Таксономическое разнообразие микробного сообщества холодного железистого источника Дабан-Горхон (Витимское плоскогорье)

Таксономическое разнообразие микробного сообщества холодного железистого источника Дабан-Горхон (Витимское плоскогорье)

Автор: Банзаракцаева Т.Г., Бархутова Д.Д.

Журнал: Природа Внутренней Азии @nature-inner-asia

Рубрика: Биология

Статья в выпуске: 3 (25), 2023 года.

Бесплатный доступ

Были изучены экологические условия обитания микробных сообществ воды и донных осадков железистого источника Дабан-Горхон (Витимское плоскогорье). Вода Дабан-Горхонского источника характеризуется как гидрокарбонатная, кальциево-магниево-натриевая с содержанием железа 2,16 мг/л, температурой 8 °С в летний период. В воде и донных осадках источника с помощью молекулярно-генетических методов было изучено таксономическое разнообразие микробных сообществ, в которых доминировали представители филумов Proteobacteria, Bacteroidota, Actinobacteriota. Результаты исследования таксономического разнообразия на уровне родов показали, что основу микробных сообществ воды и донных осадков холодного железистого источника Дабан-Горхон составляют прокариоты из низкотемпературных пресноводных местообитаний. Была установлена высокая представленность в исследуемых сообществах бактерий цикла железа, распространению которых способствует присутствие железа в воде.

Еще

Холодные источники, железистый источник, микробные сообщества, таксономическое разнообразие, психрофилы, дабан-горхон, микробная экология, микроорганизмы

Короткий адрес: https://sciup.org/148328091

IDR: 148328091   |   DOI: 10.18101/2542-0623-2023-3-7-16

Список литературы Таксономическое разнообразие микробного сообщества холодного железистого источника Дабан-Горхон (Витимское плоскогорье)

  • Белькова Н. Л. Модифицированная методика выделения суммарной ДНК из водных проб и грунтовых вытяжек методом ферментативного лизиса. Молекулярно-генетические методы анализа микробных сообществ. Разнообразие микробных сообществ внутренних водоемов России: учебно-методическое пособие. Ярославль: Принтхаус, 2009. С. 53-83. Текст: непосредственный.
  • Унифицированные методы анализа вод I под редакцией Ю. Ю. Лурье. Изд. 2. Москва: Химия, 1973. 378 с. Текст: непосредственный.
  • Camacho A., Rochera C., Silvestre J. José, Vicente E., Hahn M. W. Spatial Dominance and Inorganic Carbon Assimilation by Conspicuous Autotrophic Biofilms in a Physical and Chemical Gradient of a Cold Sulfurous Spring: The Role of Differential Ecological Strategies. Microbial Ecology. 2005; 50: 172-184. doi:10.1007Is00248-004-0158-x
  • Chaudhary A., Haack Sh. K., Duris J. W., MarshT. L. Bacterial and Archaeal Phylogenetic Diversity of a Cold Sulfur-Rich Spring on the Shoreline of Lake Erie, Michigan. Applied and Environmental Microbiology. 2009; 75(15): 5025-5038. doi:10.1128IAEM.00112-09
  • Chowdhury T. R., Dick R. P. Ecology of Aerobic Methanotrophs in Controlling Methane Fluxes from Wetlands. Applied Soil Ecology. 2013; 65: 8-22. https://doi.org/10.1016/j. apsoil.2012.12.014
  • Edgar R. C. Search and Clustering Orders of Magnitude Faster than BLAST. Bioinformatics. 2010; 26: 2460-2461.
  • Edgar R. C. UPARSE: Highly Accurate OTU Sequences from Microbial Amplicon Reads. Nature Methods. 2013; 10: 996-998.
  • Epova E. Y., Shevelev A. B., Akbayev R. M. et al. Heterotrophic Microbiota from the Oligotrophic Waters of Lake Vostok, Antarctica. International Journal of Environmental Research and Public Health. 2022; 19(7): 4025. doi:10.3390/ijerph19074025
  • Gawor, J., Grzesiak, J., Sasin-Kurowska, J. et al. Evidence of Adaptation, Niche Separation and Microevolution within the Genus Polaromonas on Arctic and Antarctic Glacial Surfaces. Extremophiles. 2016; 20: 403-413. https://doi.org/10.1007/s00792-016-0831-0
  • Guömundsdottir R., Kreiling A. K., Kristjansson B. K., Marteinsson V. &., Palsson S. Bacterial Diversity in Icelandic Cold Spring Sources and in Relation to the Groundwater Amphipod Crangonyxislandicus. PLoS One. 2019; 14(10): e0222527. doi:10.1371/journal. pone.0222527
  • Hammer 0., Harper D. A. T., Ryan P. D. PAST: Paleontological Statistics Software Package for Education and Data Analysis. Palaeontologia Electronica. 2001; 4(1): 1-9. http:// palaeo-electronica.org/2001_1/past/issue1_01.htm
  • Klindworth A., Pruesse E., Schweer T., Peplies J., Quast C., Horn M., Glöckner F. O. Evaluation of General 16S Ribosomal RNA gene PCR Primers for Classical and Next-Generation Sequencing-Based Diversity Studies. Nucleic Acids Res. 2013; 41(1): e1. doi 10.1093/nar/gks808
  • Li G., Jiang H., Hou W., Wang S., Huang L., Ren H., Deng S., Dong H. Microbial Diversity in Two Cold Springs on the Qinghai-Tibetan Plateau. Geosci. Front. 2012; 3: 317-325. doi:10.1016/j.gsf.2011.12.004.
  • Liu Q., Liu H. C., Zhou Y. G., Xin Y. H. Microevolution and Adaptive Strategy of Psychrophilic Species Flavobacterium bomense sp. nov. Isolated From Glaciers. Frontiers in Microbiology. 2019; 10: 1069. doi: 10.3389/fmicb.2019.01069. PMID: 31178833; PMCID: PMC6538692.
  • Margesin R., Miteva V. Diversity and ecology of psychrophilic microorganisms. Research in Microbiology. 2011; 162(3): 346-361. https://doi.org/10.1016Zj.resmic.2010.12.004
  • Nevin K. P., Holmes D. E., Woodard T. L., Hinlein E. S., Ostendorf D. W., Lovley D. R. Geobacter bemidjiensis sp. nov. and Geobacter psychrophilus sp. nov., Two Novel Fe(Iii)-Reducing Subsurface Isolates. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 2005; 55(Pt 4): 1667-1674. doi: 10.1099/ijs.0.63417-0. PMID: 16014499.
  • Perreault N. N., Andersen D. T., Pollard W. H., Greer C. W., Whyte L. G. Characterization of the Prokaryotic Diversity in Cold Saline Perennial Springs of the Canadian High Arctic. Applied and Environmental Microbiology. 2007;. 73(5). P. 1532-1543. doi.org/10.1128/AEM.01729-06
  • Perreault N. N., Greer C. W., Andersen D. T., Tille S., Lacrampe-Couloume G., Lollar B. Sh., Whyte, L. G. Heterotrophic and Autotrophic Microbial Populations in Cold Perennial Springs of the High Arctic. Applied and Environmental Microbiology. 2008; 74: 68986907. doi:10.1128/AEM.00359-08
  • Rudolph C., Wanner G., Huber R. Natural Communities of Novel Archaea and Bacteria Growing in Cold Sulfurous Springs with a String-of-Pearls-Like Morphology. Applied and Environmental Microbiology. 2001; 67(5): 2336-2344. doi:10.1128/aem.67.5.2336-2344.2001.
  • Siddiqui K. S., Cavicchioli R. Cold-Adapted Enzymes. Annual review of biochemistry. 2008; 75: 403-433. https://doi.org/10.1148/annurev.biochem.75.103004.142723
  • Teixeira L. M., Merquior V L. C. The Family Moraxellaceae. In: Rosenberg E., DeLong E. F., Lory S., Stackebrandt E., Thompson F. (eds). The Prokaryotes. Springer, Berlin, Heidelberg, 2014. https://doi.org/10.1007/978-3-842-38922-1_245
  • Willems A. The Family Comamonadaceae. The Prokaryotes: Alphaproteobacteria and Betaproteobacteria, 2013, pp. 777-851. 10.1007/978-3-642-30197-1_238.
  • Zhang J., Kobert K., Flouri T., Stamatakis A. PEAR: a Fast and Accurate Illumina Paired-End reAd Merger. Bioinformatics. 2014; 30: 814-820.
Еще
Статья научная
QR-код для установки приложения SciUp Наведите камеру и скачайте бесплатное приложение SciUp