Численное моделирование эволюции бактериальной популяции в легких человека
Автор: Пиль Н.Е., Чигвинцев В.М.
Журнал: Анализ риска здоровью @journal-fcrisk
Рубрика: Профилактическая медицина: актуальные аспекты анализа риска здоровью
Статья в выпуске: 1 (33), 2021 года.
Бесплатный доступ
Представлена математическая модель эволюции бактериальной популяции в легких человека с учетом динамики иммунных процессов для задачи оценки функционального повреждения легких. Численное моделирование процессов, происходящих в организме человека, рассматривается как один из инструментов для анализа и прогнозирования влияния факторов риска на здоровье. Представленный подход выполнен в рамках концепции многоуровневой модели организма человека, учитывающей взаимодействия между системами, а также функциональное состояние включенных в рассмотрение органов в условиях воздействия на них неблагоприятных факторов различного генеза. Ввиду сложности прямого моделирования структуры и процессов, происходящих в легких, из-за больших вычислительных ресурсов для описания последних используется модель пористой среды. В модель введена поврежденность легких, определяемая эволюционным уравнением. Уравнение описывает зависимость поврежденности от распределения инфильтрата и действия на клетки альвеол токсических веществ, выделяемых бактериями. Представлены некоторые результаты, характеризующие пространственное распределение концентраций компонентов иммунной системы и бактериальной популяции в ходе иммунного ответа. Проведенное исследование дает качественное представление о причинах количественного изменения бактериальной популяции при иммунной реакции организма в условиях воздействия различных факторов. Данный подход может быть использован для уточнения параметров существующих популяционных моделей распространения и течения бактериальных инфекций и построения долгосрочного прогноза эпидемиологической ситуации. Получаемые результаты могут быть полезны для проведения анализа риска инфекционных заболеваний, в том числе при воздействии на организм человека неблагоприятных факторов среды обитания.
Математическое моделирование, иммунный ответ, бактериальная популяция, выделение токсинов, функциональная поврежденность, легкие человека, пористая среда, течение многокомпонентной смеси
Короткий адрес: https://sciup.org/142229573
IDR: 142229573 | DOI: 10.21668/health.risk/2021.1.02
Список литературы Численное моделирование эволюции бактериальной популяции в легких человека
- Гребенев А.Л. Пропедевтика внутренних болезней. - М.: Медицина, 2001. - 592 с.
- Шкляр Б.С. Диагностика внутренних болезней. - Киев: Высшая школа, 1972. - 516 с.
- Математическая модель эволюции функциональных нарушений в организме человека с учетом внешне средо-вых факторов / П.В. Трусов, Н.В. Зайцева, Д.А. Кирьянов, М.Р. Камалтдинов, М.Ю. Цинкер, В.М. Чигвинцев, Д.В. Ла-нин // Математическая биология и биоинформатика. - 2012. - Т. 7, № 2. -С. 589-610.
- К оценке дополнительного риска заболеваний желудочно-кишечного тракта, ассоциированных с дисбиозом кишечной микрофлоры вследствие воздействия остаточных концентраций тетрациклина в пищевых продуктах / Н.В. Зайцева, П.З. Шур, А.И. Аминова, Д.А. Кирьянов // Здоровье населения и среда обитания. - 2012. - Т. 232, № 7. - С. 46-48.
- Регуляция противовирусного иммунного ответа организма: математическая модель, качественный анализ, результаты / П.В. Трусов, Н.В. Зайцева, В.М. Чигвинцев, Д.В. Ланин // Математическая биология и биоинформатика. -2018. - Т. 13, № 2. - С. 402-425.
- Трусов П.В., Зайцева Н.В., Цинкер М.Ю. О моделировании течения воздуха в легких человека: конститутивные соотношения для описания деформирования пористой среды // Вестник Пермского национального исследовательского политехнического университета. Механика. - 2020. - № 4. - С. 165-174.
- Monod J. The growth of bacterial cultures // Annual Review of Microbiology. - 1949. - Vol. 3. - P. 371-394. DOI: 10.1146/annurev.mi.03.100149.002103
- Limit cycles of Norwegian lemmings: tensions between phase-dependence and density-dependence / E. Framstad, N.C. Sten-seth, O.N. Bjornstad, W. Falck // Phil. Trans. R. Soc. Lond. B. - 1997. - Vol. 264, № 1378. - P. 31-38. DOI: 10.1098/rspb.1997.0005
- Бутов А.А., Егоров А.Г. Модель динамики численности однотипной популяции в пространстве и времени // Вестник Кемеровского государственного университета. - 2015. - Т. 64, № 4-3. - С. 121-127.
- Hong M., Xiaojuan Z. Microbial growth modeling and simulation based on cellular automata // Research Journal of Applied Sciences, Engineering and Technology. - 2013. - Vol. 6, № 11. - P. 2061-2066. DOI: 10.19026/RJASET.6.3824
- Modeling evolution of spatially distributed bacterial communities: a simulation with the haploid evolutionary constructor / A.E. Klimenko, Y.G. Matushkin, N.A. Kolchanov, S.A. Lashin // BMC Evolutionary Biology. - 2015. - Vol. 15, № 1. - P. 1-11. DOI: 10.1186/1471-2148-15-S1-S3
- 3D individual based for bacteria growth and spatial interactions: application to the case of Listeria Monocytogenes and Carnobacterium Piscola / F. Harrouet, G. Desmeulles, P. Redou, L. Guabert // Jan Van Impe. Food Sim. - 2016. - P. 6.
- Гинак А.И., Кузнецова С.Н., Милованович Е.В. Моделирование биохимических процессов в призабойной зоне скважины // Известия Санкт-Петербургского государственного технологического института. - 2012. - Т. 41, № 15. -С. 82-83.
- Холодонов В.А., Лукина М.В., Милованович Е.В. Моделирование биотехнологических и фильтрационных процессов повышения нефтеотдачи пластов // Известия Санкт-Петербургского государственного технологического института. - 2011. - Т. 37, № 11. - С. 69-71.
- Марчук Г.И. Математические модели в иммунологии. Вычислительные методы и эксперименты. - М.: Наука, 1991. - 304 с.
- Левченко О.Ю. Математическое моделирование противобактериального иммунного ответа // Политематический сетевой электронный научный журнал кубанского государственного аграрного университета. - 2011. - № 66. -С. 60-71.
- Smith A.M., McCullers J.A., Adler F.R. Mathematical model of a three-stage innate immune response to a pneumococcal lung infection // Journal of Theoretical Biology. - 2011. - Vol. 7, № 276 (1). - P. 106-116. DOI: 10.1016/j.jtbi.2011.01.052
- Кузнецов С.Р. Математическая модель иммунного ответа // Вестник Санкт-Петербургского университета. Прикладная математика. Информатика. Процессы управления. - 2015. - № 4. - С. 72-87.
- Lambert A.R. Regional deposition of particles in an imagebased airway model: CFD simulation and left-right lung ventilation asymmetry. - Iowa: University of Iowa, 2010. - P. 68.
- De Groot C.T., Straatman A.G. A conjugate fluid-porous approach for simulating airflow in realistic geometric representations of the human respiratory system // Journal of Biomechanical Engineering. - 2016. - Vol. 138, № 3. - P. 4032113. DOI: 10.1115/1.4032113
- DeGroot C.T., Straatman A.G. Towards a porous media model of the human lung // 4th International Conference on Porous Media and its Applications in Science: AIP Conference Proceedings. - 2012. - Vol. 1453, № 1. - P. 69-74. DOI: 10.1063/1.4711155
- Вейбель Э.Р. Морфометрия легких человека. - М.: Медицина, 1970. - 175 с.
- Weibel E.R. What makes a good lung? // Swiss Med. Wkly. - 2009. - Vol. 139, № 27-28. - P. 375-386.