Факторы микробиома кишечника предиктор инфекций в гематологии



Стома И. О.1, 2, Карпов И. А.1, Усс А. Л.3

• ¹    Учреждение образования «Белорусский государственный медицинский университет», г. Минск, Республика Беларусь

• ²    Мемориальный онкологический центр им. Слоуна-Кеттеринга, г. Нью-Йорк, США

• ³    Республиканский центр гематологии и пересадки костного мозга на базе Учреждения здравоохранения «9-я городская клиническая больница» г. Минска, Республика Беларусь

ФАКТОРЫ МИКРОБИОМА КИШЕЧНИКА ^

Введение . До настоящего времени представление о значительной части инфекций у пациентов с сопутствующими гематологическими заболеваниями было основано на экзогенном инфицировании.В данном обширном клиническом исследовании представлены результаты исследования показателей микробиома кишечника как фактора развития инфекций кровотока у иммунокомпрометированных пациентов.

Цель . Определить характеристики кишечного микробиома, ведущие к развитию инфекций кровотока, на клинической модели пациентов с иммуносупрессией.

Материалы и методы . В исследование проспективно было включено 765 взрослых пациентов, перенесших 785 процедур аллогенной трансплантации гемопоэтических стволовых клеток (ТГСК) за период с 2012 по 2018 годы. ПЦР-амплификация V4-V5 региона гена 16S рРНК выполнялась с помощью модифицированных универсальных бактериальных прайме-ров,при этом в этап секвенирования и анализа было включено 5988 образцов стула пациентов. За первичный исход в анализе было принято развитие инфекции кровотока после аллогенной ТГСК. Для обработки и анализа объёмного массива данных авторами был подготовлен и валидирован программный код на языке R, а также применены методы линейного дискриминантного анализа размера эффекта (LEfSe), время-зависимая модель регрессионного анализа.

Результаты . Доминирование типа Проте-обактерии в спектре кишечного микробиома выше уровня 30 % было показано как независимый фактор развития грамотрицательных

ПРЕДИКТОР ИНФЕКЦИЙ В ГЕМАТОЛОГИИ инфекций кровотока,с наибольшим эффектом доминирования E. coli, Klebsiella spp. и сохраняющимся отрицательным клиническим эффектом доминирования на различных таксономических уровнях (класс Гамма-протеобактерии и семейство Энтеробактерии). Независимый защитный эффект фторхинолонов против доминирования Протеобактерий был показан во время-зависи-мом многовариантном анализе (ОР 0,50; 95 % ДИ 0,26–0,97, p = 0,041), в то время как другие антибиотики (β-лактамы, метронидазол, ванкомицин и линезолид) не оказали статистически значимого влияния на риск кишечного доминирования Протеобактерий у пациентов после аллогенной ТГСК.

Выводы . Увеличение относительного количества Протеобактерий в кишечнике предшествует и является звеном патогенеза развития грамотрицательных инфекций кровотока у пациентов с иммуносупрессией, при этом эффект носит видоспецифический характер и сохраняется на всех таксономических уровнях. Впервые полученные результаты меняют представление о патогенезе грамотрицательных инфекций кровотока и позволяют разработать на основе микробиома человека практические методы профилактики и лечения инфекционных осложнений в гематологии, онкологии, трансплантологии. Профилактическое использование фторхинолонов у пациентов с нейтропенией на фоне химиотерапии и кондиционирования при ТГСК снижает риск доминирования Про-теобактерий в кишечнике у пациентов,что является фактором снижения частоты грамо-трицательных инфекций кровотока.