Аллельный дисбаланс в гене ТР53 у пациентов с диффузной В-крупноклеточной лимфомой - носителей rs78378222
Автор: Воропаева Елена Николаевна, Поспелова Татьяна Ивановна, Воевода Михаил Иванович, Маринкин Игорь Олегович, Максимов Владимир Николаевич, Агеева Татьяна Августовна, Березина Ольга Валерьевна, Колесникова Мария Александровна
Журнал: Сибирский журнал клинической и экспериментальной медицины @cardiotomsk
Рубрика: Клинические исследования
Статья в выпуске: 2 т.32, 2017 года.
Бесплатный доступ
Известно, что rs78378222 нарушает экспрессию гена ТР53 и приводит к снижению уровня индукции апоптоза в клетках под действием генотоксических факторов. Случаи обнаружения rs78378222 в опухолевой ткани ранее были описаны у больных ДВККЛ. Цель исследования: изучить частоту rs78378222 гена ТР53 в опухолевой ткани больных диффузной В-крупноклеточной лимфомы (В-ККЛ) г. Новосибирска. Материалом для исследования служила ДНК, выделенная методом фенольно-хлороформной экстракции с применением гуанидина из парафинизированных блоков биоптатов опухолевой ткани 92 больных диффузной В-ККЛ. Генотипирование rs78378222 проводилось методом ПЦР с анализом ПДРФ. Определение наличия редкого аллеля С rs78378222 выполнялось методом прямого секвенирования по Сенгеру. rs78378222 в опухолевой ткани ДВККЛ был выявлен в 9,8% случаев. В 5 образцах маркер встречался в гомозиготном состоянии, что свидетельствует о потере гетерозиготности в гене ТР53 в опухолевой ткани диффузной В-ККЛ. Ни в одном из опубликованных в настоящее время исследований, редкий аллель C rs78378222 в здоровой ткани не встречался в гомозиготном состоянии. Таким образом, явление потери гетерозиготности в гене ТР53 в опухолевой ткани больных диффузной В-ККЛ у носителей rs78378222 является примером классического “двух-ударного” механизма канцерогенеза.
Диффузная в-ккл, ген тр53, нетранслируемые последовательности гена, секвенирование по сенгеру, теория кнудсена, опухолевая прогрессия
Короткий адрес: https://sciup.org/14920191
IDR: 14920191
Список литературы Аллельный дисбаланс в гене ТР53 у пациентов с диффузной В-крупноклеточной лимфомой - носителей rs78378222
- Копнин Б.П., Копнин П.Б., Хромова Н.В. и др. Многоликий р53: разнообразие форм, функций, опухольсупрессирующих и онкогенных активностей//Клиническая онкогематология. -2008. -Т. 1, № 1. -С. 2-9.
- Поспелова Т.И., Воевода М.И., Воропаева Е.Н. и др. Значение конституциональных полиморфизмов гена Р53 у больных неходжкинскими злокачественными лимфомами//Бюллетень Сибирской медицины. -2008. -Т.7, № 3. -С. 56.
- Поспелова Т.И., Лосева М.И., Ковынев И.Б. и др. Основы опухолевой прогрессии гемобластозов//Сибирский научный медицинский журнал. -2004. -Т. 24, № 2. -С. 71-73.
- Avery-Kiejda K.A., Zhang X.D., Adams L.J. et al. Small molecular weight variants of p53 are expressed in human melanoma cells and are induced by the DNA-damaging agent cisplatin//Clin. Cancer Res. -2008. -Vol. 14. -P. 1659-1668.
- Diederichs S., Bartsch L., Berkmann J.C. et al. The dark matter of the cancer genome: aberrations in regulatory elements, untranslated regions, splice sites, non-coding RNA and synonymous mutations//EMBO Mol. Med. -2016. -Vol. 8, No. 5. -P. 442-57.
- Enciso-Mora V., Hosking F.J., Di Stefano A.L. A Low penetrance susceptibility to glioma is caused by the TP53 variant rs78378222//Br. J. Cancer. -2013. -Vol. 108. -P. 2178-2185.
- Gudkov A.V., Komarova E.A. The role of p53 in determining sensitivity to radiotherapy//Nat Rev Cancer. -2003. -Vol. 3, No. 2. -P. 117-129.
- International Cancer Genome Consortium, Hudson T.J., Anderson W. et al. International network of cancer genome projects//Nature. -2010. -Vol. 464. -P. 993-998.
- Li Y., Gordon M.W., Xu-Monette Z.Y. et al. Single nucleotide variation in the TP53 39 untranslated region in diffuse large B-cell lymphoma treated with rituximab-CHOP: a report from the International DLBCL Rituximab-CHOP Consortium Program//Blood. -2013. -Vol. 121, No. 22. -P. 4529-40.
- Liang Y., Lin S.Y., Brunicardi F.C. DNA damage response pathways in tumor suppression and cancer treatment//World J. Surg. -2009. -Vol. 33. -P. 661-666.
- Macedo G.S., Araujo Vieira I., Brandalize A.P. et al. Rare germline variant (rs78378222) in the TP53 3'UTR: Evidence for a new mechanism of cancer predisposition in Li-Fraumeni syndrome//Cancer Genetics. -2016. -Vol. 209. -P. 97-106.
- Stacey S.N., Sulem P., Jonasdottir A. et al. A germline variant in the TP53 polyadenylation signal confers cancer susceptibility//Nat. Genet. -2011. -Vol. 43, No. 11. -P. 1098-1103.
- Ventura A., Kirsch D.G., McLaughlin M.E. Restoration of p53 function leads to tumour regression in vivo//Nature. -2007. -Vol. 445, No. 7128. -P. 661-665.
- Wang Y., Wu X.S., He J. et al. A novel TP53 variant (rs78378222 A > C) in the polyadenylation signal is associated with increased cancersusceptibility: Evidence from a meta-analysis//Oncotarget. -2016. - DOI: 10.18632/oncotarget.9056
- Wang Z., Rajaraman P., Melin B.S. et al. Further Confirmation of Germline Glioma Risk Variant rs78378222 in TP53 and Its Implication in Tumor Tissues via Integrative Analysis of TCGA Data//Hum Mutat. -2015. -Vol. 36, No. 7. -P. 684-688.
- Zhou L., Qipeng Y., Ming Y. A functional germline variant in the P53 polyadenylation signal and risk of esophageal squamous cell carcinoma//Gene. -2012. -Vol. 506. -P. 295-297.
