Таксономическое разнообразие микробного сообщества в различных термальных зонах горячего источника Гарга (Байкальская рифтовая зона)
Автор: Лаврентьева Е.В., Раднагуруева А.А., Иванов В.Л., Батурина О.А., Бархутова Д.Д.
Журнал: Природа Внутренней Азии @nature-inner-asia
Рубрика: Биология
Статья в выпуске: 3 (25), 2023 года.
Бесплатный доступ
Изучено таксономическое разнообразие микробного сообщества микробных матов и донных осадков с использованием анализа ампликонов гена 16S рРНК. В данных образцах микробных матов доминировали Pseudomonadota, Cyanobacteriota, Icnovibacteriota, Chloroflexota и Deinococcota. С понижением температуры возрастает доля представителей Bacillota, Actinomycetota. В микробном сообществе донных осадков во всех изученных термальных зонах доминируют представители филумов Pseudomonadota, Bacteroidota, содоминантами в донных осадках являлись Bacillota. Проведенные исследования позволили установить таксономический состав и соотношение основных групп микроорганизмов в микробных сообществах микробных матов и донных осадков в горячем источнике Гарга.
Таксономическое разнообразие, 16s ррнк, температурные зоны, горячий источник, микробный мат, донные осадки, байкальская рифтовая зона
Короткий адрес: https://sciup.org/148328089
IDR: 148328089 | DOI: 10.18101/2542-0623-2023-3-58-67
Список литературы Таксономическое разнообразие микробного сообщества в различных термальных зонах горячего источника Гарга (Байкальская рифтовая зона)
- Геохимическая деятельность микроорганизмов гидротерм Байкальской рифтовой зоны / Б. Б. Намсараев, Д. Д. Бархутова, Э. В. Данилова [и др.]. Новосибирск: Гео, 2011. 302 с. Текст: непосредственный.
- Филогенетический анализ микробного мата в горячем источнике Гарга (Байкальская рифтовая зона) и разнообразие природных пептидаз / Е. В. Лаврентьева, А. А. Раднагуруева, Т. Г. Банзаракцаева [и др.] // Вавиловский журнал генетики и селекции. 2017. № 21(8). С. 959-963. DOI 10.18699/VJ17.319. Текст: непосредственный.
- Bonch-Osmolovskaya E. A., Miroshnichenko M. L., Slobodkin A. I. et al. Biodiversity of Anaerobic Lithotrophic Prokaryotes in Terrestrial Hot Springs of Kamchatka. Microbiology (Moscow). 1999; 68: 343-351.
- Bonch-Osmolovskaya E. A. Thermophilic Microorganisms: a general overview. Proc. Winogradsky Inst. Microbiol. In: V F. Galchenko (ed.) Thermophilic microorganisms. Moscow, 2011, pp. 5-14
- Brouchkov A., Kabilov M., Filippova S. et al. Bacterial Community in Ancient Permafrost Alluvium at the Mammoth Mountain (Eastern Siberia). Gene. 2017; 636: 48-53. https://doi. org/10.1016/j.gene.2017.09.021.
- Coman C., Druga B., Hegedus A. et al. Archaeal and Bacterial Diversity in Two Hot Spring Microbial Mats from a Geothermal Region in Romania. Extremophiles. 2013; 17: 523-534.
- Edgar R. C. UPARSE: Highly Accurate OTU Sequences from Microbial Amplicon Reads. Nat. Methods. 2013; 10: 996-998.
- Everroad R. C., Otaki H., Matsuura K., and Haruta S. Diversification of Bacterial Community Composition along a Temperature Gradient at a Thermal Spring. Microbes Environ. 2012; 27: 374-381.
- Fadrosh D. W., Ma B., Gajer P. et al. An Improved Dual-Indexing Approach for Multiplexed 16S rRNA Gene Sequencing on the Illumina MiSeq Platform. Microbiome. 2014; 2. Art. 6: 1-7. https://doi.org/10.1186/2049-2618-2-6
- Gumerov V M., Mardanov A. V., Beletsky A. V. et al. Molecular Analysis of Microbial diversity in the Zavarzin Spring, Uzon Caldera, Kamchatka. Microbiology (Moscow). 2011; 80: 244-251.
- Klatt C. G., Wood J. M., Rusch D. B. et al. Community Ecology of Hot Spring Cyanobacterial Mats: Predominant Populations and their Functional Potential. ISME J. 2011; 5: 1262-1278.
- Podar P. T., Yang Z., Bjornsdottir S. H., and Podar M. Comparative Analysis of Microbial Diversity across Temperature Gradients in Hot Springs from Yellowstone and Iceland. Front. Microbiol. 2020; 11: 1625. doi: 10.3389/fmicb.2020.01625.
- Rozanov A. S., Bryanskaya A. V., Ivanisenko T. V. et al. Biodiversity of the Microbial Mat of the Garga Hot Spring. BMC Evol Biol. 2017; Dec 28, 17(Suppl 2): 254. doi: 10.1186/ s12862-017-1106-9. PMID: 29297382; PMCID: PMC5751763.
- Song Z. Q., Wang F. P., Zhi X. Y. et al. Bacterial and Archaeal Diversities in Yunnan and Tibetan Hot Springs, China. Environ. Microbiol. 2013; 15(4): 1160-1175.
- Wang S., Hou W., Dong H. et al. Control of Temperature on Microbial Community Structure in Hot Springs of the Tibetan Plateau. PLoS One. 2013; 8(5): e62901.
