Генетическая гетерогенность острых лейкозов с перестройкой T(10;11) (P12;Q21)/PICALM::MLLT10 у детей

– в интронах с 3 по 9. Структура PICALM::MLLT10 была более гетерогенной у ОМЛ, чем у Т-ОЛЛ (6 вариантов транскрипта против 3). Преобладающего варианта транскрипта не было выявлено ни при одной нозологии. При анализе сопутствующих мутаций в данных полного экзома и транскриптома (n=38) выявили от 0 до 4 патогенных экзонных либо сплай-синг-ассоциированных соматических вариантов на образец, медиана 1,5. Наиболее часто были затронуты гены белков семейства RAS (NRAS, n=14; HRAS, n=2; HRAS, n=1) Также были выявлены мутации в PTPN11 (n=3), MTOR (n=2), JAK-киназы (n=2), IKZF1 (n=2), NOTCH1 (n=2) и CDKN2A и TP53 (n=1 каждого). При этом ассоциации спектра дополнительных мутаций с линейной принадлежностью ОЛ не наблюдалось. Клональные перестройки TCR и/или IGH были обнаружены у всех исследованных Т-ОЛЛ (n=12 из 12) и у большинства ОМЛ (n=8 из 12). Практически все образцы с мажорными клонами имели перестройки D-цепи, что говорит об их раннем происхождении. В результате анализа дифференциально экспрессирующихся генов оказалось, что PICALM::MLLT10-ассоциированные ОЛ характеризуются повышенной экспрессией генов HOXA-кластера, особенно HOXA3 и HOXA5. Наиболее существенное снижение экспрессии при ОЛ по сравнению с нормой показали ген длинной некодирующей РНК LINC00472 (опухолевый супрессор, для которого было показано подавление адгезии, миграции и инвазии при некоторых типах рака) и ген металлопротеиназы внеклеточного матрикса ADAM23, для которой было показано участие в диссеминации опухолевых клеток при раке молочной железы.

Выводы. PICALM::MLLT10-ассоциированные ОЛ характеризуются высокой гетерогенностью химерного гена, малой мутационной нагрузкой с преимущественным вовлечением RAS- пути, наличием клональных перестроек TCR и IGH как в Т-ОЛЛ, так и в ОМЛ, а также увеличением экспрессии генов HOXA3 и

HOXA5 и уменьшением экспрессии генов LINC00472 и ADAM23. Исследование выполнено за счет гранта РНФ №22-25-00367.