Анализ полиморфизма микросателлитных локусов ДНК рыжика посевного Camelina sativa
Автор: Логинова Е.Д., Рамазанова С.А.
Рубрика: Селекция, семеноводство и биотехнология сельскохозяйственных растений
Статья в выпуске: 4 (200), 2024 года.
Бесплатный доступ
Рыжик (Camelina sativa) - это двудольное масличное растение семейства Brassicaceae, родом из Южной Европы и Юго-Западной Азии. Рыжик требует меньше воды и удобрений и устойчив к вредителям и патогенам в отличие от других культур. Масло рыжика содержит ненасыщенные жирные кислоты: линоленовую, линолевую, олеиновую и эйкозеновую, имеет низкий уровень эруковой кислоты. Оно применяется в кормопроизводстве, производстве биодизеля, полимеров, лаков, олифы и красок, косметологии и пищевой промышленности. Для эффективного создания новых сортов рыжика необходимо изучать его генетическое разнообразие с помощью молекулярно-генетических методов, включая SSR-маркеры. Микросателлиты широко используются в анализе генома растений. Целью данной работы было изучение генетического разнообразия озимой и яровой форм рыжика селекции ВНИИМК с использованием новых экспериментальных SSR-маркеров. В работе изучали 18 сортообразцов рыжика посевного озимой и яровой форм из коллекции ВНИИМК и два образца сорта Крепыш. Генетическое разнообразие исследовали с помощью девяти SSR-маркеров. Продукты ПЦР детектировали методом капиллярного электрофореза на генетическом анализаторе Нанофор-05. В результате было выявлено 42 аллеля, от 2 до 7 на локус. Среднее эффективное число аллелей - 3,00. Среднее значение индекса полиморфного информационного содержания (PIC) - 0,66. Из 20 генотипов восемь не удалось отличить по девяти SSR-маркерам. Для их идентификации необходимо увеличить количество SSR-локусов. Образцы сорта Крепыш отличаются по семи локусам. Исследование показало генетическую неоднородность четырех сортов рыжика. Изучение внутрисортового полиморфизма у сортов рыжика посевного селекции ВНИИМК будет продолжено.
Рыжик посевной (camelina sativa), ssr-маркеры, микросателлиты, генетическое разнообразие, аллели, дендрограмма
Короткий адрес: https://sciup.org/142243661
IDR: 142243661 | DOI: 10.25230/2412-608X-2024-4-200-63-69
Список литературы Анализ полиморфизма микросателлитных локусов ДНК рыжика посевного Camelina sativa
- Popa A.L., Jurcoane Ş., Dumitriu B.Ş. Camelina sativa oil – a review // Scientific Bulle-tin, Series F. Biotechnologies. – 2017. – Vol. 21 – P. 233–238.
- Kim N., Li Y., Sun X.S. Epoxidation of Camelina sativa oil and peel adhesion properties // Industrial Crops and Products. – 2015. – Vol. 64. – Р. 1–8.
- Karvonen H.M. Aro A., Tapola N.S. [et al.]. Effect of [alpha]-linolenic acid [ndash] rich Camelina sativa oil on serum fatty acid composi-tion and serum lipids in hypercholesterolemic subjects // Metabolism Clinical and Experi-mental. – 2002. – Vol. 51. – No. 10. – P. 1253–1260.
- Chantsalnyam B., Otgonbayar C., Enkhtun-galag O. [et al.]. Physical and chemical character-istics and fatty acids composition of seeds oil iso-lated from Camelina sativa (L.) cultivated in Mongolia // Mongolian Journal of Chemistry. – 2013. – Vol. 14. – P. 80–83.
- Mondor M., Hernández‐Álvarez A.J. Came-lina sativa composition, attributes, and applica-tions: a review // European Journal of Lipid Sci-ence and Technology. – 2022. – Vol. 124. – No. 3. – Art. No. 2100035.
- Pecchia P., Russo R., Brambilla I. [et al.]. Biochemical seed traits of Camelina sativa – an emerging oilseed crop for biofuel: environmental and genetic influences // Journal of Crop Im-provement. – 2014. – Vol. 28. – No. 4. – P. 465–483.
- Zubr J. Dietary fatty acids and amino acids of Camelina sativa seed // Journal of Food Qual-ity. – 2003. – Vol. 26. – No. 6. – P. 451–462.
- Rokka T., Alеn K., Valaja J. [et al.]. The ef-fect of a Camelina sativa enriched diet on the composition and sensory quality of hen eggs // Food Research International. – 2002. – Vol. 35 (2). – P. 253–256.
- Vollmann J., Grausgruber H., Stift G. Ge-netic diversity in camelina germplasm as revealed by seed quality characteristics and RAPD poly-morphism // Plant Breeding. – 2005. – Vol. 124. – №. 5. – Р. 446–453.
- Ghamkhar K., Croser J., Aryamanesh N. [et al.]. Camelina (Camelina sativa (L.) Crantz) as an alternative oilseed: molecular and ecogeographic analyses // Genome. – 2010. – Vol. 53 (7). – P. 558–567.
- Kashi Y., Nave A., Darvasi A. [et al.]. How is it that microsatellites and random oligonucleo-tides uncover DNA fingerprint patterns // Mamm. Genome. – 1994. – Vol. 5. – Vol. 5. – P. 525–530.
- Ellegren H. Microsatellites: simple se-quences with complex evolution // Nature reviews genetics. – 2004. – Vol. 5. – №. 6. – Р. 435-445.
- Kalia R.K., Rai M.K., Kalia S. [et al.]. Mi-crosatellite markers: an overview of the recent progress in plants // Euphytica. – 2011. – Vol. 177 (3). – P. 309–334.
- Manca A., Galasso I. Development of sim-ple sequence repeat (SSR) markers in Camelina sativa (L.) Crantz // Minerva Biotec. – 2010. – Vol. 22. – P. 43–45.
- Базанов Т.А., Ущаповский И.В., Логи-нова Н.Н. [и др.]. Оценка генетического разнообразия сортов рыжика посевного (Camelina sativa L.) с использованием SSR-маркеров // Аграрная наука. – 2021. – №. 9. – С. 108–112.
- Nei M. Analysis of gene diversity in subdi-vided populations // Proc. of the National Acad-emy of Sciences USA. – 1973. – Vol. 70 (12). – Р. 3321–3323. DOI: 10.1073/pnas.70.12.3321.
- Hammer Ø., Harper D.A.T., Ryan P.D. Past: paleontological statistics software package for education and data analysis // Palaeontologia electronica. – 2001. – Vol. 4 (1). – Р. 1–9.
- Логинова Е.Д., Рамазанова С.А., Гучетль С.З. Проверка SSR-маркеров для геноти-пирования рыжика посевного // Актуальные проблемы науки и практики в исследованиях молодых ученых: сб. I-й междунар. науч.-практич. конф., Новосибирск, 21–22 мая 2024 г. – Новосибирск: ИЦ НГАУ «Золотой колос», 2024. – С. 11–15.
