Сетевой биоинформатический анализ белковых взаимодействий опухолевого супрессора p53 у человека

Бесплатный доступ

Белок-супрессор опухолей p53 является центральным регулятором контроля клеточного цикла, ответа на повреждения ДНК, апоптоза и сенесценции. Благодаря своей многофункциональности p53 взаимодействует с широким спектром клеточных белков, формируя сложные регуляторные сети. В данной работе применён биоинформатический подход для реконструкции и анализа сети белок-белковых взаимодействий TP53 у человека с использованием общедоступных баз данных, а также данных литературы. В исследовании определены ключевые партнёры p53, включая MDM2, EP300, ATM, CHEK2 и BRCA1, образующие узловые элементы путей репарации ДНК, регуляции контрольных точек клеточного цикла и ответа на стресс. Сетевой анализ показал высокую степень связности и центральность TP53, что подчёркивает его роль как глобального хаба в регуляторных контурах клетки. Функциональное обогащение подтвердило сильную ассоциацию сети взаимодействий TP53 с биологическими процессами «ответ на повреждения ДНК», «сигнальный путь апоптоза» и «регуляция клеточного цикла». Результаты демонстрируют, что сетевой биоинформатический подход позволяет глубже понять системную роль TP53 и создать основу для дальнейших исследований мутаций, связанных с онкологическими заболеваниями, а также для разработки терапевтических стратегий.

Еще

Белок-белковые взаимодействия, биоинформатика, клеточный цикл, регуляторные сети

Короткий адрес: https://sciup.org/170212212

IDR: 170212212   |   DOI: 10.24412/2500-1000-2025-10-1-7-12

Network bioinformatic analysis of protein-protein interactions of the tumor suppressor p53 in humans

The tumor suppressor protein p53 is a central regulator of cell cycle control, DNA damage response, apoptosis, and senescence. Due to its multifunctionality, p53 interacts with a wide range of cellular proteins, forming complex regulatory networks. In this work, a bioinformatic approach was applied to reconstruct and analyze the protein-protein interaction (PPI) network of TP53 in humans using publicly available databases as well as literature data. The study identified key p53 partners, including MDM2, EP300, ATM, CHEK2, and BRCA1, which form nodal elements of pathways involved in DNA repair, cell cycle checkpoint regulation, and stress response. Network analysis revealed a high degree of connectivity and centrality of TP53, highlighting its role as a global hub in cellular regulatory circuits. Functional enrichment confirmed a strong association of the TP53 interaction network with biological processes such as “DNA damage response”, “apoptotic signaling pathway”, and “cell cycle regulation”. The results demonstrate that a network bioinformatic approach provides deeper insight into the systemic role of TP53 and establishes a foundation for further studies of mutations associated with cancer, as well as for the development of therapeutic strategies.

Еще