Фенотипические и молекулярно-генетические методы определения антибиотикорезистентности микроорганизмов в ветеринарии

В статье представлены научные подходы к решению глобальной проблемы, а именно возрастающей антибиотикорезистентности среди условно-патогенных и слабопатогенных микроорганизмов, которые представляют значительный риск как в гуманной медицине, так и в животноводстве. В этой связи представлены фенотипические, аналитические и молекулярные методологические методы определения и изучения антибиотикорезистентности микроорганизмов. Из фенотипических методов широкое применение получил метод стандартных дисков и метод серийных разведений, которые основаны на диффузии антибактериальных препаратов из носителя на плотную питательную среду и ингибировании роста исследуемой культуры микроорганизма. Среди аналитических методов выявления антибиотикорезистентности выделяют электрофоретические, иммунохимические (иммунохроматография), УФ и масс-спектрометрию. Наиболее перспективным и эффективным является масс-спектрометрия, в частности тест MALDI-TOF, наиболее оптимальный для рутинного определения чувствительности ряда культур микроорганизмов. Молекулярной подход, а именно применение ПЦР с использованием молекулярных маяков и ДНК генов, расширяет возможность мониторинга резистентности микроорганизмов, позволяет по наличию генов резистентности определить механизм формирования устойчивости к антибактериальным препаратам. Проведенный анализ методических подходов позволяет выявить следующие детерминанты резистентности: карбапенемазы у Enterobacterales spp, P. aeruginosa и Acinetobacter; В-лактамазы расширенного спектра у Enterobacterales; mcr- опосредованной кодируемой устойчивости к полимиксинам у грамотрицательных микроорганизмов; mecA/mecC - опосредованной резистентности к беталактамам у S.aureus и vanA/vanB - опосредованной устойчивости к гликопептидам у E. faecium и E. faecalis. Анализ данных доступных научных публикаций позволяет констатировать, что различные методические подходы обеспечивают разную точность указания вариантов детерминант резистентности. Необходимо отметить, что наличие нескольких баз данных генов устойчивости к антибиотикам создает трудности в их использовании для определения фенотипа чувствительности к препаратам. Вместе с тем использование данных геномики для определения резистентности к антибиотикам имеет решающее значение для развития клинической метагеномики.