Ассоциация полиморфного маркера rs1801282 гена PPARG Pro12Ala с сахарным диабетом 2-го типа в Новосибирской области и других популяциях
Автор: Бондарь Ирина Аркадьевна, Филипенко Максим Леонидович, Шабельникова Олеся Юрьевна, Соколова Екатерина Александровна
Журнал: Сибирский журнал клинической и экспериментальной медицины @cardiotomsk
Рубрика: Организация здравоохранения и общественное здоровье
Статья в выпуске: 2 т.29, 2014 года.
Бесплатный доступ
Сахарный диабет 2-го типа (СД2) относится к генетически гетерогенным, многофакторным заболеваниям, в патогенезе которого участвует инсулинорезистентность и дисфункция β-клеток. Цель исследования: проведение сравнительного анализа частоты ассоциации полиморфного маркера rs1801282 гена PPARG Pro12Ala с СД2 в Новосибирской области и других популяциях. Обследован 391 больной СД2 и 556 жителей Новосибирской области без нарушения углеводного обмена. Определение аллелей и генотипов проводилось с использованием технологии TaqMan, аллель специфичной ПЦР с детекцией результатов в режиме реального времени. Анализ распределения частоты аллели риска 12Pro полиморфного маркера rs1801282 гена PPARG в группе СД2 и группе контроля в Новосибирской области выявил достоверные различия (OR [CI95%]=1,43 [1,10-1,86], p=7x10 -3). Преобладающим генотипом среди жителей Новосибирской области являлся генотип Pro12Pro. Носительство аллеля риска 12Pro полиморфного маркера rs1801282 гена PPARG было ассоциировано с развитием СД2 в Новосибирской области, повышая риск его развития в 1,43 раза. Полученные данные соответствуют результатам генетических исследований в европейской популяции и отличаются от азиатской популяции. Частота аллеля 12Ala составила 17% и соответствовала распространенности в европейской популяции.
Сахарный диабет 2-го типа, генетика, инсулинорезистентность
Короткий адрес: https://sciup.org/14919942
IDR: 14919942
Текст научной статьи Ассоциация полиморфного маркера rs1801282 гена PPARG Pro12Ala с сахарным диабетом 2-го типа в Новосибирской области и других популяциях
Сахарный диабет 2-го типа (СД2) относится к генетически гетерогенным, многофакторным заболеваниям в патогенезе которого участвует инсулинорезистентность и дисфункция β -клеток. Споры о том, что из этих двух механизмов первично, идут до настоящего времени. По данным комиссии по лечению атеросклероза у взрослых, действующей в рамках национальной образовательной программы NCEP ATP III (National Cholesterol Education Program’s Adult Treatment Panel III), в Соединенных Штатах Америки распространенность инсулинорезистентно-сти среди больных СД2 составляет 80% [6]. На развитие инсулинорезистентности влияют генетические и фенотипические факторы (ожирение, артериальная гипертензия, дислипидемия, гиперурикемия). К одним из генов, определяющих чувствительность тканей к инсулину, относится ген, продуктом которого является рецептор, активируемый пролифератором пероксисом (PPARG), принадлежащий к суперсемейству ядерных рецепторов, входящих в группу факторов транскрипции. Его активация и связывание с ретиноидным рецептором Х формирует гетеродимер, взаимодействующий со специфическими последовательностями ДНК, которые кодируют белки, участвующие в метаболизме липидов и глюкозы [4]. Впервые взаимосвязь полиморфного маркера rs1801282 гена PPARG Pro12Ala, расположенного на хромосоме 3р25, с повышенным риском развития СД2 была описана в 1997 г. C.G. Yen с соавт [13]. Позже было показано, что лица гомозиготные по 12Pro отличаются более выраженной резистентностью к инсулину, ожирением, дислипидемией и гипертензией и имеют на 20% выше риск развития СД2 по сравнению с носителями аллеля 12Ala (OR=1.14 [1.08-1.2]) [4].
Несмотря на то, что влияние генетических детерминант на формирование инсулинорезистентности, по литературным данным, исследовано на жителях Китая и некоторых стран Европы и Америки, следует подчеркнуть, что каждая популяция имеет свой уникальный набор аллельных вариантов генов, и прямая экстраполяция результатов невозможна.
Цель исследования: проведение сравнительного анализа частоты ассоциации полиморфного маркера rs1801282 гена PPARG Pro12Ala с сахарным диабетом 2го типа в Новосибирской области и других популяциях.
Материал и методы
Обследован 391 больной СД2 (99 мужчин и 292 женщины, средний возраст – 59,6±8,5 лет, длительность СД2 составила 8,2±7,1 лет) на базе передвижного лечебнопрофилактического модуля в районах Новосибирской области. Проводилась оценка клинических и метаболических параметров. Исследованы: концентрация глюкозы и инсулина в крови, показатели липидного обмена. Для оценки функционирования β-клеток и инсулиноре-зистентности рассчитаны индексы HOMA-IR (Homeostasis model assessment–insulin resistance) и HOMA-β (homeostasis model assessment of β-cell function). Группа контроля представлена 556 жителями Новосибирской области без нарушений углеводного обмена. Генотипи- рование полиморфного маркера гена PPARG (rs1801282) проводили с помощью ПЦР в режиме реального времени с использованием конкурирующих TaqMan-зондов. Общий объем реакционной смеси составлял 25 мкл, смесь содержала 40–100 нг ДНК; 300 нМ каждого праймера (прямой праймер: 5’-CTCTTATGGGTGAAACTCTGG-3’, обратный праймер 5’-ATGAACACGATAGCAACGAG-3’); по 100 нМ TaqMan-зондов (для аллеля G 5’-R6G-CCTATTGACGCAGAAAGCGA-BHQ-3’ и для аллеля С 5’-FAM-CCTATTGACCCAGAAAGCGA-BHQ-3’); 200 мкМ-ные dNTP, амплификационный буфер, термостабильную Taq-полимеразу – 1 ед.акт./реакцию. Амплификация проводилась с помощью амплификатора CFX96 (Bio-Rad, США) в следующих условиях: начальная денатурация 3 мин при 96 °С; затем 50 циклов, включающих денатурацию при 96 °С – 8 с, отжиг праймеров и последующую элонгацию при 60 °С – 40 с (каждый шаг сопровождался регистрацией флуоресцентного сигнала в диапазонах, соответствующих интервалам флюоресценции флуорофоров FAM и R6G).
Для статистической обработки использованы пакеты статистики “GenABEL”, “Genetics” программного обеспечения R-project (. Соответствие равновесию Харди-Вайнберга оценивали с помощью точного теста Фишера. Отношение шансов (odds ratio, OR) оценивали с помощью логистического регрессионного анализа для четырех моделей наследования признака: генотипическая (df=2), аддитивная, доминантная рецессивная. Выбор наилучшей модели проводили на основании критерия Акаике – лучшей признавалась модель с наименьшим показателем критерия. Для оценки межгрупповых различий проводился дисперсионный анализ (ANOVA). Критический уровень значимости принимали равным 0,05.
Протокол исследования одобрен комитетом по этике Новосибирского государственного медицинского университета (протокол №52 от 19.03.2013). Перед включением в исследование все пациенты подписывали информированное согласие.
Результаты и обсуждение
Нами проведен анализ распределения частот аллелей и генотипов полиморфного маркера rs1801282 гена PPARG в группах СД2 и группы контроля среди жителей Новосибирской области. Частота аллеля риска 12Pro (аллель С) у больных СД2 составила 0,87, в группе контроля – 0,83. Распределение генотипов полиморфного маркера rs1801282 гена PPARG статистически значимо не отклонялось от равновесия Харди-Вайнберга ни в контроле, ни в группе больных СД2. Полиморфный маркер rs1801282 гена PPARG был ассоциирован с развитием СД2 у жителей Новосибирской области (OR=1,43, 95%C.I.=[1,10–1,86], p=7x10–3). Предрасположенность к СД2 наследовалась согласно аддитивной модели (табл. 1).
Проведенные ранее исследования на русской популяции продемонстрировали аналогичные результаты, носители аллеля риска 12Pro имели в 1,48 раз выше риск развития СД2 по сравнению с носителями аллеля 12Ala (аллель G)(OR[CI95%]=1.48[1.03-2,11], р=0,032 [2]. Наибо-
Таблица 1
Ассоциация полиморфного маркера rs1801282 гена PPARG c развитием СД2 у жителей Новосибирской области
Генотипы |
Количество |
Генотипическая модель OR, 95%C.I., p-value, AIC |
Аддитивная модель OR, 95%C.I., p-value, AIC |
Доминантная модель OR, 95%C.I., p-value, AIC |
Рецессивная модель OR, 95%C.I., p-value, AIC |
|
СД2 |
Контроль |
|||||
C/C |
299 |
382 |
2,01 [0,83–4,.88] p=0,12 |
|||
C/G |
85 |
156 |
1,40 [0,56–3,49] p=0,47 |
1,43 [1,10–1,86] p=7x10–3 |
1,84 [0,76–4,44] p=0,18 |
1,48 [1,10–1,99] p=9x10–3 |
G/G |
7 |
18 |
Генотип норма |
|||
Частота аллеля C |
0,87 |
0,83 |
AIC: 1282,4 |
AIC: 1280,4 |
AIC: 1286 |
AIC: 1281 |
РХВ |
0,65 |
0,67 |
Аллель риска C |
Примечание: РХВ – равновесие Харди–Вайнберга. В таблице приведен уровень статистической значимости соответствия равновесию Харди–Вайнберга, вычисленный с помощью точного теста Фишера. AIK – Akaike Information criterion (Информационный критерий Акаике). OR – odds ratio (отношение шансов); 95%C.I. – 95% доверительный интервал OR; p-value – уровень статистической значимости.
лее высокая ассоциация полиморфного маркера rs1801282 гена PPARG Pro12Ala с СД2 была выявлена у афроамериканцев, у которых у носителей аллеля риска 12Pro риск развития СД2 достигал 90% (OR[CI95%]=1,9[1,5–2,5] [7], и несколько реже встречалась в европейской популяции, носители аллеля риска 12Pro имели в 1,14 раз выше риск развития СД2 по сравнению с носителями аллеля 12Ala (OR[CI95%]=1,14[1,08–1,20] [3]. Исследования проведенные в Китае не выявили статистически значимой ассоциации наличия аллели 12Pro полиморфного маркера rs1801282 гена PPARG с риском развития СД2 [5].
В работе В.А. Потапова наличие генотипа Pro12Pro ассоциировалось с более высокими уровнем базального инсулина и индекса HOMA-IR по сравнению с носителями генотипов Pro12Ala и Ala12Ala [2]. В нашем исследовании проводился анализ клинических и метаболических параметров в группе больных СД: индекса массы тела (ИМТ), отношения окружности талии к окружности бедер (ОТ/ОБ), артериального давления (АД), уровня базального инсулина и глюкозы, параметров липидного обмена при различных генотипах данного полиморфного маркера. Выявлена тенденция к более высоким цифрам АД и низкому уровню ЛПВП у носителей генотипов Pro12Pro и Pro12Ala, однако достоверных различий клинических и метаболических параметров при различных генотипах полиморфного маркера rs1801282 гена PPARG в группе больных СД2 не обнаружено (табл. 2).
Частота аллеля риска 12Pro в разных популяциях варьирует от 79–99% [1]. Мы провели сравнительный анализ распределения частот аллелей и генотипов гена PPARG Pro12Ala в различных популяциях без нарушений углеводного обмена. Практически для всех популяций характерно преобладание генотипа Pro12Pro, однако имеются отличия в распространении аллеля 12Ala (табл. 3).
Нами выявлено, что у жителей Новосибирской области без нарушений углеводного обмена распространение аллеля 12Ala составило 17% и соответствовало европейской популяции (16–22%), в то время как у японцев и китайцев аллель 12Ala встречается значительно реже и составляет от 1 до 4%. [11].
Таким образом, проведенное нами исследование продемонстрировало, что преобладающим генотипом полиморфного маркера rs1801282 гена PPARG среди жителей Новосибирской области, как и в других популяциях, является генотип Pro12Pro. Частота аллеля 12Ala у людей
Таблица 2
Клинические и метаболические параметры при различных генотипах полиморфного маркера rs1801282 гена PPARG у больных СД2 в Новосибирской области
Параметры |
Генотипы |
р |
||
Pro12Pro |
Pro12Ala |
Ala12Ala |
||
Возраст дебюта СД2, лет |
50,7±9,1 |
49,5±10,5 |
50,7±12,3 |
0,088 |
Наследственность, % |
45% |
40% |
57% |
0,144 |
ИМТ, кг/м2 |
33,4±6,1 |
33,4±6,3 |
35,0±10,3 |
0,473 |
ОТ/ОБ |
0,95±0,06 |
0,94±0,06 |
0,87±0,02 |
0,331 |
АД, мм рт. ст. |
150,3/91,6 |
164,7/93,5 |
145,7/86,4 |
0,051 |
Глюкоза натощак, ммоль/л |
8,8±3,6 |
9,0±3,3 |
8,2±5,4 |
0,574 |
Глюкоза постпрандиальная, |
||||
ммоль/л |
9,5±3,1 |
10,1±2,8 |
9,1±2,9 |
0,881 |
Базальный инсулин, |
||||
mcIU/мл |
12,8±9,9 |
16,8±11,6 |
7,2±6,3 |
0,354 |
HOMA-IR |
4,3±3,4 |
6,0±3,6 |
5,2±3,2 |
0,458 |
Холестерин, ммоль/л |
5,8±1,6 |
5,7±1,5 |
5,2±1,6 |
0,990 |
Тригицериды, ммоль/л |
2,2±1,7 |
1,5±2,0 |
2,4±2,2 |
0,087 |
ЛПНП, ммоль/л |
3,8±1,4 |
3,6±1,4 |
3,4±1,1 |
0,424 |
ЛПВП, ммоль/л |
1,3±0,2 |
1,2±0,3 |
1,4±0,1 |
0,073 |
Таблица 3
Сравнительный анализ распределения частот аллелей и генотипов гена PPARG2 в Новосибирской области и других популяциях без нарушения углеводного обмена
Статья выполнена при поддержке гранта РФФИ 13-04-00520.
Список литературы Ассоциация полиморфного маркера rs1801282 гена PPARG Pro12Ala с сахарным диабетом 2-го типа в Новосибирской области и других популяциях
- Кайдашев И.П., Расин А.М., Шлыкова О.А. и др. Частота Про-12Ала полиморфизма гена РРМг2 в украинской популяции и его возможная связь с развитием метаболического синдрома//Цитология и генетика. -2007. -№ 5. -С. 43-47.
- Потапов В.А. Поиск генетических маркеров, определяющих предрасположенность к сахарному диабету 2-го типа: автореф. дис.. канд. биол. наук. -М., 2010. -24 с.
- Altshuler D., Hirschhorn J.N., Klannemark M. еt al. The common PPARgamma Pro12Ala polymorphism is associated with decreased risk of type 2 diabetes//Nat. Genet. -2000. -No. 26. -P. 76-80.
- Deeb S.S., Fajas L., Nemoto M. et al. A Pro12Ala substitution in PPARg2 associated with decreased receptor activity, lower body mass index and improved insulin sensitivity//Nat. Genet. -1998. -No. 20. -P. 284-287.
- Fu M., Chen H., Li X. et al. Association of Pro12Ala variant in peroxisome proliferator-activated receptor-gamma2 gene with type 2 diabetes mellitus//Chinese J. Med. Gen. -2002. -Vol. 19(3). -P. 234-238.
- Grundy S.M., Cleeman J.I., Merz C.N. et al. Implications of recent clinical trials for the National Cholesterol Education Program Adult Treatment Panel III guidelines//Circulation. -2004. -Vol. 110(2). -P. 227-239.
- Kao W.H., Coresh J., Shuldiner A.R. et al. Pro12Ala of the peroxisome proliferator-activated receptor-gamma2 gene is associated with lower serum insulin levels in nonobese African Americans: the Atherosclerosis Risk in Communities Study//Diabetes. -2003. -Vol. 52(6). -P. 1568-1572.
- Malecki T.M., Fray J., Klupa T. The Pro12Ala polymorphism of РРМг2 gene and susceptibility to type 2 diabetes mellitus in a Polish population//Diabetes Res. Clin. Pract. -2003. -Vol. 62(2). -P. 105-111.
- Mori H., Ikegami H., Kawaguchi Y. et al. Pro12Ala substitution in PPAR gamma: is associated with resistance to development of Diabetes in the general population: possible involvement in impairment of insulin secretion in individuals with type 2 Diabetes//Diabetes. -2001. -Vol. 50. -P. 891-894.
- Pinterova D., Cerna M., Kolostova K. еt al. The frequency of alleles of the Pro12Ala polymorphism in PPARgamma2 is different between healthy controls and patients with type 2 diabetes//Folia Biol. (Praha). -2004. -No. 5. -P. 153-156.
- Sanghera D.K., Blackett P.R. Type 2 Diabetes Genetics: Beyond GWAS//J. Diabetes Metab. -2012. -Vol. 3(05). -P. 2-17.
- Waters K.M., Stam D.O., Hassanein M.T. et al. Consistent association of type 2 diabetes risk variants found in Europeans in diverse racial and ethnic groups//PLoS Genet. -2010. -Vol. 6, Issue 8. -e1001078.
- Yen C.J., Beamer B.A., Negri C. et al. Molecular scanning of the human Peroxisome proliferator activated receptor g (hPPARg) gene in diabetic Caucasians: identification of a Pro12Ala PPARg2 missense mutation//Biochem. Biophys. Res. Commun. -1997. -Vol. 241. -P. 270-274.