Апробирование системы детекции целевых групп микроорганизмов для экологического мониторинга пресноводных экосистем
Автор: Белькова Наталья Леонидовна, Дзюба Елена Владимировна, Деникина Наталья Николаевна, Кондратистов Юрий Леонидович
Журнал: Известия Самарского научного центра Российской академии наук @izvestiya-ssc
Рубрика: Природопользование и мониторинг
Статья в выпуске: 1-9 т.14, 2012 года.
Бесплатный доступ
Актуальность использования молекулярно-генетических методов для проведения экологического мониторинга водных объектов обусловливает необходимость разработки методов количественной оценки состава микробных сообществ. Применение ДНК фага λ как внутреннего контроля показало, что для эффективного выделения суммарных нуклеиновых кислот из природных проб необходимо оценивать численность бактериальных клеток и анализировать концентрации, не превышающие 10 5–10 6 КОЕ/мл. ПЦР в реальном времени позволила выявить невысокие концентрации энтерококков в поверхностных водах природных пресных водоемов Восточной Сибири в летний период по калибровочным кривым, основанным на концентрациях клеточных суспензий в КОЕ/мл. Детекция спектра таксономических групп и сравнительный анализ их значений СТ характеризуют структуру микробных сообществ и могут быть использованы для мониторинга их состояния и прогноза его изменений.
Микробные сообщества, пресные водоемы, молекулярно-генетические методы, экологический мониторинг, специфичная амплификация в режиме реального времени
Короткий адрес: https://sciup.org/148201081
IDR: 148201081
Список литературы Апробирование системы детекции целевых групп микроорганизмов для экологического мониторинга пресноводных экосистем
- Environmental Microbiology: Current technology and water application. Eds. K. Sen, N.J. Ashbolt. -Norfolk: Caister Academic Press, 2011. 316 p.
- Руководство по медицинской микробиологии. Общая и санитарная микробиология. Книга 1/колл. Авторов//под ред. А.С. Лабинской, Е.Г. Волиной. -М.: Издательство БИНОМ, 2008. 1080 с.
- Дзюба, Е.В. Современные подходы и методология экологического мониторинга в условиях водоема и в аквакультуре/Е.В. Дзюба, Н.Л. Белькова, Н.Н. Деникина и др.//Известия Самарского научного центра РАН. 2009. Т. 11, №1(3). С. 466-471.
- Беликов, С.И. Молекулярная экология как основа современной методологической базы оценки состояния окружающей среды/С.И. Беликов, Н.Н. Деникина, Н.Л. Белькова и др.//Известия Самарского научного центра РАН. 2010. Т. 12, №1(4). С. 1103-1107.
- Newton, R.J. A Guide to the Natural History of Freshwater Lake Bacteria/R.J. Newton, S.E. Jones, A. Eiler et al.//Microbiol. Mol. Biol. Rev. 2011. Vol. 75, No. 1. P. 14-49.
- Белькова, Н.Л. Технологический потенциал унификации молекулярно-генетического анализа структуры и функционального статуса микробных сообществ для мониторинга и биоиндикации/Н.Л. Белькова, Н.Н. Деникина, Е.В. Дзюба, Е.В. Суханова//Всероссийская научная школа для молодежи «Инновации в биологии для развития биоиндустрии сельскохозяйственной продукции», 18-25 октября 2010 г. -Владивосток, 2010. С. 77-82.
- Белькова, Н.Л. Разработка системы праймеров разного уровня специфичности для определения состава и структуры микробных сообществ/Н.Л. Белькова, Е.Б. Матюгина, Н.Н. Деникина//Материалы II международной научно-практической конференции «Проблемы современной биологии». -М.: Изд-во «Спутник+», 2011. С. 74-79.
- Белькова, Н.Л. Введение в молекулярную экологию микроорганизмов: Учебно-методическое пособие/Н.Л. Белькова, А.М. Андреева. -Ярославль: Изд-во ООО «Принтхаус», 2009. 91 с.
- Frahm, E. Application of the fluorogenic probe technique (TaqMan PCR) to the detection of Enterococcus spp. and Escherichia coli in water samples/E. Frahm, U. Obst//J. Microbiol. Methods. 2003. Vol. 52. P. 123-131.
