Бактерии рода Bacillus, выделенные из почв района солеразработок

Автор: Ястребова О.В., Ананьина Л.Н., Плотникова Е.Г.

Журнал: Вестник Пермского университета. Серия: Биология @vestnik-psu-bio

Статья в выпуске: 9, 2008 года.

Бесплатный доступ

Из почв района солеразработок (г. Березники, Пермский край) методом накопительных культур выделено семь штаммов бактерий рода Bacillus. По результатам анализа REP- и BOX-ПЦР большинство выделенных штаммов входят в одну геномогруппу (I), штаммы SN501, И10b и И12b различаются между собой по REP- и BOX-ДНК профилям и выделены в три геномогруппы (II, III и IV, соответственно). Принадлежность штаммов SN501, И10b и И12b к разным геномогруппам подтверждена результатами рестрикционного анализа амплифицированных рибосомальных ДНК (ARDRA). Филогенетический анализ нуклеотидных последовательностей гена 16S рРНК показал, что штаммы И12b, И23 и И27 являются представителями рода Bacillus, штамм И10b принадлежит к роду Paenibacillus. Большинство штаммов растет при 9-11% NaCl в среде культивирования и в щелочных условиях (pH 7.0-9.0). Штамм Bacillus sp. SN501 растет на нафталине как единственном источнике углерода и энергии при концентрации NaCl 5%.

Еще

Короткий адрес: https://sciup.org/147204437

IDR: 147204437

Список литературы Бактерии рода Bacillus, выделенные из почв района солеразработок

Гавриш, Е.Ю. Три новых вида бревибактерий -Brevibacterium antiguum sp. nov., Brevibacterium aurantiacum sp. nov. и Brevibacterium permense sp. nov./Е.Ю. Гавриш, В.И. Краузова, Н.В. Потехина, С.Г. Карасев, Е.Г. Плотникова, О.В. Алтынцева, Л.А. Коростелева, Л.И. Евтушенко//Микробиология. 2004. Т. 73, ¢ 2. С. 218-225.
Маниатис, Т. Методы генетической инженерии/Т. Маниатис, Э. Фрич, Дж.Сэмбрук//Молекулярное клонирование. М.: Мир, 1984. 390с.
Методы общей бактериологии/пер. с англ.; под ред. Ф. Герхардт и др. Т. 1-3. М.: Мир, 1983.
Определитель бактерий Берджи/пер. с англ.; под ред. Дж. Хоулта и др. Т. 1, 2. М.: Мир, 1997.
Плотникова, Е.Г. Бактерии-деструкторы полициклических ароматических углеводородов, выделенные из почв и донных отложений района солеразработок/Е.Г. Плотникова, О.В. Алтынцева, И.А. Кошелева, И.Ф. Пунтус, А.Е. Филонов, Е.Ю. Гавриш, В.А. Демаков, А.М. Боронин//Микробиология. 2001. Т. 70, ¢ 1. С. 61-69.
Плотникова, Е.Г. Разнообразие и функционирование микроорганизмов из техногенных почв района солеразработок Верхнекамья/Е.Г. Плотникова, Л.Н. Ананьина, О.В. Ястребова, Д.О. Рыбкина//Биотехнология: состояние и перспективы развития: материалы конгресса. Ч. 2. М., 2007. С. 135.
Розанова, Е.П. Углеводородокисляющие бактерии и их активность в нефтяных пластах/Е.П. Розанова, Т.Н. Назина//Микробиология. 1982. Т. 51. С. 324-348.
Annweiler, E. Naphthalene degradation and incorporation of naphthalene-derived carbon into biomass by the thermophile Bacillus thermoleovorans/E. Annweiler, H.H. Richnow, G. Antranikian, S. Hebenbrok, C. Garms, S. Franke, W. Francke, W. Michaelis//Appl. Environ. Microbiol. 2000. Vol. 66. P. 518-523.
Ash, C. Phylogenetic heterogeneity of the genus Bacillus revealed by comparative analysis of small subunit -ribosomal RNA sequences/C. Ash, J.A.E. Farrow, S. Wallbanks, M.D. Collins//Lett. Appl. Microbiol. Vol. 13. P. 202-206.
Ash, C. Molecular identification of rRNA group 3 bacilli (Ash, Farrow, Wallbanks and Collins) using a PCR probe test/C. Ash, F.G. Priest, M.D. Collins//Antonie van Leeuwenhoek. 1993. Vol. 64. P. 253-260.
Doddamani, H.P. Biodegradation of phenanthrene by a Bacillus species/H.P. Doddamani, H.Z. Ninnekar//Curr. Microbiol. 2000. Vol. 41. P. 11-14.
Jukes, T.H. Evolution of protein molecules/T.H. Jukes, C.R. Cantor//Mamallian protein metabolism/Ed. H.N. Munro New York: Academic press. 1969. P. 21-132.
Lim, J.-M. Bacillus salarius sp. nov., a halophilic, spore-forming bacterium, isolated from a salt lake in China/J.-M. Lim, C.O. Jeon, S.-M. Lee, J.-C. Lee, L.-H. Xu, C.-L. Jiang, C.-J. Kim//Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2006. Vol. 56. P. 373-377.
Margesin, R. Potential of halotolerant and halophilic microorganisms for biotechnology/R. Margesin, F. Schinner//Extremophiles. 2001. Vol. 5. P. 73-83.
Nielsen, P. Phenetic diversity of alkaliphilic Bacillus strains; proposal for nine new species/P. Nielsen, D. Fritze, F.G. Priest//Microbiology. 1995. Vol. 141. P. 1745-1761.
Scortichini, М. Bacteria associated with hazelnut (Corylus avellana L.) decline are of two groups: Pseudomonas avellanae and strains resembling P. syringae pv. syringae/М. Scortichini, U. Marchesi, M.-P. Rossi, P.D. Prospero//Appl. Environ. Microbiol. 2002. Vol. 68. P. 476-484.
Shimura, M. Isolation and characterization of a thermophilic Bacillus sp. JF8 capable of degrading polychlorinated biphenyls and naphthalene/M. Shimura, G. Mukerjee-Dhar, K. Kimbara, H. Nagato, H. Kiohara, T. Hatta//FEMS Microbiol. Lett. 1999. Vol. 178. P. 87-93.
Stapleton, R.D. Catabolic and genetic diversity of degradative bacteria from fuel-hydrocarbon contaminated aquifers/R.D. Stapleton, N.G. Bright, G.S. Sayler//Microb. Ecol. 2000. Vol. 39. P. 211-221.
Thompson, J.D. CLUSTAL W: improving the sensitivity of progressive multiple sequence alignment through sequence weighting, position specific gap penalties and weight matrix choice/J.D. Thompson, D.G. Higgins, T.J. Gibson//Nucleic Acids Res. 1994. Vol. 22. P. 4673-4680.
van de Peer, Y. TREECON for Windows a software package for the construction and drawing of evolutionary trees for the Microsoft Windows environment/Y. van de Peer, R. DeWachter//Comput. Appl. Biosci. 1994. Vol. 10. P. 569-570.
Vargas, A.V. Bacillus bogoriensis sp. nov., a novel alkalophilic, halotolerant bacterium isolated from Kenyan soda lake/A.V. Vargas, O.D. Delgado, R. Hatti-Kaul, B. Mattiasson//Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2005. Vol. 55. P. 899-902.
Versalovic, J. Genomic fingerprinting of bacteria using repetitive sequence-based polymerase chain reaction/J. Versalovic, M. Schneider, F.J. de Bruijn, J.R. Lupski//Meth. Mol. Cell. Biol. 1994. Vol. 5. P. 25-40.
Zhuang, W.Q. Bacillus naphthalinovorans sp. nov. from oil-contaminated tropical marine sediments and its role in naphthalene biodegradation/W.Q. Zhuang, J.-H. Tay, A.M. Maszenan, S.T.L. Tay//Appl. Microbiol. Biotechnol 2002. Vol.58. P. 547-553.

Еще

Статья научная