Сравнение молекулярных классификаций увеальной меланомы

Автор: Яровой А.А., Яровая В.А., Чудакова Л.В., Чочаева A.M., Логинов Р.А., Клеянкина С.С., Зарецкий А.Р.

Журнал: Саратовский научно-медицинский журнал @ssmj

Рубрика: Дерматовенерология

Статья в выпуске: 4 т.14, 2018 года.

Бесплатный доступ

Цель: провести комплексный анализ увеальной меланомы (УМ) со сравнением цитогенетической и мутационной классификаций. Материал и методы. За период с 2016 по 2018 г. генетический анализ УМ выполнен у 154 пациентов как при проведении органосохраняющего лечения (п=100), так и при энуклеации (п=54). Выполнен анализ моносомии хромосомы 3, уровень экспрессии белка ВАР1, мутации в генах GNAQ, GNA11, EIF1AX, SF3B1 и TERT в ДНК, определяли амплификацию гена МУС и делецию гена PPARG. В группе из 66 пациентов проведен анализ соотношения молекулярно-генетической и цитогенетической классификации. Результаты. Совпадение двух классификаций зафиксировано лишь в 21 % случаев. Кроме того, выявлены сочетания нарушений, считающиеся взаимоисключающими. Заключение. Прогностическое значение несовпадения двух классификаций и сочетание взаимоисключающих нарушений в настоящее время неизвестно. Для выяснения прогностической роли выявленных феноменов необходимы последующие исследования.

Еще

Генетические тесты, мутации, прогностическая биопсия, тонкоигольная аспирационная биопсия, увеальная меланома

Короткий адрес: https://sciup.org/149135220

IDR: 149135220

Текст научной статьи Сравнение молекулярных классификаций увеальной меланомы

1Введение. Увеальная меланома (УМ) — наиболее часто встречающаяся внутриглазная злокачественная опухоль у взрослых.

Риск развития метастазов при увеальной меланоме (УМ) вне зависимости от метода лечения составляет 30-50% в течение 10 лет [1-3]. При появлении метастазов УМ остается инкурабельным заболеванием: лишь 15% пациентов переживают период в 1 год [1, 2]. В связи с этим наиболее актуальным направлением в изучении УМ является поиск методов раннего выявления небольших метастатических очагов и разработка эффективной адъювантной терапии, для чего требуется поиск пациентов с высоким риском развития метастатической болезни.

В последнее десятилетие основным фактором риска развития метастатической болезни при УМ признан генетический, основанный на анализе молекулярных нарушений в ткани опухоли [4, 5].

Существование трех классификаций определения риска развития метастатической болезни (цито-

генетическая [6, 7], молекулярно-генетическая (мутационная) [8, 9] и экспрессионная [10, 11] (таблица)) было доказано различными авторами в независимых исследованиях [12]. Выделяют «хороший», «средний», «плохой» и «очень плохой» прогноз при УМ на основании выявляемых нарушений [5]. Однако маркеры молекулярных классов известных классификаций существенно отличаются, что обусловливает необходимость сравнения прогностической ценности различных молекулярных классификаций УМ. По данным литературы, сравнение цитогенетической и молекулярно-генетической классификаций не проводилось.

Цель: провести комплексный анализ увеальной меланомы со сравнением цитогенетической и мутационной классификаций.

Материал и методы. За период с 2016 по 2018 г. у 154 пациентов осуществлен генетический анализ УМ при проведении энуклеации (n=54), а также при проведении органосохраняющего лечения (n=100). При органосохраняющем лечении у 83 пациентов материал опухоли получали методом тонкоигольной аспирационной биопсии (ТИАБ) перед брахитерапи-

Основные молекулярные классы увеальной меланомы и их прогностическая значимость

Метод

Маркеры молекулярных классов при увеальной меланоме

Тип I: благоприятный прогноз

Тип II: неблагоприятный прогноз

Класс 1 [IA]: «хороший» прогноз

Класс 2 [IB]: «средний» прогноз

Класс 3 [IIA]: «плохой» прогноз

Класс 4 [IIB]: «очень плохой» прогноз

Цито-генетический

Дисомия по хромосоме 3

Потеря хромосомы 3

Дисомия по хромосоме 8

Аберрации хромосомы 8 (8q↑ ± 8p↓)

Дисомия по хромосоме 8

Аберрации хромосомы 8 (8q↑ ± 8p↓)

Мутационный

Отсутствие инактивации гена BAP1

Инактивация гена BAP1

Мутации в гене EIF1AX

Мутации в гене SF3B1 или SRSF2

Мутации в гене SF3B1 или SRSF2

Экспрессионный

Экспрессионный тип 1

Экспрессионный тип 2

Отсутствие экспрессии гена PRAME

Экспрессия гена PRAME

Отсутствие экспрессии гена PRAME

Экспрессия гена PRAME

П р и м е ч а н и е : 8q↑ — увеличение количества копий длинного плеча хромосомы 8 (8q), 8p↓ — уменьшение количества копий короткого плеча хромосомы 8 (8p); экспрессионные типы 1 и 2 — многокомпонентные маркеры: принадлежность образца УМ к одному из них определяется по специальному алгоритму с использованием данных об уровне экспрессии мРНК 15 генов в опухолевых клетках.

ей (БТ), у 2 пациентов — перед стереотаксическим облучением на установке «Гамма-нож». Эндорезекция опухоли выполнена у 12 пациентов, блокэксци-зия у трех. Средний возраст пациентов составил 53,6 года. Мужчин было 52 (44%), женщин 102 (66%). Средняя высота опухоли составила 7,5±2,4 мм (от 1,4 до 19,5 мм), протяженность 13,2±3,2 мм (от 2,1 до 20,6 мм). ТИАБ выполняли по ранее описанной методике [13]: опухоли преэкваториальной локализации пунктировали транссклерально короткой иглой 30G, трансвитеральный доступ через pars plana с применением длинной иглы 25G или 27G использовали при постэкваториальном расположении опухолей. Предложенные тонкостенные иглы позволяли получать увеличенный объем опухолевого материала, достаточный для проведения всех необходимых исследований. После хирургического удаления опухоли использовали парафиновые блоки с фиксированной формалином опухолевой тканью.

Цитогенетическая классификация основывалась на тестировании образцов на потерю одной из копий хромосомы 3 и увеличение количества копий длинного плеча хромосомы 8 с определением методом FISH амплификации региона 8q24.21 (MYC) и деле-ции региона 3p25.2 (PPARG).

Для построения молекулярно-генетической классификации исследуемые образцы тестировали на мутации в «горячих точках» генов EIF1AX (экзоны 1 и 2) и SF3B1 (экзон 14) и на инактивацию гена BAP1. Анализ мутаций в генах GNAQ (экзон 5), GNA11 (экзон 5), EIF1AX (экзоны 1, 2 и 6), SF3B1 (экзоны 14 и 15) и TERT (промоторная область) в ДНК проводили методом ПЦР с последующим секвенированием продуктов ПЦР. Иммуноцитохимическим или иммуногистохимическим методом оценивали уровень экспрессии белка BAP1.

Результаты. Сравнение молекулярно-генетической и цитогенетической классификаций проведено в группе из 66 образцов. Совпадение молекулярногенетического и цитогенетического профиля выявлено лишь в 14 (21 %) случаях. Еще в 9 (14%) случаях цитогенетическая классификация «ухудшила» прогноз относительно молекулярно-генетической, в 8 (12%) случаях, наоборот, прогноз «ухудшила» мо- лекулярно-генетическая классификация. Кроме того, 32 (48%) случая по молекулярно-генетической классификации отнесены к классу 0: не имеет прогностической интерпретации в настоящее время. Проведенное исследование выявило в 5 случаях феномен одновременного сочетания мутаций в гене EIF1AX с моносомией 3 (n=3) или с инактивацией гена BAP1 (n=2), которые считаются взаимоисключающими. Еще в одном случае отмечено одновременное сочетание мутации гена EIF1AX, инактивации гена ВАР1 и моносомии 3.

Oбсуждение. Выявленное в нашем исследовании несовпадение цитогенетической и молекулярно-генетической классификаций и существование нестандартных мутационных профилей требует дальнейшего изучения и интерпретации, в том числе с определением их прогностических значений. В работе M.A. Klufas et al. (2017) [14] продемонстрированы данные о существенном проценте расхождений между цитогенетической и экспрессионной классификациями УМ, но также без оценки прогностической значимости этих расхождений [15]. Для выяснения природы выявленных различий и их прогностической роли необходимы дальнейшие исследования.

Выводы:

  • 1.    Объем тканевого материала УМ, получаемого при ТИАБ при проведении органосохраняющего лечения, позволяет выполнять полноценное мульти-маркерное лабораторное тестирование.

  • 2.    Впервые проведен сравнительный анализ молекулярно-генетической и цитогенетической классификаций, по результатам которого соответствие между ними выявлено лишь в 21 % случаев.

  • 3.    Обнаружен феномен одновременного сочетания нарушений в опухоли, традиционно считающихся взаимоисключающими, что требует дальнейшего изучения.

Список литературы Сравнение молекулярных классификаций увеальной меланомы

  • Damato BE, Heimann H, Kalirai H, et al. Age, survival predictors, and metastatic death in patients with choroidal melanoma: tentative evidence of a therapeutic effect on survival. JAMA Ophthalmol 2014; 132 (5): 605-13
  • Nathan P, Cohen V, Coupland S, et al. Uveal melanoma UK national guidelines. European Journal of Cancer 2016; 51 (16): 2404-12
  • Yang J, Manson DK, Marr BP, et al. Treatment of uveal melanoma: where are we now. Ther Adv Med Oncol 2018; 10: 1758834018757175
  • Яровая В.A., Клеянкина С. С., Голубева О.В., и др. Прогностический молекулярно-генетический "портрет" увеальной меланомы. Современные технологии в офтальмологии 2017; (4): 215-8
  • Amaro A, Gangemi R, Piaggio F, et al. The biology of uveal melanoma. Cancer Metastasis Rev 2017; 36 (1): 109-40
  • Sisley K, Rennie IG, Parsons MA, et al. Abnormalities of chromosomes 3 and 8 in posterior uveal melanoma correlate with prognosis Genes, Chromosomes & Cancer 1997; 19(1): 22-8
  • Van den Bosch T, van Beek JG, Vaarwater J, et al. Higher percentage of FISH-determined monosomy 3 and 8q amplification in uveal melanoma cells relate to poor patient prognosis. Investigative Ophthalmology & Visual Science 2012; 53 (6): 2668-74
  • Martin M, Masshofer L, Temming P, et al. Exome sequencing identifies recurrent somaticmutations in EIF1AX and SF3B1 in uveal melanoma with disomy 3 Nature Genetics 2013; 45 (8): 933-6.
  • Yavuzyigitoglu S, KoopmansAE, Verdijk RM, et al. Uveal melanomas with SF3B1 mutations: a distinct subclass associated with late-onset metastases. Ophthalmology 2016; 123 (5): 1118-28
  • Onken MD, Worley LA, Ehlers JP, et al. Gene expression profiling in uveal melanoma reveals two molecular classes and predicts metastatic death. Cancer Research 2004; 64 (20): 7205-9
  • Onken MD, Worley LA, Char DH, et al. Collaborative Ocular Oncology Group report number 1: prospective validation of a multi-gene prognostic assay in uveal melanoma. Ophthalmology 2012; 119 (8): 1596-603
  • Яровая В. А., Яровой A. A., Клеянкина С. О, и др. Молекулярное тестирование увеальной меланомы: Находки. Современные технологии в офтальмологии 2018; (4): 297-9
  • Яровая В. А., Клеянкина С. О, Яровой А. А., и др. "Прогностическая" биопсия меланомы хориоидеи: техника, морфологическая и молекулярно-генетическая диагностика. Современные технологии в офтальмологии 2017; (1): 375-7
  • Klufas MA, Richter Е, Itty S, et al. Comparison of Gene Expression Profiling and Chromosome 3 Analysis by Fluorescent in situ Hybridization and Multiplex Ligation Probe Amplification in Fine-Needle Aspiration Biopsy Specimens of Uveal Melanoma. Ocul Oncol Pathol 2017; 4 (1): 16-20
  • Bellerive C, Grossniklaus HE, Singh AD. Prognostication for Uveal Melanoma: Are Two Tests Better than One? Ocul Oncol Pathol 2017; 3 (4): 301-3.
Еще
Статья научная