Генетическая дифференциация на основании полиморфизма микросателлитных маркеров популяций тополя черного на Среднем и Южном Урале

Проанализированы основные методы определения генетической дифференциации популяций древесных видов растений на основании полиморфизма молекулярных маркеров, таких как SSR (Simple Sequence Repeat)-PCR маркеры. С использованием четырех методов установлено генетическое расстояние между четырьмя изученными популяциями Populus nigra L. на Урале. Наибольшее генетическое расстояние ( D =1,086), определенное по методам Дж. Рейнольдса, Б. Вейра и С. Кокерхэма, отмечено между популяцией P.nigra около г. Стерлитамак Республики Башкортостан и популяцией ООПТ «Спасская гора» Пермского края. Наименьшее генетическое расстояние ( D =0,036), определенное по методу Л. Кавалли-Сфорца и А. Эдвардса, установлено между популяциями около г. Стерлитамак и около г. Инзер Республики Башкортостан. При сравнении методов кластеризации, таких как метод невзвешенных парногрупповых средних (UPGMA), метод ближайшего соседа (Neighbor Joining Method)» и метод взвешенных наименьших квадратов по критерию Фитч-Марголиаша, выявлено, что для определения генетической дифференциации изученных популяций P. nigra с использованием полиморфизма кодоминантных маркеров, наиболее оптимален метод Л. Кавалли-Сфорца и А. Эдвардса. При кластеризация в программе STRUCTURE 2.3.4 изученные популяции P. nigra разделились на 2 кластера: популяции из Республики Башкортостан и популяция из Пермского края. Установлена высокая корреляция между генетической дифференциацией и географическим расстоянием изученных четырех популяций P. nigra на основании теста Мантела. Показана высокая корреляция между генетическим и географическим расстоянием у изученных популяций P. nigra, так как высок коэффициент детерминации (R 2) показателя генетической дифференциации (0,694 по методу С. Райта, 0,787 по методу М. Нея).