Влияние генотипов по IGF2, CCKAR и MC4R на фенотипические показатели и племенную ценность свиней по хозяйственно полезным признакам

Влияние генотипов по IGF2, CCKAR и MC4R на фенотипические показатели и племенную ценность свиней по хозяйственно полезным признакам

Автор: Мельникова Е.Е., Бардуков Н.В., Форнара М.С., Костюнина О.В., Сермягин А.А., Зайцев А.М., Зиновьева Н.А.

Журнал: Сельскохозяйственная биология @agrobiology

Рубрика: Генетика племенной ценности

Статья в выпуске: 4 т.53, 2018 года.

Бесплатный доступ

Разработка программ маркерной селекции должна основываться на полиморфизмах, генетическое влияние которых на показатели продуктивности и племенной ценности животных достоверно и значимо. Перспективы использования геномной селекции у свиней связывают с разработкой ДНК-матриц низкой плотности (LD, low density) с включением в них SNP (single nucleotide polymorphisms), отобранных по результатам GWAS-анализа (genome-wide association studies) с использованием HD-панелей (high destiny). Потенциальными ДНК маркерами для включения в LD-панели служат гены инсулиноподобного фактора роста 1 ( IGF2 ), рецептора холицистокинина А ( CCKAR ), рецептора меланокортина 4 ( MC4R ). Многочисленные исследования свидетельствуют о достоверном влиянии этих генов на вариацию таких фенотипических показателей, как конверсия корма, скорость роста, наращивание мышечной массы, отложение жира у свиней. Целью настоящей работы было изучение комплексного влияния генотипов по IGF2, CCKAR и MC4R на показатели мясной и откормочной продуктивности у свиней ( Sus scrofa ) пород крупная белая и ландрас российской селекции...

Еще

Свиньи, крупная белая порода, ландрас, полиморфизм, оценка племенной ценности особей (ebv), откормочные и мясные качества

Короткий адрес: https://sciup.org/142216572

IDR: 142216572   |   DOI: 10.15389/agrobiology.2018.4.723rus

Список литературы Влияние генотипов по IGF2, CCKAR и MC4R на фенотипические показатели и племенную ценность свиней по хозяйственно полезным признакам

  • Сермягин А.А., Нарышкина Е.Н., Карпушкина Т.В., Стрекозов Н.И., Зиновьева Н.А. Перспективы использования оценки геномной племенной ценности в селекции молочного скота. Молочное и мясное скотоводство, 2015, 7: 2-5.
  • Сермягин А.А., Гладырь Е.А., Харитонов С.Н., Ермилов А.Н., Стрекозов Н.И., Брем Г., Зиновьева Н.А. Полногеномный анализ ассоциаций по хозяйственно-полезным признакам скота в российской популяции голштинской породы. Сельскохозяйственная биология, 2016, 51(2): 182-193 ( ) DOI: 10.15389/agrobiology.2016.2.182rus
  • Зиновьева Н.А., Сермягин А.А., Костюнина О.В. Геномная селекция -новая стратегия генетического совершенствования свиней. Животноводство России, 2018, 7: 53-55.
  • Ramos A.M., Crooijmas R.P., Affara N.A. et al. Design of a high density SNP genotyping assay in the pig using SNPs identified and characterized by next generation sequencing technology. PLoS ONE, 2009, 4(8): 6524 ( ) DOI: 10.1371/journal.pone.0006524
  • Meuwissen T.H.E., Hayes B.J., Goddard M.E. Prediction of total genetic value using genome-wide dense marker maps. Genetics, 2001, 157(4): 1819-1829.
  • VanRaden P.M., Null D.J., Sargolzaei M., Wiggans G.R., Tooker M.E., Cole J.B., Sonstegard T.S., Faust M.A., Doak G.A. Genomic imputation and evaluation using high-density Holstein genotypes. J. Dairy Sci., 2013, 96(1): 668-678 ( ) DOI: 10.3168/jds.2012-5702
  • Habier D., Fernando R.L., Dekkers JCM. Genomic selection using low-density marker panels. Genetics, 2009, 182(1): 343-353 ( ) DOI: 10.1534/genetics.108.100289
  • Huang Y., Hickey J.M., Cleveland M.A., Maltecca C. Assessment of alternative genotyping strategies to maximize imputation accuracy at minimal cost. Genet. Sel. Evol., 2012, 44(1): 25 ( ) DOI: 10.1186/1297-9686-44-25
  • Cleveland M.A., Hickey J.M. Practical implementation of cost-effective genomic selection in commercial pig breeding using imputation. J. Anim. Sci., 2013, 91(8): 3583-3592 ( ) DOI: 10.2527/jas.2013-6270
  • Abell C.E., Dekkers J.C.M., Rothschild M.F., Mabry J.W., Stalder K.J. Total cost estimation for implementing genome-enabled selection in a multi-level swine production system. Genet. Sel. Evol., 2014, 46(1): 32 ( ) DOI: 10.1186/1297-9686-46-32
  • Pig QTLdb. Режим доступа: https://www.animalgenome.org/cgi-bin/QTLdb/SS/index. Дата обращения: 10.05.2018.
  • Van Laere A.-S. From QTL to QTN. Identification of a quantitative trait nucleotide influencing muscle development and fat deposition in pig. Doctoral thesis. Swedish University of Agricultural Sciences, Uppsala, 2005.
  • Van Laere A.S., Nguyen M., Braunschweig M., Nezer C., Collette C., Moreau L., Archibald A.L., Haley C.S., Buys N., Tally M., Andersson G., Georges M., Andersson L. A regulatory mutation in IGF2 causes a major QTL effect on muscle growth in the pig. Nature, 2003, 425 (6960): 832-836 ( ) DOI: 10.1038/nature02064
  • Chang K.C. Key signalling factors and pathways in the molecular determination of skeletal muscle phenotype. Animal, 2007, 1(5): 681-698 ( ) DOI: 10.1017/S1751731107702070
  • Estellé J., Mercadé A., Noguera J.L., Pérez-Enciso M., Óvilo C., Sánchez A., Folch J.M. Effect of the porcine IGF2-intron3-G3072A substitution in an outbred Large White population and in an Iberian×Landrace cross. J. Anim. Sci., 2005, 83(12): 2723-2728. ( ) DOI: 10.2527/2005.83122723x
  • Heuven H.C.M., Bovenhuis H., Janss L.L.G., Van Arendonk J.A.M. Efficiency of population structures for mapping of Mendelian and imprinted quantitative trait loci (QTL) in outbred pigs using variance component methods. Genet. Sel. Evol., 2005, 37: 35-655 ( ) DOI: 10.1051/gse:2005019
  • Oczkowicz M., Tyra M., Walinowicz K., Różycki M., Rejduch B. Known mutation (A3072G) in intron3 of the IGF2 gene is associated with growth and carcass composition in Polish pig breeds. J. Appl. Genet., 2009, 50(3): 257-259 ( ) DOI: 10.1007/BF03195681
  • Костюнина О.В., Свеженцева Н.А., Зиновьева Н.А., Доцев А.В., Шахина А.В., Сизарева Е.И., Гладырь Е.А. Влияние маркерного генотипа по ESR и IGF2 на племенную ценность хряков крупной белой породы. Сельскохозяйственная биология, 2011, 6: 54-59.
  • Костюнина О.В., Крамаренко С.С., Свеженцева Н.А., Сизарева Е.И., Зиновьева Н.А. Ассоциация гена IGF2 с продуктивными качествами свиней (Sus scrofa) крупной белой породы с учетом половой дифференциации. Сельскохозяйственная биология, 2015, 50(6): 736-745 ( ) DOI: 10.15389/agrobiology.2015.6.736rus
  • Crawley J.N., Fiske S.M., Durieux C., Derrien M., Roques B.P. Centrally administered cholecystokinin suppresses feeding through a peripheral-type receptor mechanism. J. Pharmacol. Exp. Ther., 1991, 257: 1076-1080.
  • Asin K.E., Bednarz L. Differential effects of CCK-JMV-180 on food intake in rats and mice. Pharmacol. Biochem. Be., 1992, 42(2): 291-295.
  • Clutter A.C., Sasaki S., Pomp D. Rapid communication: the cholecystokinin type-A receptor (CCKAR) gene maps to porcine chromosome 8. J. Anim. Sci., 1998, 76(7): 1983-1984.
  • Houston R.D., Haley C.S., Archibald A.L., Cameron N.D., Plastow G.S., Rance K.A. A polymorphism in the 5’ untranslated region of the porcine Cholecystokinin Type-A Receptor (CCKAR) gene affects feed intake and growth. Genetics, 2006, 174(3): 1555-1563 ( ) DOI: 10.1534/genetics.106.059659
  • Johnson R. Effect of DNA markers in Nebraska selection lines. Nebraska Swine Reports, 2010: 44-50. Режим доступа: https://digitalcommons.unl.edu/cgi/viewcontent.cgi?article=1260&con-text=coopext_swine. Дата обращения: 10.05.2018.
  • Mountjoy K.G., Mortrud M.T., Low M.J., Simerly R.B., Cone R.D. Localization of the melanocortin-4 receptor (MC4-R) in neuroendocrine and autonomic control circuits in the brain. Mol. Endocrinol., 1994, 8(10): 1298-1308.
  • Kim K.S., Larsen N.J., Rothschild M.F. Rapid communication: linkage and physical mapping of the porcine melanocortin-4 receptor (MC4R) gene. J. Anim. Sci., 2000, 78(3): 791-792.
  • Kim K.S., Larsen N., Short T., Plastow G., Rothschild M.F. A missense variant of the melanocortin 4 receptor (MC4R) gene is associated with fatness, growth and feed intake traits. Mamm. Genome, 2000, 11(2): 131-135.
  • Hernández-Sánchez J., Visscher P., Plastow G., Haley C. Candidate gene analysis for quantitative traits using the transmission disequilibrium test: the example of the melanocortin 4-receptor in pigs. Genetics, 2003, 164(2): 637-644.
  • Stachowiak M., Szydlowski M., Obarzanek-Fojt M., Switonski M. An effect of a missense mutation in the porcine melanocortin-4 receptor (MC4R) gene on production traits in Polish pig breeds is doubtful. Anim. Genet., 2005, 37(1): 55-57 ( ) DOI: 10.1111/j.1365-2052.2005.01373.x
  • Houston R.D., Cameron N.D., Rance K.A. A melanocortin-4 receptor (MC4R) polymorphism is associated with performance traits in divergently selected large white pig populations. Anim. Genet., 2004, 35(5): 386-390 ( ) DOI: 10.1111/j.1365-2052.2004.01182.x
  • Chen J.F., Xiong Y.Z., Zuo B., Zheng R., Li F.E., Lei M.G., Li J.L., Deng C.Y., Jiang S.W. New evidences of effect of melanocortin-4 receptor and insulin-like growth factor 2 genes on fat deposition and carcass traits in different pig populations. Asian-Australian Journal of Animal Science, 2005, 18(11): 1542-1547 ( ) DOI: 10.5713/ajas.2005.1542
  • Óvilo C., Fernández A., Rodríguez M.C., Nieto M, Silióa L. Association of MC4R gene variants with growth, fatness, carcass composition and meat and fat quality traits in heavy pigs. Meat Science, 2006, 73(1): 42-47 ( ) DOI: 10.1016/j.meatsci.2005.10.016
  • Van den Maagdenberg K., Stinckens A., Claeys E., Seynaeve M., Clinquart A., Georges M., Buys N., De Smet S. The Asp298Asn missense mutation in the porcine melanocortin-4 receptor (MC4R) gene can be used to affect growth and carcass traits without an effect on meat quality. Animal, 2007, 1(8): 1089-1098 ( ) DOI: 10.1017/S1751731107000456
  • Park H.B., Carlborg O., Marklund L., Andersson L. Melanocortin-4 receptor (MC4R) genotypes have no major effect on fatness in a Large White ½ Wild Boar intercross. Anim. Genet., 2002, 33(2): 155-157 ( ) DOI: 10.1046/j.1365-2052.2002.00824.x
  • Bruun C.S., Jørgensen C.B., Nielsen V.H., Andersson L, Fredholm M. Evaluation of the porcine melanocortin 4 receptor (MC4R) gene as a positional candidate for a fatness QTL in a cross between Landrace and Hampshire. Anim. Genet., 2006, 37(4): 359-362 ( ) DOI: 10.1111/j.1365-2052.2006.01488.x
  • Jokubka R., Maak S., Kerziene S., Swalve H.H. Association of a melanocortin 4 receptor (MC4R) polymorphism with performance traits in Lithuanian White pigs. J. Anim. Breed. Genet., 2006, 123(1): 12-22 ( ) DOI: 10.1111/j.1439-0388.2006.00559.x
  • Salajpal K., Ðikić M., Karolyi D., Šurina J., Matković M., Liker B. Effect of MC4R polymorphism on physiological stress response in pigs. Poljoprivreda, 2007, 13(1): 46-50. Режим доступа: https://hrcak.srce.hr/16049. Дата обращения: 10.05.2018.
  • Misztal I., Tsuruta S., Strabel T., Auvray B., Druet T., Lee D.H. BLUPF90 and related programs (BGF90). Proc. 7th World Congress on genetics applied to livestock production. Montpellier, France, 2002, 28(28-07): 21-22.
  • Dube B., Mulugeta S.D., Dzama K. Genetic relationship between growth and carcass traits in Large White pigs. S. Afr. J. Anim. Sci., 2013, 43(4): 482-492.
Еще
Статья научная
QR-код для установки приложения SciUp Наведите камеру и скачайте бесплатное приложение SciUp