Анализ метилирования генов SHOX2, TGFBR1, MIR-375 в различных типах рака легких
Автор: Ходырев Дмитрий Сергеевич, Кулагина Наталья Сергеевна, Бровкина Ольга Игоревна, Покровский Василий Евгеньевич, Гордиев Марат Гордиевич, Келехсаева Анжела Степановна, Никитин Алексей Георгиевич, Аверьянов Александр Вячеславович
Журнал: Клиническая практика @clinpractice
Рубрика: Оригинальные исследования
Статья в выпуске: 4 (28), 2016 года.
Бесплатный доступ
В 21 веке остро стоит проблема поиска эффективных и дешевых методов раннего выявления рака легких. Пациенты с подозрением на злокачественное заболевание легких, как правило, подвергаются клиническим исследованиям, таким как КТ-сканирование грудной клетки и бронхоскопия. Последнее преимущественно применяется для подтверждения диагноза. Тем не менее, даже когда признаки, симптомы и рентгенологические данные указывают на то, что клинический диагноз злокачественного заболевания легких является очевидным, требуются дополнительные инвазивные процедуры для получения биологического материала, пригодного для окончательного подтверждения наличия злокачественных клеток. В настоящее время есть четкое понимание необходимости поиска биомаркеров, способных на доклинической стадии выявлять клетки рака с помощью малоинвазивных процедур. В данной работе для образцов ДНК пациентов с различными типами рака легких, с целью лучшего понимания причин возникновения онкопатологии легких был проведен анализ метилирования генов SHOX2, TGFBR1 и MIR-375.
Рак легких, днк метилирование, микрорнк
Короткий адрес: https://sciup.org/143164613
IDR: 143164613
Список литературы Анализ метилирования генов SHOX2, TGFBR1, MIR-375 в различных типах рака легких
- Robertson K.D. DNA methylation and human disease. Nat Rev Genet 2005; 6: 597-610.
- Ting A.H., McGarvey K.M., Baylin S.B. The cancer epigenome-components and functional correlates. Genes Dev 2006; 20: 3215-3231.
- Shen H., Laird P.W. Interplay between the cancer genome and epigenome. Cell 2013; 153: 38-55.
- Suva` M.L., Riggi N., Bernstein B.E. Epigenetic reprogramming in cancer. Science 2013; 339: 1567-1570.
- Laird P.W. The power and the promise of DNA methylation markers. Nat Rev Cancer 2003; 3: 253-266.
- Schmidt B., Liebenberg V., Dietrich D., et. al. SHOX2 DNA methylation is a biomarker for the diagnosis of lung cancer based on bronchial aspirates. BMC Cancer 2010; 10: 600.
- Qian J., Massion P.P. Role of chromosome 3q amplification in lung cancer. J Thorac Oncol 2008; 3: 212-215.
- Shen H., Gao W., Wu Y.J., et. al. Multicolor fluorescence in situ hybridization and comparative genomic hybridization reveal molecular events in lung adenocarcinomas and squamous cell lung carcinomas. Biomed Pharmacother 2009; 63: 396-403.
- Dehan E., Ben-Dor A., Liao W., et. al. Chromosomal aberrations and gene expression profiles in non-small cell Lung Cancer. Lung Cancer 2007; 56: 175-184.
- Yen C.C., Liang S.C., Jong Y.J., et. al. Chromosomal aberrations of malignant pleural effusions of lung adenocarcinoma: different cytogenetic changes are correlated with genders and smoking habits. Lung Cancer 2007; 57: 292-301.
- Huang Y.T., Heist R.S., Chirieac L.R., et. al. Genome-wide analysis of survival in early-stage non-small-cell lung cancer. J Clin Oncol 2009; 27: 2660-2667.
- Dietrich D., Hasinger O., Liebenberg V., et. al. DNA methylation of the homeobox genes PITX2 and SHOX2 predicts outcome in non-small-cell lung cancer patients. Diagn Mol Pathol 2012; 21: 93-104.
- Schneider K.U., Dietrich D., Fleischhacker M., et. al. Correlation of SHOX2 gene amplification and DNA methylation in lung cancer tumors. BMC Cancer 2011; 11: 102.
- Schmidt B., Liebenberg V., Dietrich D., et. al. SHOX2 DNA methylation is a biomarker for the diagnosis of lung cancer based on bronchial aspirates. BMC Cancer 2010; 10: 600.
- Dietrich D., Kneip C., Raji O., et. al. Performance evaluation of the DNA methylation biomarker SHOX2 for the aid in diagnosis of lung cancer based on the analysis of bronchial aspirates. Int J Oncol 2012; 40: 825-832.
- Kneip C., Schmidt B., Seegebarth A., et. al. SHOX2 DNA methylation is a biomarker for the diagnosis of lung cancer in plasma. J Thorac Oncol 2011; 6: 1632-1638.
- Hong S., Noh H., Teng Y., et. al. SHOX2 Is a Direct miR-375 Target and a Novel Epithelial-to-Mesenchymal Transition Inducer in Breast Cancer Cells Neoplasia 2014; 16(4): 279-290.
- Shelling A.N. Mutations in inhibin and activin genes associated with human disease. Mol Cell Endocrinol 2012; 359(1-2): 113-120.
- Akhurst R.J., Hata A. Targeting the TGFβ signalling pathway in disease. Nat Rev Drug Discov 2012; 11(10): 790-811.
- Bottinger E.P., Jakubczak J.L., Roberts I.S., et al. Expression of a dominant-negative mutant TGF-beta type II receptor in transgenic mice reveals essential roles for TGF-beta in regulation of growth and differentiation in the exocrine pancreas. EMBO J. 1997; 16(10): 2621-33.
- Amendt C., Schirmacher P., Weber H., et. al. Expression of a dominant negative type ii tgf-beta receptor in mouse skin results in an increase in carcinoma incidence and an acceleration of carcinoma evelopment. Oncogene 1998; 17(1): 25-34.
- Ammanamanchi S., Brattain M.G. Restoration of transforming growth factor-{beta} signaling through receptor RI induction by histone deacetylase activity inhibition in breast cancer cells. J Biol Chem. 2004; 279(31): 32620-32625.
- Osada H., Tatematsu Y., Masuda A., et al. Heterogeneous transforming growth factor (TGF)-β unresponsiveness and loss of TGF-β receptor type II expression caused by histone deacetylation in lung cancer cell lines. Cancer Res. 2001; 61(22): 8331-8339.
- Rykov S.V., Khodyrev D.S., Pronina I.V., et. al. Novel miRNA genes methylated in lung tumors. Genetika 2013; 49(7): 896-901.
- Sobin L.H., Gospodarowicz M.K., Wittekind Ch. Eds. TNM Classification of Malignant Tumors, 7th ed. Wiley-Blackwell, Oxford 2009; 310 pgs.
- Travis W.D., Coby T.V., Corrin B., et. al. World Health Organization International Histological Classification of Tumours; histological typing of lung and pleural tumours. Springer 1999.
- Pasche B., Pennison M. J., Jimenez H., et. al. Transactions of the american clinical and climatological association 2014; 125.
- Dong Z., Guo W., Guo Y. et. al. Concordant promoter methylation of transforming growth factor-beta receptor types I and II occurs early in esophageal squamous cell carcinoma. Am J Med Sci. 2012; 343(5): 375-381.
- Guo W., Dong Z., Guo Y., et. al. Concordant repression and aberrant methylation of transforming growth factor-beta signaling pathway genes occurs early in gastric cardia adenocarcinoma. Mol Biol Rep. 2012; 39(10): 9453-9462.
