Генетическая структура и межпопуляционная дифференциация восьми популяций Pinus sylvestris L. на Восточно-Европейской равнине
Автор: Сбоева Яна Викторовна, Боронникова Светлана Витальевна
Журнал: Бюллетень науки и практики @bulletennauki
Рубрика: Биологические науки
Статья в выпуске: 12 т.5, 2019 года.
Бесплатный доступ
Изучение генетической структуры и дифференциации восьми популяций Pinus sylvestris L. на Русской равнине показало, что на наименьшем генетическом расстоянии расположены популяции PsI и PsII ( D =0,066), а на наибольшее генетическое расстояние отмечено между популяциями PsI и PsIV ( D =0,308). На дендрограмме изученные популяции сформировали четыре кластера: PsI и PsII; PsIII и PsIV; PsV и PsVI; PsVII и PsVIII. Анализ генетической структуры восьми популяций P. sylvestris показал, что ожидаемая доля гетерозиготных генотипов ( HT ) на общую выборку составила 0,320, ожидаемая доля гетерозиготных генотипов в отдельной популяции по всем локусам ( HS ) равна 0,170, поэтому показатель подразделенности популяций ( GST ) высок и составил 0,468. Изученные популяции сильно дифференцированы, так как на межпопуляционную компоненту приходится 46,8% генетического разнообразия. У всех изученных популяций показатель h имеет значения меньше 0,3. Анализ доли редких аллелей показал, что генетическая структура менее сбалансирована в популяциях PsIII ( h =0,254) и PsIV ( h =0,273). Наиболее сбалансирована генетическая структура в популяциях PsVII ( h =0,112) и PsVIII ( h =0,127). Данные о генетической структуре и дифференциации популяций сосны обыкновенной необходимо учитывать при разработки рекомендаций для сохранения их генофондов
Issr-pcr маркеры, генетическая структура, внутрипопуляционная изменчивость, межпопуляционная изменчивость
Короткий адрес: https://sciup.org/14115219
IDR: 14115219 | DOI: 10.33619/2414-2948/49/10
Список литературы Генетическая структура и межпопуляционная дифференциация восьми популяций Pinus sylvestris L. на Восточно-Европейской равнине
- Петрова Е. А., Велисевич С. Н., Политов Д. В., Белоконь М. М., Белоконь Ю. С., Горошкевич С. Н. Распределение аллозимной изменчивости у кедра сибирского: три уровня разнообразия // Хвойные бореальной зоны. 2010. Т. 27. №1-2. С. 160-168.
- Алтухов Ю. П. Генетические процессы в популяциях. М.: Академкнига, 2003. 431 с.
- Макеева В. М., Смуров А. В., Политов Д. В., Белоконь М. М., Белоконь Ю. С., Суслова Е. Г. Оценка состояния генофонда и жизнеспособности лесопосадок ели европейской (Picea abies (L.) Karst.) из парков города Москвы и Подмосковья // Леса России: политика, промышленность, наука, образование: материалы 3 международной научно-технической конференции (23-24 мая 2018 г., Санкт-Петербург), 2018. С. 187-190.
- Zietkiewicz E., Rafalski A., Labuda D. Genome fingerprinting by simple sequence repeat (SSR)-anchored polymerase chain reaction amplification // Genomics. 1994. V. 20. №2. P. 176-183. DOI: 10.1006/geno.1994.1151
- Боронникова С. В. Молекулярное маркирование и генетическая паспортизация ресурсных и редких видов растений с целью оптимизации сохранения их генофондов // Аграрный вестник Урала. 2009. №2. С. 57-59.
- Yeh F. C., Yang R. C., Mao J., Ye Z., Boyle T. J. POPGENE, the Microsoft Windows-based user-friendly software for population genetic analysis of co-dominant and dominant markers and quantitative traits // Dept. Renewable Resources, University of Alberta, Edmonton, Canada. 1996.
- Nei M. Molecular population genetics and evolution. North-Holland Publishing Company, 1975. PMID:
- ISBN: 31329574
- Nei M. Genetic distance between populations // The American Naturalist. 1972. V. 106. №949. P. 283-292.
- DOI: 10.1086/282771
- Животовский Л. А. Показатель внутрипопуляционного разнообразия // Журнал общей биологии. 1980. Т. 41. №6. С. 828-836.
- Nei M., Li W. H. Mathematical model for studying genetic variation in terms of restriction endonucleases // Proceedings of the National Academy of Sciences. 1979. V. 76. №10. P. 5269-5273.
- DOI: 10.1073/pnas.76.10.5269
- Лакин Г.Ф. Биометрия. М.: Высш. школа, 1973. 343 с.
- Falush D., Stephens M., Pritchard J. K. Inference of population structure using multilocus genotype data: linked loci and correlated allele frequencies // Genetics. 2003. V. 164. №4. P. 1567-1587. PMID:
- ISBN: 12930761
- Smulders M. J. M., Van Der Schoot J., Arens P., Vosman B. Trinucleotide repeat microsatellite markers for black poplar (Populus nigra L.) // Molecular Ecology Notes. 2001. V. 1. №3. P. 188-190.
- DOI: 10.1046/j.1471-8278.2001.00071.x
- Earl D. A. STRUCTURE HARVESTER: a website and program for visualizing STRUCTURE output and implementing the Evanno method // Conservation genetics resources. 2012. V. 4. №2. P. 359-361.
- DOI: 10.1007/s12686-011-9548-7
- Evanno G., Regnaut S., Goudet J. Detecting the number of clusters of individuals using the software STRUCTURE: a simulation study // Molecular ecology. 2005. V. 14. №8. P. 2611-2620.
- DOI: 10.1111/j.1365-294X.2005.02553.x
- De Rosa R. L., Earl D. A., Bierwagen G. P. Statistical evaluation of EIS and ENM data collected for monitoring corrosion barrier properties of organic coatings on Al-2024-T3 // Corrosion Science. 2002. V. 44. №7. P. 1607-1620.
- DOI: 10.1016/S0010-938X(01)00173-1
- Семериков В. Л., Семерикова С. А., Дымшакова О. С., Зацепина К. Г., Тараканов В. В., Тихонова И. В.,.. Кальченко Л. И. Полиморфизм микросателлитных локусов хлоропластной ДНК сосны обыкновенной (Pinus sylvestris L.) в Азии и Восточной Европе // Генетика. 2014. V. 50. №6. P. 660-660.
- DOI: 10.7868/S0016675814040122