Высокоэффективные штаммы клубеньковых бактерий люцерны (Medicago varia L.): молекулярно-генетическая характеристика и использование в сопряженной селекции

Автор: Румянцева М.Л., Владимирова М.Е., Мунтян В.С., Степанова Г.В., Саксаганская А.С., Кожемяков А.П., Орлова А.Г., Becker A., Симаров Б.В.

Журнал: Сельскохозяйственная биология @agrobiology

Рубрика: Кормовые ресурсы

Статья в выпуске: 6 т.54, 2019 года.

Бесплатный доступ

В травостоях многолетних кормовых бобовых трав предпочтение отдается люцерне для создания культурных пастбищ и восстановления деградированных почв. Люцерна изменчивая ( Medicago sativa L. nothosubsp. varia (Martyn) Arcang) высокоурожайная и устойчивая к неблагоприятным условиям возделывания культура, что важно для зон рискованного земледелия России. Урожайность люцерны в значительной степени зависит от успешности формирования растительно-микробной симбиотической системы с клубеньковыми бактериями (ризобиями), которая становится способной фиксировать азот атмосферы. Согласно современным исследованиям по симбиогенетике, эффективность симбиотических систем предопределяется комплементарностью взаимодействия геномов растения и его микросимбионта. Исходя из этого и биопрепараты, которые используют для обработки семян бобовых, также должны содержать селекционно подобранные штаммы ризобий с соответствующими генотипическими характеристиками. В представленной работе впервые проведен сравнительный анализ урожайности 73 сорто-микробных систем, сформированных на основе штаммов Sinorhizobium meliloti , выделенных из района, подверженного засолению, и производственных штаммов 425а и 415б, которые используют для приготовления биопрепарата Ризоторфин, с сортами люцерны, созданными методами традиционной и сопряженной селекции. Показана перспективность отбора высокоэффективных штаммов, комплементарных хозяйственно-ценным сортам растений-хозяев в модельных опытах. Установлено, что штаммы А1 и А2 активнее формировали симбиотические системы с испытанными сортами люцерны, чем производственные штаммы. Впервые показано, что сорто-микробные системы на основе новых сортов обладают повышенной адаптивностью, а потенциал повышения прибавок урожая для них существенно превышает 50 %. Впервые получены данные, показывающие, что урожайность сорто-микробных систем, сформированных производственным штаммом 425а, преимущественно зависит от неконтролируемых факторов согласно двухфакторному дисперсионному анализу. Вместе с тем, геномные характеристики этого штамма играют более существенную роль, чем сорто-штаммовые взаимодействия, в формировании урожая, что, по-видимому, обуславливает востребованность биопрепаратов на основе этого штамма для разных сортов в различных географических районах Российской Федерации. Высокая комплементарность штаммов А1 и А2 к сорту Агния и функциональная значимость генетических характеристик штамма 425а обусловили интерес к их геномным характеристикам. Сравнительный анализ геномов с использованием ДНК-биочипов выявил существенные различия между высокоэффективными штаммами. Установлено, что гены, обуславливающие симбиотическую активность и стрессоустойчивость ризобий, имели дивергентную структуру преимущественно у штаммов, адаптированных к условиям засоления. Данные первых этапов молекулярно-генетического анализа высокоэффективных штаммов указывают на необходимость продолжения исследований, которые позволят осуществлять направленный подбор штаммов-микросимбионтов для современных сортов люцерны. Впервые представленные результаты оценки урожайности сорто-микробных систем, выращиваемых в различных природно-климатических условиях России, наглядно доказывают необходимость широкого внедрения метода сопряженной симбиотической селекции для создания новых хозяйственно ценных сортов бобовых трав, необходимых для формирования устойчивой кормовой базы.

Еще

Сорта люцерны, метод сопряженной селекции, высокоэффективные штаммы, симбиотические гены и гены стрессоустойчивости ризобий, геномные острова, сорто-микробные системы, урожайность, двухфакторный дисперсионный анализ

Короткий адрес: https://sciup.org/142226289

IDR: 142226289   |   DOI: 10.15389/agrobiology.2019.6.1306rus

Список литературы Высокоэффективные штаммы клубеньковых бактерий люцерны (Medicago varia L.): молекулярно-генетическая характеристика и использование в сопряженной селекции

  • Иванов А.И. Люцерна. М., 1980.
  • Дубовский И.И. Агроэнергетическая оценка культур и основные направления совершенствования полевого кормопроизводства в степных районах Центрально-Черноземной полосы. Автореф. канд. дис. М., 2000.
  • Государственный реестр селекционных достижений, допущенных к использованию. Т. 1. Сорта растений (официальное издание). М., 2019.
  • Шамсутдинов З.Ш. Селекция кормовых культур: достижения и задачи. Сельскохозяйственная биология, 2014, 6: 36-45 ( ). DOI: 10.15389/agrobiology.2014/6/36rus
  • Бжеумыхов В.С., Кобозев И.В., Токбаев М.М. Повышение эффективности возделывания люцерны на основе интенсификации симбиотической азотфиксации. Известия Тимирязевской сельскохозяйственной академии, 2007, 2: 28-37.
  • Проворов Н.А., Симаров Б.В. Внутрисортовая изменчивость люцерны по активности симбиоза с Rhizobium meliloti. Сельскохозяйственная биология, 1986, 12: 37-42.
  • Фотев Ю.В., Сидорова К.К., Новикова Т.И., Белоусова В.П. Изучение нодуляции и азотфиксации у двух сортов вигны [Vigna unguiculata (L.) Walp.] при инокуляции разными штаммами ризобий (Bradyrhizobium sp.). Вавиловский журнал генетики и селекции, 2016, 20(3) 348-354 ( ).
  • DOI: 10.18699/VJ16.099
  • Шкарупа М.В. Влияние инокуляции семян аборигенными штаммами клубеньковых бактерий на формирование вегетативной массы у сортов сои на выщелоченном черноземе Краснодарского края. Сб. мат. Х Всероссийской конференции молодых ученых и специалистов "Актуальные вопросы биологии, селекции, технологии возделывания и переработки масличных и других технических культур". Краснодар, 2019: 231-235.
  • Ddelić D., Stajković-Srbinović O., Radović J., Kuzmanović D., Rasulić N., Simić A., Knežević-Vukčević E. Differences in symbiotic N2 fixation of alfalfa, Medicago sativa L. cultivars and Sinorhizobium spp. strains in field conditions. Romanian Biotechnological Letters, 2013, 18(6): 8743-8750.
  • Shamseldin A., Youseif S.H., Abd El-Megeed F.H., Abdelkhalek A., Sadowsky M.J., Saleh S.A. Selection and use of effective, competitive, clover-nodulating rhizobium strains for use as commercial inoculants in alkaline and salt affected egyptian soils. Asian Academic Research Journal of Multidisciplinary, 2016, 3(7): 2319-2801.
  • Yadav J., Verma J.P., Rajak V.K., Tiwari K.N. Selection of effective indigenous rhizobia strain for seed inoculation on chickpea (Cicer aritenium L.) production. Bacteriology Journal, 2011, 1(1): 24-30 ( ).
  • DOI: 10.3923/bj.2011.24.30
  • Гасанов Г.Н., Усманов Р.З., Мусаев М.Р., Абасов М.М. Экологическое состояние и возможности фитомелиорации засоленных почв Западного Прикаспия. Сельскохозяйственная экология, 2007, 1: 79-85.
  • Румянцева М.Л., Степанова Г.В., Курчак О.Н., Онищук О.П., Мунтян В.С., Дзюбенко Е.А., Дзюбенко Н.И., Симаров Б.В. Отбор солеустойчивых растений разных видов люцерны и анализ их морфобиологических и симбиотрофных показателей. Сельскохозяйственная биология, 2015, 50(5): 673-684 ( ).
  • DOI: 10.15389/agrobiology.2015.5.673rus
  • Aranjuelo I., Arrese-Igor C., Molero G. Nodule performance within a changing environmental context. Journal of Plant Physiology, 2014, 171(12): 1076-1090 ( ).
  • DOI: 10.1016/j.jplph.2014.04.002
  • Mahajan S., Tuteja N. Cold, salinity and drought stresses: an overview. Archives of Biochemistry and Biophysics, 2005, 444(2): 139-58 ( ).
  • DOI: 10.1016/j.abb.2005.10.018
  • O'Hara G., Yates R., Howieson J. Selection of strains of root nodule bacteria to improve inoculants performance and increase legume productivity in stressful environments. In: Inoculants and nitrogen fixation of legumes in Vietnam /D. Herridge (ed.). ACIAR Proceedings, 2002: 75-80.
  • Sańko-Sawczenko I., Łotocka B., Mielecki J., Rekosz-Burlaga H., Czarnocka W. Transcriptomic changes in Medicago truncatula and Lotus japonicus root nodules during drought stress. International Journal of Molecular Sciences, 2019, 20(5): 1204 ( ).
  • DOI: 10.3390/ijms20051204
  • Salim A., Cheloufi H., Attab S., Bouras N. Improvement of alfalfa growth under water stress by inoculation with Sinorhizobium meliloti strains from the Algerian Sahara. International Journal of Sciences and Research. 2019, 75(7/1): 35-40 ( ).
  • DOI: 10.21506/j.ponte.2019.7.4
  • Vriezen J.A., de Bruijn F.J., Nüsslein K. Responses of rhizobia to desiccation in relation to osmotic stress, oxygen, and temperature. Applied and Environmental Microbiology, 2007, 73(11): 3451-3459 ( ).
  • DOI: 10.1128/AEM.02991-06
  • Xu J., Li X.L., Luo L. Effects of engineered Sinorhizobium meliloti on cytokinin synthesis and tolerance of alfalfa to extreme drought stress. Biotechnology, 2012, 78(22): 8056-8061 ( ).
  • DOI: 10.1128/AEM.01276-12
  • Лазарев Н.Н. Продуктивность люцерно- и клеверо-злаковых травостоев при двух и трехкратном скашивании. Вестник ОрелГАУ, 2006, (2-3): 55-56.
  • Bourion V., Heulin-Gotty K., Aubert V., Tisseyre P., Chabert-Martinello M., Pervent M., Delaitre C., Vile D., Siol M., Duc G., Brunel B., Burstin J., Lepetit M. Co-inoculation of a Pea Core-Collection with diverse rhizobial strains shows competitiveness for nodulation and efficiency of nitrogen fixation are distinct traits in the interaction. Frontiers in Plant Science, 2018, 8: 2249 ( ).
  • DOI: 10.3389/fpls.2017.02249
  • Тихонович И.А., Андронов Е.Е., Борисов А.Ю., Долгих Е.А., Жернаков А.И., Жуков В.А., Проворов Н.А., Румянцева М.Л., Симаров Б.В. Принцип дополнительности геномов в расширении адаптационного потенциала растений. Генетика, 2015, 51(9): 831-846 ( ).
  • DOI: 10.7868/S001667581509012X
  • Gubry-Rangin C., Garcia M., Bena G. Partner choice in Medicago truncatula-Sinorhizobium symbiosis. Proceedings. Biological sciences, 2010, 277(1690): 1947-1951 ( ).
  • DOI: 10.1098/rspb.2009.2072
  • Wang D., Yang S., Tang F., Zhu H. Symbiosis specificity in the legume-rhizobial mutualism. Cellular Microbiology, 2012, 14(3): 334-342 ( ).
  • DOI: 10.1111/j.1462-5822.2011.01736.x
  • Хапчаева С.А., Дидович С.В., Топунов А.Ф., Мулюкин А.Л., Зотов В.С. Специфичность симбиотических взаимодействий бактерий рода Rhizobium leguminosarum bv. viciae с растениями трибы Vicieae. Экологическая генетика, 2018, 16(4): 51-60 ( ).
  • DOI: 10.17816/ecogen16451-60
  • Argaw A. Symbiotic effectiveness of inoculation with Bradyrhizobium isolates on soybean [Glycine max (L.) Merrill] genotypes with different maturities. Springerplus, 2014, 3: 753 ( ).
  • DOI: 10.1186/2193-1801-3-753
  • Воробейков Г.А., Бредихин В.Н. Микроорганизмы в агробиотехнологиях и защите природной среды. СПб, 2018.
  • Кожемяков А.П., Лактионов Ю.В., Попова Т.А., Орлова А.Г., Кокорина А.Л., Вайшля О.Б., Агафонов Е.В., Гужвин С.А., Чураков А.А., Яковлева М.Т. Агротехнологические основы создания усовершенствованных форм микробных биопрепаратов для земледелия. Сельскохозяйственная биология, 2015, 50(3): 369-376 ( ).
  • DOI: 10.15389/agrobiology.2015.3.369rus
  • Arafa M.M., El-Batanony N.H., Nofal A.M. Inoculation effect of rhizobial strains on growth, yield and chemical composition of some legume crops in new reclaimed soil. Middle East Journal of Agriculture Research, 2018, 7(2): 352-363.
  • Buntic A.V., Stajkovic-Srbinovic O.S., Knezevic M.M., Kuzmanovic D.Z., Rasulic N.V., Delic D.I. Development of liquid rhizobial inoculants and pre-inoculation of alfalfa seeds. Archives of Biological Sciences, 2019, 71(2): 379-387 ( ).
  • DOI: 10.2298/abs181008062b
  • Solomon T., Pant L.M., Angaw T. Effects of Inoculation by Bradyrhizobium japonicum strains on nodulation, nitrogen fixation, and yield of soybean (Glycine max L. Merill) varieties on Nitisols of Bako, Western Ethiopia. ISRN Agronomy, 2012, Article ID 261475 ( ).
  • DOI: 10.5402/2012/261475
  • Атласова Л.Г. Симбиотическая деятельность клубеньковых бактерий Medicago falcata L. в условиях Центральной Якутии. Известия Самарского научного центра Российской академии наук, 2015, 17(5): 77-80.
  • Цоциева В.П., Басиева Л.Ж., Козырев А.Х. Динамика накопления сухого вещества и урожайность посевов клевера в зависимости от штамма клубеньковых бактерий. Известия Горского государственного аграрного университета, 2015, 52(4): 57-62.
  • Deaker R., Roughley R.J., Kennedy I.R. Legume seed inoculation technology - a review. Soil Biology and Biochemistry, 2004, 36(8): 1275-1288 ( ).
  • DOI: 10.1016/j.soilbio.2004.04.009
  • Дробышева Л.В., Зятчина Г.П. Cелекция различных видов бобовых трав на повышение эффективности симбиоза. Адаптивное кормопроизводство, 2016, 3: 94-108.
  • Степанова Г.В., Золотарев В.Н. Биотехнология сопряженной селекции люцерны на повышение адаптивной способности. Адаптивное кормопроизводство, 2015, 1: 28-38.
  • Ибрагимова М.В., Румянцева М.Л., Онищук О.П., Белова В.С., Курчак О.Н., Андронов Е.Е., Дзюбенко Н.И., Симаров Б.В. Симбиоз клубеньковых бактерий Sinorhizobium meliloti с люцерной Medicago sativa в условиях засоления. Микробиология, 2006, 75(1): 94-100.
  • Beringer J.E. R factor transfer in Rhizobium leguminosarum. Journal of General Microbiology, 1974, 84: 188-198 ( ).
  • DOI: 10.1099/00221287-84-1-188
  • Румянцева М.Л., Симаров Б.В., Онищук О.П., Андронов Е.Е., Чижевская Е.П., Белова В.С., Курчак О.Н., Мунтян А.Н., Румянцева Т.Б., Затовская Т.В. Биологическое разнообразие клубеньковых бактерий в экосистемах и агроценозах. Теоретические основы и методы /Под ред. М.Л. Румянцевой, Б.В. Симарова. СПб, 2011.
  • Черкасова М.Е., Мунтян В.С., Саксаганская А.С., Симаров Б.В., Румянцева М.Л. Sinorhizobium meliloti: хромосомные типы и геномные острова. Экологическая генетика, 2019, 17(3): 23-38 ( ).
  • DOI: 10.17816/ecogen17323-38
  • Giuntini E., Mengoni A., De Filippo C., Cavalieri D., Aubin-Horth N., Landry C.R., Becker A., Bazzicalupo M. Large-scale genetic variation of the symbiosis-requiered megaplasmid pSymA revealed by comparative genomic analysis of Sinorhizobium meliloti natural strains. BMC Genomics, 2005, 6: Article number 158 ( ).
  • DOI: 10.1186/1471-2164-6-158
  • Kim C.C., Joyce E.A., Chan K., Falkow S. Improved analytical methods for microarray-based genome-composition analysis. Genome Biology, 2002, 3(11): RESEARCH0065 ( ).
  • DOI: 10.1186/gb-2002-3-11-research0065
  • Районированные и перспективные сорта кормовых культур селекции ВНИИ кормов им. В.Р. Вильямса. Каталог. М., 2007.
  • Пустыльник Е.И. Статистические методы анализа и обработки наблюдений. М., 1968.
  • Лакин Г.Ф. Биометрия. М., 1990.
  • Гмурман В.Е. Теория вероятностей и математическая статистика. М., 2004.
  • Hammer O., Harper D.A.T., Ryan P.D. PAST: paleontological statistics software package for education and data analysis. Palaeontologia Electronica, 2001, 4(1):1-9.
  • Румянцева М.Л., Мунтян В.С., Черкасова М.Е., Андронов Е.Е., Саксаганская А.С., Дзюбенко Е.А., Дзюбенко Н.И., Симаров Б.В. Сравнительный анализ геномных характеристик у референтных штаммов Sinorhizobium meliloti - симбионтов люцерны (обзор). Сельскохозяйственная биология, 2017, 52(5): 928-939 ( ).
  • DOI: 10.15389/agrobiology.2017.5.928rus
Еще
Статья научная