Сравнительный анализ профилей экспрессии генов опухолевого контроля и микроРНК в опухолевой и перифокальной ткани у пациентов с колоректальным раком

Сравнительный анализ профилей экспрессии генов опухолевого контроля и микроРНК в опухолевой и перифокальной ткани у пациентов с колоректальным раком

Автор: Служев М.И., Зарайский М.И., Семиглазов В.В., Семиглазова Т.Ю., Ткаченко Е.В., Кондратьев С.В., Бриш Н.А., Алексеева Ю.В., Петрик Ю.В., Сидорова А.Н.

Журнал: Сибирский онкологический журнал @siboncoj

Рубрика: Лабораторные и экспериментальные исследования

Статья в выпуске: 2 т.21, 2022 года.

Бесплатный доступ

Введение. В развитии и прогрессировании колоректального рака (КРР) важную роль играют различные гены опухолевого контроля и микроРНК. Экспрессия этих генов может значительно отличаться в опухолевой и перифокальной здоровой ткани. Нет точных данных, на каком расстоянии от опухоли находится перифокальная здоровая ткань с точки зрения экспрессии генов. Цель исследования -изучить профили экспрессии генов опухолевого контроля ( E2F3, TGFB, NFKB, KLF-12, EGFR и MMP9 ), а также экспрессии генов микроРНК ( микроРНК-15, -16, -21 и -210 ) в опухолевой и перифокальной здоровой тканях при КРР. Материал и методы. В исследование были включены 19 пациентов с диагнозом КРР. В рамках постановки диагноза при колоноскопии забирался материал опухолевой и рядом расположенной перифокальной визуально здоровой ткани на расстоянии 1-2 см от края опухоли. В полученном материале исследовали уровни экспрессии генов опухолевого контроля ( E2F3, TGFB, NFKB, KLF-12, EGFR и MMP9 ), а также уровни экспрессии генов микроРНК ( микроРНК-15, -16, -21 и -210 ). Результаты. Было обнаружено снижение уровня экспрессии E2F3 (Медиана 3,73, Q1-Q3 2,64 УЕ против Медиана 6,5, Q1-Q3 6,39 УЕ, p=0,01) и микроРНК-16 (Медиана 2,83, Q1-Q3 4,74 УЕ против Медиана 4,29, Q1-Q3 3,73 УЕ, p=0,027) и повышение уровня экспрессии микроРНК-21 (Медиана 2,64, Q1-Q3 1,38 УЕ против Медиана 1,41, Q1-Q3 1,21 УЕ, p function show_abstract() { $('#abstract1').hide(); $('#abstract2').show(); $('#abstract_expand').hide(); }

Еще

Микрорнк, колоректальный рак, экспрессия генов, e2f3, микрорнк-16, микрорнк-21, перифокальная ткань

Короткий адрес: https://sciup.org/140293899

IDR: 140293899

Список литературы Сравнительный анализ профилей экспрессии генов опухолевого контроля и микроРНК в опухолевой и перифокальной ткани у пациентов с колоректальным раком

  • Каприн А.Д. Клинические рекомендации. Злокачественные новообразования ободочной кишки и ректосигмоидного отдела. Общероссийский национальный союз Ассоциация онкологов России; 2020. [KaprinA.D. Clinical guidelines. Malignant neoplasms of the colon and rectosigmoid region. All-Russian National Union. Association of Oncologists of Russia; 2020. (in Russian)].
  • Каприн А.Д. Клинические рекомендации. Рак прямой кишки. Общероссийский национальный союз Ассоциация онкологов России; 2020. [Kaprin A.D. Clinical guidelines. Rectal cancer. All-Russian National Union Association of Oncologists of Russia; 2020. (in Russian)].
  • Bujko K., Rutkowski A., Chang G.J., Michalski W., Chmielik E., Kusnierz J. Is the 1-cm rule of distal bowel resection margin in rectal cancer based on clinical evidence? A systematic review. Ann Surg Oncol. 2012; 19(3): 801-8. doi: 10.1245/s10434-011-2035-2.
  • Ker C.-G. Surgical safety margin of gastroenterological cancer surgery: A truth or a dream? Formosan J Sur. 2014; 47(3): 83-9.
  • AranD., CamardaR., OdegaardJ., PaikH., OskotskyB., Krings G., Goga A., Sirota M., Butte A.J. Comprehensive analysis of normal adjacent to tumor transcriptomes. Nat Commun. 2017; 8(1): 1077. doi: 10.1038/ s41467-017-01027-z.
  • Cai J., Xia L., Li J., Ni S., Song H., Wu X. Tumor-Associated Macrophages Derived TGF-p-Induced Epithelial to Mesenchymal Transition in Colorectal Cancer Cells through Smad2,3-4/Snail Signaling Pathway. Cancer Res Treat. 2019; 51(1): 252-66. doi: 10.4143/crt.2017.613.
  • Nakano M., Kikushige Y., Miyawaki K., Kunisaki Y., Mizuno S., Takenaka K., Tamura S., Okumura Y., Ito M., Ariyama H., Kusaba H., Nakamura M., Maeda T., Baba E., Akashi K. Dedifferentiation process driven by TGF-beta signaling enhances stem cell properties in human colorectal cancer. Oncogene. 2019; 38(6): 780-93. doi: 10.1038/s41388-018-0480-0.
  • SaavedraH.I., Maiti B., Timmers C., AlturaR., Tokuyama Y., Fuka-sawaK., Leone G. Inactivation of E2F3 results in centrosome amplification. Cancer Cell. 2003; 3(4): 333-46. doi: 10.1016/s1535-6108(03)00083-7.
  • Yao H., Lu F., Shao Y. The E2F family as potential biomarkers and therapeutic targets in colon cancer. PeerJ. 2020; 8. doi: 10.7717/ peerj.8562.
  • Jana A., Krett N.L., Guzman G., Khalid A., Ozden O., Staudacher J.J., Bauer J., Baik S.H., Carroll T., Yazici C., Jung B. NFkB is essential for activin-induced colorectal cancer migration via upregulation of PI3K-MDM2 pathway. Oncotarget. 2017; 8(23): 37377-93.
  • Del Carmen S., CorcheteL.A., GervasR., Rodriguez A., GarciaM., Alcazar J.A., Garcia J., Bengoechea O., Munoz-Bellvis L., Sayagues J.M., AbadM. Prognostic implications of EGFR protein expression in sporadic colorectal tumors: Correlation with copy number status, mRNA levels and miRNA regulation. Sci Rep. 2020; 10(1): 4662. doi: 10.1038/s41598-020-61688-7.
  • Yan Q., Zhang W., Wu Y., WuM., ZhangM., Shi X., Zhao J., Nan Q., Chen Y., Wang L., Cheng T., Li J., Bai Y., Liu S., Wang J. KLF8 promotes tumorigenesis, invasion and metastasis of colorectal cancer cells by transcriptional activation of FHL2. Oncotarget. 2015; 6(28): 25402-17.
  • Wang X., Jiang Z., Zhang Y., Wang X., Liu L., Fan Z. RNA sequencing analysis reveals protective role of kruppel-like factor 3 in colorectal cancer. Oncotarget. 2017; 8(13): 21984-93. doi: 10.18632/ oncotarget.15766.
  • Yang X.Z., Cui S.Z., Zeng L.S., Cheng T.T., Li X.X., Chi J., Wang R., Zheng X.F., Wang H.Y. Overexpression of Rab1B and MMP9 predicts poor survival and good response to chemotherapy in patients with col-orectal cancer. Aging (Albany NY). 2017; 9(3): 914-31. doi: 10.18632/ aging.101200.
  • Lewis B.P., Burge C.B., Bartel D.P. Conserved seed pairing, often flanked by adenosines, indicates that thousands of human genes are microR-NA targets. Cell. 2005; 120(1): 15-20. doi: 10.1016/j.cell.2004.12.035.
  • TruongA.D., RengarajD., Hong Y., Hoang C.T., Hong Y.H., Lille-hojH.S. Differentially expressed JAK-STAT signaling pathway genes and target microRNAs in the spleen of necrotic enteritis-afflicted chicken lines. Res Vet Sci. 2017; 115: 235-43. doi: 10.1016/j.rvsc.2017.05.018.
  • Fesler A., Liu H., Ju J. Modified miR-15a has therapeutic potential for improving treatment of advanced stage colorectal cancer through inhibition of BCL2, BMI1, YAP1 and DCLK1. Oncotarget. 2017; 9(2): 2367-83. doi: 10.18632/oncotarget.23414.
  • Liu L., Wang D., Qiu Y., Dong H., Zhan X. Overexpression of microRNA-15 increases the chemosensitivity of colon cancer cells to 5-fluorouracil and oxaliplatin by inhibiting the nuclear factor-кВ signalling pathway and inducing apoptosis. Exp Ther Med. 2017; 2655-60. doi: 10.3892/etm.2017.5675.
  • Farace C., Pisano A., Grinan-Lison C., Solinas G., Jiménez G., Serra M., Carrillo E., Scognamillo F., Attene F., Montella A., Marchal J.A., Madeddu R. Deregulation of cancer-stem-cell-associated miRNAs in tissues and sera of colorectal cancer patients. Oncotarget. 2020; 11(2): 116-30. doi: 10.18632/oncotarget.27411.
  • Zhang W., Zhou F., Jiang D., Mao Y., Ye D. Association of the Expression Level of miR-16 with Prognosis of Solid Cancer Patients: A Meta-Analysis and Bioinformatic Analysis. Disease Markers. 2020; 1-9.
  • Sabry D., El-Deek S.E.M., Maher M., El-Baz M.A.H., ElBader H.M., Amer E., Hassan E.A., Fathy W., El-Deek H.E.M. Role of miRNA-210, miRNA-21 and miRNA-126 as diagnostic biomarkers in colorectal carcinoma: impact of HIF-1a-VEGF signaling pathway. Mol Cell Biochem. 2019; 454(1-2): 177-89. doi: 10.1007/s11010-018-3462-1.
  • Yu Y., Chen Z., Liu H., Jin W., Ding Z., Zheng S. Tissue microR-NA-21 expression predicted recurrence and poor survival in patients with colorectal cancer – a meta-analysis. OTT. 2016; 2615.
  • WorldMedical Association. World Medical Association Declaration of Helsinki: ethical principles for medical research involving human subjects. JAMA. 2013; 310(20): 2191-4. doi: 10.1001/jama.2013.281053.
  • Sazanov A.A., Kiselyova E.V., Zakharenko A.A., Romanov M.N., Zaraysky M.I. Plasma and saliva miR-21 expression in colorectal cancer patients. J Appl Genet. 2017; 58(2): 231-7. doi: 10.1007/s13353-016-0379-9.
  • Seliverstov R.Yu., Zaraiskiy M.I., Tyurin R.V., Naryshkin A.G., Valerko V.G., Semiglazov V.V., Takahachi Ch. Microrna in monitoring of the evolution of glial cerebral tumors. Sib J Onkol. 2020; 19(3): 47-53. doi: 10.21294/1814-4861-2020-19-3-47-53.
  • Yuan Z., Liang X., Zhan Y., Wang Z., Xu J., Qiu Y., Wang J., Cao Y., Le V.M., Ly H.T., Xu J., Li W., Yin P., Xu K. Targeting CD133 reverses drug-resistance via the AKT/NF-kB/MDR1 pathway in colorectal cancer. Br J Cancer. 2020; 122(9): 1342-53. doi: 10.1038/s41416-020-0783-0.
  • Ma Q., Wang X., Li Z., Li B., Ma F., Peng L., Zhang Y., Xu A., Jiang B. microRNA-16 represses colorectal cancer cell growth in vitro by regulating the p53/survivin signaling pathway. Oncol Rep. 2013; 29(4): 1652-8. doi: 10.3892/or.2013.2262.
  • Wu Y., Song Y., Xiong Y., Wang X., Xu K., Han B., Bai Y., Li L., Zhang Y., Zhou L. MicroRNA-21 (Mir-21) Promotes Cell Growth and Invasion by Repressing Tumor Suppressor PTEN in Colorectal Cancer. Cell Physiol Biochem. 2017; 43(3): 945-58. doi: 10.1159/000481648.
  • Tagscherer K.E., Fassl A., Sinkovic T., Richter J., Schecher S., Macher-Goeppinger S., Roth W. MicroRNA-210 induces apoptosis in colorectal cancer via induction of reactive oxygen. Cancer Cell Int. 2016; 16: 42. doi: 10.1186/s12935-016-0321-6.
  • NijhuisA., Thompson H., Adam J., ParkerA., Gammon L., LewisA., Bundy J.G., Soga T., Jalaly A., Propper D., Jeffery R., Suraweera N., McDonald S., Thaha M.A., Feakins R., Lowe R., Bishop C.L., Silver A. Remodelling of microRNAs in colorectal cancer by hypoxia alters metabolism profiles and 5-fluorouracil resistance. Hum Mol Genet. 2017; 26(8): 1552-64. doi: 10.1093/hmg/ddx059.
Еще
Статья научная
QR-код для установки приложения SciUp Наведите камеру и скачайте бесплатное приложение SciUp