Асимптотическое исследование транспортных процессов в корне растения
Автор: Юдина Е.Н.
Журнал: Российский журнал биомеханики @journal-biomech
Статья в выпуске: 2 (56) т.16, 2012 года.
Бесплатный доступ
На основе континуальной математической модели проведено асимптотическое исследование одномерной стационарной задачи о радиальном транспорте воды и растворенного в ней химического компонента в корне. Модель основана на представлении растительной ткани в виде твердого каркаса, заполненного двухфазной жидкостью (внеклеточной и внутриклеточной). Обе фазы содержат растворенное вещество. Рассматривается случай отсутствия барьера для перемещения внеклеточной жидкой фазы. Продемонстрирована высокая степень совпадения численного и асимптотического решений, что подтверждает пригодность используемого численного метода для рассматриваемой задачи.
Асимптотические методы, математические модели, транспортные процессы, многофазные среды
Короткий адрес: https://sciup.org/146216062
IDR: 146216062
Текст научной статьи Асимптотическое исследование транспортных процессов в корне растения
Модель транспорта воды и растворенных в ней веществ через неспециализированную растительную ткань необходима для обоснованного анализа различных гипотез об организации транспорта в корне и листе. Такой транспорт включает в себя непосредственный транспорт из клетки в клетку через соединительные канальцы в клеточной стенке (симпластный транспорт) и движение воды по внеклеточному пространству (апопластный транспорт).
Большинство авторов используют при решении частных задач упрощенные компартментальные модели, не имеющие отчетливого физического смысла и плохо поддающиеся обобщениям [5]. В [6] развит континуальный подход применительно к радиальному транспорту в корне. Проведено численное исследование этой континуальной модели, в результате которого было замечено, что модель содержит несколько малых параметров, в результате чего в решении появляются пограничные слои. В связи с этим в предлагаемой работе проведен асимптотический анализ модели, который позволил оценить отличие численного решения от асимптотического и провести контроль численного метода.
Постановка задачи
Аналогично работам [1, 3, 4, 7] будем рассматривать растительную ткань как пористую сплошную среду. Пористая среда состоит из двух жидких фаз, первая из которых находится во внутриклеточном пространстве, вторая – во внеклеточном, фильтрующихся через недеформируемый твердый каркас. Пусть внутриклеточная жидкость перемещается со скоростью U , а внеклеточная со скоростью V .
Юдина Елена Николаевна, м.н.с. Института механики МГУ, Москва
Давление внутриклеточной жидкости обозначим P 1 , внеклеточной жидкости – P 2 . Долю внутриклеточной жидкости в среде будем характеризовать объемной концентрацией α 1 , а внеклеточной жидкости – объемной концентрацией α 2 , которые будем полагать постоянными. Для размазанных плотностей внутриклеточной и внеклеточной жидких фаз получаем выражения: ρ 1 = ρ 1 * α 1 , ρ 2 = ρ * 2 α 2 , где через ρ 1* , ρ *2 обозначены истинные плотности этих фаз, которые считаем постоянными и равными одна другой. Предполагается, что в каждой фазе растворен обобщенный низкомолекулярный компонент с массовыми концентрациями C 1 и C 2 соответственно, способный перемещаться в среде как активными механизмами переноса через мембраны, так и путем конвекции и диффузии. Во внутриклеточной среде присутствие этого компонента ведет к возникновению осмотической силы, связанной с перемещением жидкости через распределенные клеточные мембраны.
Как показано в работе [7], важное значение играет наличие локализованного барьера (поясков Каспари) для перемещения жидкости и солей во внеклеточном пространстве. Наличие этого барьера приводит к появлению дополнительных пограничных слоев, и задача существенно усложняется. Поскольку нашей целью является проверка правильности численного метода, то будем решать задачу в отсутствии барьера. При написании уравнений и граничных условий следуем работе [7].
Рассмотрим одномерное течение на отрезке [0, lx] , т.е. пористая среда занимает область 0 ≤ x ≤ lx , где x = 0 – координата раздела среды с окружающей средой и x = lx – координата раздела среды с центральной областью, содержащей сосуды ксилемы.
α 1 ρ dU = L p (( P 2 - P 1 ) -σ 0 R ( C 2 - C 1 )), dx
α2ρ dV =-Lp((P2-P1)-σ0R(C2-C1)), dx dPdC
α1 1 = -kU + γ 1 , dxdx dP
α 2 = - mV ,
2 dx
d(ξC1U)
α1ρ = λ(C2 - C1) + JA + D1α1ρ dxdx
d(C2V)
α ρ = -λ ( C - C ) - J + D α ρ .
2 2 1 A 222
dxdx
Здесь R = ρ RT / µ s ( ρ – плотность жидкости; R – универсальная газовая постоянная; T – абсолютная температура; µ s – молярная масса растворенного вещества); σ 0 – коэффициент отражения мембраны; Lp – объемный коэффициент гидравлической проницаемости мембраны; λ – коэффициент проницаемости мембраны для растворенных веществ; JA – активный поток компонента; D 1 и D 2 – коэффициенты диффузии растворенного вещества во внутриклеточной и внеклеточной средах; k / α 1 и m / α 2 – коэффициенты гидравлических сопротивлений (обратные к коэффициентам гидравлических проводимостей); ξ и γ / α 1 – коэффициенты, характеризующие взаимодействие клеточной стенки с растворенным веществом.
Рассмотрим следующие граничные условия [7]. Будем считать, что концентрация внешнего раствора на входе ( x = 0 ), а также давления во внешней среде на входе и на выходе ( x = lx ) заданы. Полагая, что внеклеточная жидкость имеет непосредственный контакт с внешней средой и сосудами ксилемы, а поступление жидкости и растворенных веществ во внутриклеточную среду осуществляется путем массообмена только с внеклеточной жидкостью, ставим следующие условия на внешней и внутренней границах:
P 2 (0)= P 20 , U (0)=0,
dC 1 dx
=0, x =0
C 2 (0)= C 20 ,
P 2 ( l x )= P 2 x , U ( l x )=0,
dC 1 dx
=0, x=l
x
dC 2 dx
=0.
x = l x
Последнее условие означает чисто в сосуды ксилемы.
конвективный унос растворенного вещества
Перейдем к безразмерным переменным. В качестве характерных значений концентрации, давления, скорости и координаты выберем следующие величины:
J c = C + A , p = c R, v
2e λ
= γ ( c * - C 2 e )
klx
, l * = lx .
Введем безразмерные величины:
α 1 ρ v * α 2 ρ v *
,,
1 Lpl * c * R 2 Lpl * c * R 1
= λ l * , λ 2 ρα 1 v *
l *
1 A , 2 A
ρα v c
l *
ρα 2 v * c *
D = D
, 1 ,
v * l *
= λ l * , ρα 2 v *
D
D 2
2 , v * l *
kv l k = **, α 1 p *
mv l m = ,
α 2 p *
ζ = γ . α 1 c * R
В безразмерном виде система уравнений и граничных условий примет следующий вид:
A 1 du = P 2 - P 1 -σ 0 ( C 2 - C 1 ), dx
A2 = -P2 + P1 + σ0(C2 - C1), dx dP1
-
dx dP2 dx
ku +ζ dC 1, dx
- mv ,
d(ξC1u) =λ (C -C)+J +D dx 1 2 1 1 1
d ( C 2 v ) = dx
-
λ 2( C 2 - C 1) - J 2 + D 2
d 2 C 1 dx 2 , d 2 C 2 dx 2 ,
x =0: P 2 =0,
x =1: P 2 = P 21 ,
u=0, dC1 =0, C2 =C20, dx u = 0, dC1 = 0, dC2 = 0. dx dx
Аналогичная система была решена численно в работе [7]. Для этого была построена консервативно-неявная схема, которая решалась методом итераций. На каждой итерации использовался метод прогонки. Кроме того, в работе [7] были сделаны оценки, которые позволяют принять следующие выражения для коэффициентов:
4 4 D 3 1 4 3
A 1 = 8 , A 2 = 8, ' 8 , — = 8 , ^ = 8 , ^ = 1,
J 1 D 2
где 8 - малый параметр.
которой
будем искать асимптотическое
Получаем систему уравнений, для решение
8 4 u' = P 2 - P 1 - ( C 2 - C 1 ),
8 4 v' = - P 2 + P 1 + ( C 2 - C 1 ),
P1' = - ku + Z c' ,
v = -1 P 2 , m
8 3 ( C 1 u ) ' = X 1 ( C 2 - C 1 ) + J 1 + 8 3 c' ' , 8 4 ( C 2 v ) ' = -X 2 ( C 2 - C 1 ) - J 2 + C 2 '
со следующими граничными условиями:
u (0) =0, P 2 (0)=0, C 2 (0)= C 20 , C 1 (0)=0,
u (1) =0, P 2 (1)= P 21 , C 2 (1) =0, C 1 (1)=0. (2)
Поскольку коэффициент Z близок к 1, то множитель 1 -Z ~ O ( 8 ).
Асимптотическое решение
Приведем систему уравнений (1) к системе двух уравнений, исключая из нее переменные P 1, u , v , C 2 . Получим следующие уравнения для внеклеточного давления P 2 и внутриклеточной концентрации C 1 :
-( C 1 P 2 ) '-8 3 M 1 C 1 =
m
= X 1
^“
m
-
V m
Ар
P 2
r
P 2
V
( кА _ . )
+ 1 1 + — I P 2 -Z C 1 - kM 1 x + M 2
V m ) v
Г 84 "
— P 2
V m
= -X 2
-
81p
P 2
V m
+
+ J 1 +8 C 1 ,
1 к \
+ 1 1 + — I P 2 + (1 -Z ) C 1 - kM 1 x + M 2
V m )
( kA _ . )
+ 1 1 + — I P 2 -Z C 1 - kM 1 x + M 2
V m ) )
-^ P 2 IV V
V m
(kA " "
+ 1 1 +-I P 2 + (1 -Z ) C'
V m )
'
- J 2 +
Ввиду того что при получении системы дважды выполнялось интегрирование, уравнения включают две произвольных константы M 1 и M 2 . Система уравнений (3) представляет замкнутую систему относительно переменных C 1 и P 2 . Остальные неизвестные могут быть легко получены из исходной системы (1) при известных C 1 и P 2 .
Граничные условия (2) в переменных C 1 и P 2 имеют следующий вид:
P‘(0) = mM 1 ( 8 ), P 2 (0) = 0, p'(0) = m ( - C 20 + M 2 ( 8 ) + (1 -Z ) C 1 (0) ) , C (0) = 0,
8 (4)
P 2 ' (1) = mM 1 ( 8 ), P 2(1) = P 21, 8 4 P2' '(1) - m 2 M 1 ( 8 ) = 0, c' (1) = 0.
В связи с наличием в задаче малых параметров будем рассматривать асимптотическое поведение решения.
Внешнее решение будем искать в следующем виде:
P 2 ( x ) = Р 20 ( x ) + 8 2 P^( x ), C 1 ( x ) = C 1 0 ( x ).
При написании соотношений (5) принято допущение о структуре решения вблизи точек x = 0 и x = 1 , правомерность которого будет обоснована ниже.
Подставим решение (5) в систему (3). Воспользуемся тем фактом, что в исследуемой задаче в силу обезразмеривания выполнено соотношение X , J 2 = X 2 J 1 , что значительно упрощает выкладки. Окончательно получаем:
( Л.Л
P 2= ---- ( Z E 01 + kM 1 ) x + ZE 02 — M 2 — T1 +8 2 ( E 11 x + E J, _
k + m ( X1 J (6)
C1 = E01 x + E02, где E01, E02, E11, E12 – подлежащие определению константы.
Теперь построим решение вблизи границ x = 0 и x = 1 . Проведём анализ граничных условий, чтобы определить, как ведут себя производные.
Рассмотрим сначала граничные условия при x = 1 . Имеем
P 2(1) = mM 1 ( 8 ) = O (1), P 2 (1) = -^. (7)
Найдем толщину пограничного слоя вблизи x = 1 . Исходя из первого соотношения в (7) ищем решение в виде
P 2 = P 21 -5 P 2
x I , где 5 = 5 ( 8 ) < 1.
5 J
Из второго соотношения в условии (7) получаем, что 5 = 8 2 .
Как видно из оценки, во втором уравнении системы (3) не остаётся членов, содержащих C 1 , что позволяет найти P 2 из этого уравнения, а затем, используя это решение, найти C 1 из первого уравнения системы (3).
_ е 2 ~ 1 - x рА - р (x)
Сделаем замену переменных 5 = 8 , x = —— и P 2 ( x ) = ^1—-2—^. Из второго 8 2 8 2
уравнения системы (3) получаем:
( IV )
— P 2 -I 1 + — I P 2 =0.
m v m J
Решение этого уравнения имеет вид
'—'
P 2
__ _ - x^m + k . _ x^m + k . _ . л
= ^oe + a^e + a2 x + ^3, где a0, a1, a2, a3 - константы, подлежащие определению. Коэффициент a, = 0 находим из условия сращивания с внешним решением [2] для P2 из (6). С учётом граничного условия P2 (1) = P21 имеем следующее решение в пограничном слое вблизи x=1:
P2 = P21 -a2(1 -x)-s2a0 (e-“k(1-x>2 -1).(8)
Из граничных условий (7) имеем:
M 1=—(a 2-a0 V m + k), M 1= -^y (m + k )3/2.(9)
mm
Аналогично в пограничном слое вблизи x = 0 решение ищем в виде
P2= 5 P2I x I, v5 J где 5 = £2.
С учетом граничного условия P 2 (0) = 0 получаем
P 2 = p 2 x + £ 2 P 0 ( e - 'mkx / £ 2 - 1 ) , (10)
где P 0, P 2 - константы, подлежащие определению.
Из остальных граничных условий (7) при x = 0 следует:
m 1 = -( P 2 - P 0V m + I ), M 2 = c 20 + £ 2 P 0 m + k - (1 - Z ) C 1 (0). (11)
mm
Из сращивания (10) с внешним решением для P 2 из (6) на границе x = 0 получаем:
₽ 2 =---- 7 ( Z E 01 + kM 1 ) .
m + k
0 = Z E 02 - M 2 - J 1, Л 1
-P 0 = E 12 .
Из сращивания (8) с внешним решением для P 2 из (6) на границе x = 1 имеем:
a 2
m m+k
( Z E 01 + kM 1 ) ,
I I
P^-a2 = -m Z E02 - M2 - J1
21 2 02 2
m + k ^ л1 J a0 = E11 + E12.
Используя полученные выше соотношения, а также соотношения (9) и (11), находим
m
0 P21 , k\m + k
a 2 P 21 , P o P 21 , /------~,
P 2 P 21 ,
k^m + k
E 01 =0,
E
E 02
J 1 C 20 1 -Z
7Z Z Z
- 1 (0) - e 2
P 21 V m + k
Z k
P21mP
E11 2k4k + m’ E 12 kjk+m’
,, m + k ,, /гхх 2 V m + k n
M 1 = P " , M 2 = C 2o - (1 — Z ) C 1(0) - E " P 21.
mkk
Выпишем равномерно пригодное решение [2] для P 2 :
P ( x ) = P21x - e 2 P 21 m (2 x + e- 'mkx / E 2 - e mk ( x - 1)/ E 2 - 1
2 21 k^m + k\.
Теперь, используя решение (12) для P 2 , найдём решение для C 1 . Для этого подставим полученное решение в первое уравнение системы (3):
P 21 E 3 k
V m + k • x / e
I ^- V m + k (1 - x )/ e
—
V m + k
- 1
- 1 +
+E P "V m + k / e_ Jm + k • x / e 2 + e- V m + k (1 - x )/ e 2 C =
21 k ( e e ) 1
= e 3 c'' - X^ C - e 2 X! px m + k 2 x + X C 20 + JP 1 1 1 1 21 k 1 20 1
Рассмотрим следующее решение уравнения (13):
C = -20. + J L + o(1).
1 Z X 1 Z w
Следующее приближение не ищем, так как решение (14) удовлетворяет граничным условиям для C1 . Таким образом допущение (5) о структуре внешнего решения оправдано.
Отсюда найдем M 2 :
M 2 = C 20
-
1 -z
Z
к
)
J 1
— 20 + .
X 1 )
-
2 у m + k
E P 21 k
.
Получаем решение для u , v , P 1 , C 2 :
u = P 2L + P 2L ( e - ^m+k x / E 2 mk
, „T m + k ( x - 1)/ e2\ P21 ( m + k ) n„2 P21
+ e ---2E —, ,
/ mk k-jm + k
Pn Px -mxkmTkx / e 2
= ———— e mk
+ e^ m + k ( x - 1)/ e 2 ) + 2e 2
P 21 k^m + k
P =P Y-C
1 21 x 20
( П
1 - 7
к Z )
JP
+ + e 2 I e
X 1 Z V m + k к
- e^ m + k ( x - 1)/ e 2 + 2 x + m ) k )
C 2
^ 20 ^E
P.Zm + k
21 x .
k
Анализ асимптотического решения (12), (14), (15) показывает, что структура функций в пограничных слоях определяется безразмерными коэффициентами гидравлических сопротивлений m и k . Все параметры модели входят в асимптотическое решение: таким образом, модель не переопределена.
Сравнение асимптотического и численного решений
Результаты сравнения представлены для следующих значений параметров, соответствующих оценкам, данным в статье [7]:
λ 1 =2; λ 2 =0, 052; J 1 =1; J 2 =0,026; k =0,44; m =1; ζ =1; ε =0,1.
О 0,2 0,4 0,6 0,8 1
б
а
Рис. Сравнение распределений внутриклеточного давления ( а ) и внутриклеточной скорости ( б ) (сплошная линия – численное решение, пунктирная – асимптотическое)
На рисунке приведены результаты численного расчета и асимптотического анализа для внутриклеточного давления P 1 и внутриклеточной скорости u . Из графиков видно, что решения отличаются между собой не более, чем на ε . Результаты для внеклеточного давления P 2 , внеклеточной скорости v , внутриклеточной и внеклеточной концентраций C 1 и C 2 не приводятся, так как численное и асимптотическое решения совпадают с графической точностью.
Заключение
Найдено асимптотическое решение одномерной стационарной задачи о радиальном транспорте воды и растворенного в ней химического компонента в корне в предположении отсутствия барьера для перемещения внеклеточной жидкой фазы. Продемонстрирована высокая степень совпадения численного и асимптотического решений, что свидетельствует о корректности асимптотического подхода и подтверждает пригодность используемого численного метода для рассматриваемой задачи.
Благодарности
Работа выполнена при поддержке гранта РФФИ № 11-01-00774. Автор выражает благодарность А.В. Аксенову за внимание к работе.
Список литературы Асимптотическое исследование транспортных процессов в корне растения
- Логвенков С.А., Штейн А.А. Компартментальная модель поглощения воды корнями растения с учетом процессов на клеточном уровне//Российский журнал биомеханики. -2008. -Т. 12, № 4 (42). -С. 18-32.
- Найфе А.Х. Методы возмущений. -М.: Наука, 1986. -454 с.
- Штейн А.А., Юдина Е.Н. Математическая модель растущей растительной ткани как трехфазной деформируемой среды//Российский журнал биомеханики. -2011. -Т. 15, № 1 (51). -С. 42-51.
- Юдина Е.Н. Численное и аналитическое исследование радиального массопереноса в корне растения//Труды конференции-конкурса молодых ученых, 14-16 октября 2009 г. -М.: Изд-во Моск. ун-та, 2010. -С. 350-356.
- Murphy R. Some compartmental models of the root: steady-state behavior//J. Theor. Biol. -2000. -Vol. 207. -P. 557-576.
- Stein A.A., Logvenkov S.A., Chalyuk A.T. Mathematical modeling of the plant root as a water-pumping cellular system//Mathematical Modelling & Computing in Biology and Medicine/ed. V. Capasso. -Bologna: Soc. Ed. Esculapio, 2003. -P. 206-212.
- Stein A.A., Logvenkov S.A., Yudina E.N. Continual modeling of water uptake by plant roots//6th Plant Biomechanics Conference, November 16-21, 2009. -Cayenne, 2009. -P. 140-147.