной культуры. Поэтому существует необходимость выявления данного возбудителя. Вирусы картофеля РНК-содержащие, поэтому могут быть использованы иммунологические методы или ПЦР, совмещенный с обратной транскрипцией. В ходе данной работы была разработана основа для ПЦР-тест системы для выявления вируса картофеля Y. Подобраны праймеры для реакции обратной транскрипции и последующей ПЦР, рассчитаны температуры отжига и размер амплифицируемого фрагмента. Проверены праймеры и условия реакции на растительном материале. Получены ПЦР-продукты рассчитанного размера. Определение их нуклеотидной последовательности подтвердило выявление генетического материала вируса картофеля Y. Таким образом, данная ПЦР-тест система может быть использована для выявления вируса картофеля Y.
Картофель, диагностика заболеваний, вирус y, праймеры, пцр-диагностика, пцр-тест система, обратная транскрипция
Короткий адрес: https://sciup.org/149144400
IDR: 149144400 | DOI: 10.19110/1994-5655-2023-7-5-11
Список литературы Разработка ПЦР-тест системы для выявления вируса картофеля Y
- Kreuze, J. F. Viral diseases in potato / J. F. Kreuze, J. A. C. Souza-Dias, A. Jeevalatha, A. R. Figueira, J. P. T. Valkonen, R. A. C. Jones // The Potato Crop. – Cham: Springer, 2020. – P. 389–429.
- Рогозина, Е. В. Широко распространенные и потенциально опасные для Российского агропроизводства возбудители вирусных болезней картофеля / Е. В. Рогозина, Н. В. Мироненко, О. С. Афанасенко, Ю. Мацухито // Вестник защиты растений. – 2016. – № 4 (90). – С. 24–33.
- Kerlan, C. Potato virus Y. – URL: https://dpvweb.net/dpv/showdpv/?dpvno=414.
- Lacomme, C. General characteristics of potato virus Y (PVY) and its impact on potato production: an overview / C. Lacomme, L. Glais, D. Bellstedt, B. Dupuis, A. Karasev, E. Jacquot // Potato virus Y: biodiversity, pathogenicity, epidemiology and management. – Cham: Springer, 2017. – P. 1–19.
- Baunoch, D.A. Potato virus Y helper component is associated with amorphous inclusions / D.A. Baunoch, P. Das, V. Hari // Journal of General Virology. – 1990. – Vol. 71(10). – P. 2479–2482. doi:10.1099/0022-1317-71-10-2479.
- Chung, Betty Y.-W. An overlapping essential gene in the Potyviridae / Betty Y.-W. Chung, W. Allen Miller, John F. Atkins, Andrew E. Firth // PNAS. – 2008. – Vol. 105(15). – P. 5897–5902. doi:10.1073/pnas.0800468105.
- Kneller, E.L. Cap-independent translation of plant viral RNAs / E.L. Kneller, A.M. Rakotondrafara, W.A. Miller // Virus Research. – 2006. – Vol. 119(1). – P. 63–75. doi: 10.1016/j.virusres.2005.10.010.
- Сухорученко, Г. И. Система интегрированной защиты репродукционного семенного картофеля от комплекса вредных организмов в Северо-Западном регионе Российской Федерации / Г. И. Сухорученко, Г. П. Иванова, С. А. Волгарев. – Санкт-Петербург: Пушкин, 2016. – 64 с.
- Galvino-Costa, S. B. F. Molecular and serological typing of potato virus Y isolates from Brazil reveals a diverse set of recombinant strains / S. B. F. Galvino-Costa, A. R. Figueira, F. A. C. Rabelo-Filho, F. H. R. Moraes, O. V. Nikolaeva, A. V. Karasev // Plant Disease. – 2012. – Vol. 96(10). – P. 1451–1458. doi: 10.1094/PDIS-02-12-0163-RE.
- Onozuka, N. One-step real-time multiplex reverse transcription- polymerase chain reaction assay with melt curve analysis for detection of potato leafroll virus, potato virus S, potato virus X, and potato virus Y / N. Onozuka, T. Ohki, N. Oka, T. Maoka // Virology Journal. – 2021. – Vol. 18. – № 131. doi: 10.1186/s12985-021-01591-3.
- Sambrook, J. Molecular cloning: a laboratory manual / J. Sambrook, T. Fritch, T. Maniatis. – New York: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989. – 1659 p.
