Сравнительная характеристика полиморфизма кластера генов интерлейкина-1 у жителей Северо-Западного региона России



СРАВНИТЕЛЬНАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА ПОЛИМОРФИЗМА КЛАСТЕРА ГЕНОВ ИНТЕРЛЕЙКИНА-1 У ЖИТЕЛЕЙ СЕВЕРОЗАПАДНОГО РЕГИОНА РОССИИ

А.А. Павлова, Ю.В. Соколова, И.Е. Павлова,

Л.Н. Бубнова, С.С. Бессмельцев

РНИИ гематологии и трансфузиологии, г. Санкт-Петербург, Россия

Цитокины – небольшие пептидные информационные молекулы (до 30 КДа), регулирующие межклеточные и межсистемные взаимодействия. Они определяют выживаемость клеток, стимуляцию или подавление их роста, дифференциацию, активность и апоптоз. В настоящее время известно, что гены цитокинов и их рецепторов полиморфны, это в свою очередь, влияет на характер действия иммунной, эндокринной и нервной систем организма в нормальных условиях и в ответ на патологические воздействия. В литературе опубликовано много данных, о том, что патологические отклонения иммунного ответа связаны с нарушением продукции цитокинов, а значительную роль в координации иммунологических реакций отводят интерлейкину-1 (IL-1). В настоящей работе был сделан сравнительный анализ частоты аллельных вариантов генов IL-1 у 40 здоровых лиц (16 мужчин и 24 женщины), проживающих в Северо-Западном регионе России (г. Санкт-Петербург), являющихся донорами крови, считающих себя и своих родителей русскими и не связанных кровным родством и группы лиц южнославянской популяции, проживающих на территориии Македонии (Trajkov et al., 2009).

Исследовался однонуклеотидный полиморфизм (SNP) промоторного региона генов цитокинов и их рецепторов, а именно – IL-1 alpha (-889C/T), IL-1 beta (-511C/T), IL-1 beta (+3962 C/T), IL-1R (pst 1 +1970 C/T), IL-1RA (mspa1 11100 C/T). Геномную ДНК выделяли из ядросодержащих клеток периферической крови с помощью коммерческого набора BOX 500 (Protrans); генотипирование проводили посредством PCR-SSP с использованием коммерческого набора Cytokine genotyping Kit (Invitrogen). Отклонения от распределения закона Харди - Вайнберга были рассчитаны методом хи-квадрат с поправкой Йетса с помощью GraphPad QuickCalcs, значения при p<0,05 считали статистически значимыми. Частота генотипа в обследованной группе лиц, проживающих в Северозападном регионе России (Р), составила: IL-1α-889 0,475(CC); 0,500 (TC); 0,025 (TT); IL-1β-511 0,375 (CC); 0,525 (CT); 0,100 (TT); IL-1β+3962 0,525 (CC); 0,275 (CT); 0,100 (TT); IL-1R pst 1 1970 0,350 (CC); 0,325 (CT); 0,325 (TT); IL-1RA mspa111100 0,225 (CC); 0,500 (CT); 0,275 (TT), в группе македонцев (М) она была - IL-1α-889 0,689 (CC); 0,250 (TC); 0,061 (TT); IL-1β-511 0,475 (CC); 0,392 (CT); 0,133 (TT); IL-1β+3962 0,578 (CC); 0,302 (CT); 0,120 (TT); IL-1R pst 1 1970 0,442 (CC); 0,442 (CT); 0,116 (TT); IL-1RA mspa111100 0,100 (CC); 0,405 (CT); 0,495 (TT), что соответствовало равновесию Харди-Вайнберга. При сравнении частоты аллелей у жителей выбранных регионов, мы не обнаружили существенной разницы, за исключением аллелей IL-1R: аллель С – 0,51 (Р); 0,66 (М) и аллель Т – 0,49 (Р); 0,34 (М) (р <0,05) и аллелей IL-1RA: аллель C- 0,47 (Р); 0,30 (М) и аллель Т – 0,53 (Р) и 0,70 (М) (p<0,05).

Данные о различиях в распределении частот аллелей кластера генов IL-1, полученные нами в этой работе, возможно, отражают этнические различия (генетический фон) между нашими популяциями и могут служить для дальнейших иммуногенетических популяционных исследований.