Разработка удобной процедуры синтеза циклических непептидных аналогов ингибитора ВИЧ-1 протеазы и моделирование их свойств

Автор: Винюков А.В., Стариков А.С.

Журнал: Международный журнал гуманитарных и естественных наук @intjournal

Рубрика: Химические науки

Статья в выпуске: 4-2 (43), 2020 года.

Бесплатный доступ

Разработка методик получения новых физиологически активных веществ является одним из самых важных направлений для современной органической химии. Бис(α-аминоалкил) фосфиновые кислоты симметричного строения, как известно, являются эффективными ингибиторами ВИЧ-1 протеазы, а также промежуточными продуктами для получения ряда непептидных аналогов ингибитора ВИЧ-1 протеазы циклического строения. Ранее нами был описан ряд процедур синтеза N-защищенных бис(α-аминоалкил) фосфиновых кислот путем двойного амидоалкилирования гидрофосфорильных соединений. Кроме того, циклизация свободных бис(α-аминоалкил) фосфиновых кислот позволила нам получить ряд непептидных циклических аналогов ингибитора ВИЧ-1 протеазы. Настоящая работа посвящена использованию бис(α-аминоалкил)фосфиновых кислот как «строительные блоки» в комбинации со «структурным имитатором воды» для образования мощных непептидных ингибиторов протеазы ВИЧ. Кроме того, нами был проведен предсказательный анализ полученных веществ на предмет физиологической активности и токсичности.

Еще

Ингибиторы вич-1 протеазы, амидоалкилирование гидрофосфорильных соединений, фосфиновые кислоты, двойное амаидоалкилирование, непептидные аналоги ингибитора вич-1 протеазы

Короткий адрес: https://sciup.org/170187555

IDR: 170187555   |   DOI: 10.24411/2500-1000-2020-10349

Текст научной статьи Разработка удобной процедуры синтеза циклических непептидных аналогов ингибитора ВИЧ-1 протеазы и моделирование их свойств

На данный момент известно целый ряд известных ингибиторов ВИЧ-1 протеазы (индинавир, саквинавир), используемых при терапии ВИЧ. И все они обладают побочными эффектами и подходят далеко не во всех случаях. Механизм их действия заключается во встраивании в активный участок фермента, препятствуя тем самым расщеплению полипротеина Gag-Pol на отдельные белки и последующему созреванию вирусных частиц, которые становятся не способными заражать новые клетки. Ранее было обнаружено, что фос- финовые кислотные изостеры гексапептидов являются мощными ингибиторами протеазы ВИЧ [1-4].

Существует достаточное количество методов получения симметричных бис(а-аминоалкил)фосфиновых кислот [5-7]. Ранее нами была предложена трехкомпонентная процедура амидоалкилирования гипофосфористой кислоты с получением N-защищенных бис(а-аминоалкил)фосфиновых кислот симметричного строения (рис. 1) [8-9].

OH

HPH

O

1 equiv

H

2 equiv

2 equiv

  • 1.    TSA

  • 2.    H2O

Ac 2 O

R= Me, Et, i-Pr, i-Bu, sec-Bu, Ph Alk = Me, Et, Bn

Рис. 1. Трехкомпонентное «двойное» амидоалкилирование гипофосфористой кислоты

Кроме того, при использовании в качестве исходного реагента алкилиденби-скарбаматов в двухкомпонентной реакции амидоалкилирования гипофосфористой кислоты с последующей обработкой реак- ционной смеси соответствющим спиртом, удалось получить P, N-защищенные бис(α-аминоалкил)фосфиновые кислоты симметричного строения (рис. 2) [9].

OH

HPH

O

1 equiv

Alk          NH

  • 1.    TSA

  • 2.    EtOH

Ac 2 O

R= Me, Et, i-Pr, i-Bu, sec-Bu, Ph Alk = Me, Et, Bn

Рис. 2. Двухкомпонентное «двойное» амидоалкилирование гипофосфористой кислоты

В настоящей работе полученные и описанные ранее метиловые эфиры бис(α-амино)фосфиновых кислот 1 подвергали взаимодействию с карбонилдиимидазолом с получением циклических мочевин 2 I (рис. 3), затем N-алкилировали в присутствии NaH в среде ДМСО II. Далее эфир фосфиновой кислоты расщепляется с помощью HBr в уксусной кислоте с получением свободных кислот 4 III (рис. 3). Для синтеза N-(4-гидроксиметил) бензилзаме-щенных соединений 3 проводили алкилирование в присутствии 4-(4-метоксифеноксиметил) бензилбромида II. Бензиловый эфир 3 также разрушался при обработке HBr III, поэтому полученный бромид был превращен в соответствующий гидроксид 5 путем обработки CaCO3 в смеси диоксан/вода IV (рис. 3).

Далее нами был проведено прогнозирование биологической активности полученных циклических аналогов ингибитора ВИЧ-1 протеазы 5 (рис. 3) программой

PASS (“Prediction of Activity Spectra for Substances”), разработанной в Институте биомедицинской химии им. В.Н. Орехови-ча РАМН (табл. 1). Результаты прогноза биологической активности представлены в виде спектра биологической активности, включающих список активностей и вероятностей: Ра - «быть активным», Рi -«быть неактивным. В качестве контрольного вещества выступили бензил-замещенные молекулы (R = CH2Ph), которые были ранее синтезированы, испытаны и показали антивирусную активность. Было обнаружено, что в ряде полученных циклических аналогов ингибитора ВИЧ-1 протеазы у большинства полученных соединений присутствует достаточно большая вероятность проявить ВИЧ-антивирусную активность. Что в свою очередь делает их перспективными для дальнейших исследований их реальной физиологической активности.

Рис. 3. Получение фосфиновых циклических непептидных аналогов ингибиторов ВИЧ-1 протеазы

Таблица 1. Прогнозирование биологической активности полученных циклических аналогов ингибитора ВИЧ-1 протеазы программой PASS

R

Pa(Antiviral HIV)

Pi(Antiviral HIV)

Bn

0.957

0.002

Me

0.843

0.003

Et

0.838

0.003

i-Pr

0.812

0.003

sec-Bu

0.781

0.003

Ph

-

-

Bспользование программы  GUSAR

(«General Unrestricted Structure-Activity Re- lationships») дало возможность оценить уровень острой токсичности для крыс

(LD50 мг/кг) полученных соединений. Для оценки острой токсичности для описания структур химических соединений в программе используются дескрипторы многоуровневых атомных окрестностей (MNA – Multilevel Neighborhoods of Atoms) и количественных атомных окрестностей (QNA – Quantitative Neighborhoods of Atoms). В GUSAR для построения моделей используется алгоритм самосогласованной регрессии (SCR). Так как большая часть перпаратов против ВИЧ принимаются перорально, то в качестве критерия будут рас- сматриваться только пероральная и внутривенная острые токсичности (рис. 4).

Согласно классификации острой токсичности Организации экономического сотрудничества и развития (OECD) все соединения являются малотоксичными (5 и 4 классом токсичности), за исключением контрольного бензил-замещенного, который обладает 3 классом токсичности. Что в свою очередь также указывает на перспективность дальнейших исследований полученных соединений на предмет их непосредственного применения при терапии ВИЧ.

oral, logLD50(mmol/kg)

oral, logLD50(mmol/kg)

Рис. 4. Уровени острой токсичности при пероральном введении для крыс (LD50 ммоль/кг)

полученных соединений

Таким образом, важным результатом данного является получение ряда новых ранее неописанных фосфиновых соединений циклической структуры, являющихся структурными аналогами ингибитора ВИЧ-1 протеазы. Кроме того, моделирование физиологической активности позволи- ло сделать вывод об перспективности дальнейшего изучения полученных веществ. Данные и результаты, полученные в ходе настоящего исследования, могут быть использованы в изучении и терапии ВИЧ.

Список литературы Разработка удобной процедуры синтеза циклических непептидных аналогов ингибитора ВИЧ-1 протеазы и моделирование их свойств

  • D. Grobelny, E.M. Wondrak, R.E. Galardy, S. Oroszlan, B&hem. Biophys. Res. Commun. 169 (1990) 1111.
  • K.-H. Budt, A. Peyman, EP 0435059,199O; K.-H. Budt, J. Knolle, C. Meichsner. D. Ruppert, B. Stowasser, I. Winkler, A. Paessens, J. Hansen, EP 0428849A2 1990.
  • J. Erickson, D.J. Neidhart, J. VanDrie, D.J. Kempf. X.C. Wang, D.W. Norbeck, J.J. Plattner, J.W. Rittenhouse, M. Turon, N. Wideburg, W. E. Kohlbrenner, R. Simmer, R. Helfrich, D.A. Paul Knigge, Science 249 (1990) 527.
  • D.J. Kempf, D.W. Norbeck, L. Codacovi, X.C. Wang, W.E. Kohlbrenner, N.E. Wideburg, D.A. Paul, M.F. Knigge, S. Vasavonda, A. Craig-Kennard, A. Saldivar, W. Rosenbxocok Jr., J.J. Peyman, A. C2-symmetric phosphinic acid inhibitors of HIV protease / A. Peyman, K.-H. Budt, J. Spanig, B.Stowasser, D. Ruppert // Tetrahedron Lett. - 1992, -33, - 4549.
  • Maier, L. Organic phosphorus compounds: LXXI. Preparation, properties, and structure of bis(aminomethyl)phosphinic acid, (H2NCH2)2P(O)OH / L. Maier // Journal of Organometallic Chemistry. -1979, -V. 178, -P. 157-169.
  • Peyman, A. Inhibition of human immunodeficiency virus-1 protease by a C2-symmetrical phosphinic acid amide / A. Peyman, K. Wagner, K-H. Budt, J. Spanig, D. Ruppert, C. Meichsner, A. Paessens // Bioorg. Med. Chem. Lett. - 1994, - 4, - 1191.
  • Tyka, R. Synthese symmetrischer und asymmetrischer a,a'-bis(aminoalkyl)phosphinsauren des typs NH2CHR1(NH2CHR2)P(O)OH(R1 = Ph; R2 = Ph, Me) / R. Tyka, G. Hagales, R. Boetzel // Phosphorus, Sulfur, and Silicon. -1991. -Vol. 62. -Р.75-81.
  • Vinyukov A.V. An efficient one-pot synthesis of bis(a-aminoalkyl)phosphinic acids, phosphorus-isosteric analogues of HIV protease inhibitors / A.V. Vinyukov, A.V. Borodachev, A.S. Starikov, A.V. Afanasyev, M.E. Dmitriev, B.V. Lednev, V.V. Ragulin // Mendeleev Commun. -2018, -V.28, -P. 1-2.
  • Винюков А.В. Получение непептидных аналогов ингибитора вич-1 протеазы и моделирование их физиологической активности / А.В. Винюков, А.С. Стариков // Химия, физика, биология, математика: теоретические и прикладные исследования: сб. ст. по материалам XXXIII Международной научно-практической конференции "Химия, физика, биология, математика: теоретические и прикладные исследования". - № 2 (23). - М., Изд. "Интернаука", 2020.
Еще
Статья научная