Гены, кодирующие протеасомные белки
Автор: Дутченко А.П., Шатобалов Я.И.
Журнал: Форум молодых ученых @forum-nauka
Статья в выпуске: 8 (84), 2023 года.
Бесплатный доступ
Протеасома 26S состоит из 33 отдельных субъединиц, каждую из которых кодируют разные гены. В последнее время большое внимание уделяется гену PSMA6, который кодирует протеасомную альфа-субъединицу 6 типа. Учитывая большое количество субъединиц и важность протеасомы в деградации и процессинге белков, а также быстрые темпы обнаружения полиморфизмов протеасом, связанных с заболеваниями человека, мы должны учитывать эту генетическую информацию и использовать ее с клинической пользой.
Протеасома, psma6, rs1048990
Короткий адрес: https://sciup.org/140302062
IDR: 140302062
Текст научной статьи Гены, кодирующие протеасомные белки
GENES ENCODING PROTEASOME PROTEINS
Протеосомы представляют собой комплексы, состоящие из большого числа протеаз, которые переваривают белки, намеченные для разрушения благодаря связыванию с убиквитином. Разрушение белков очень важно для устранения избытка ферментов и других белковых молекул, которые становятся ненужными клетке после того, как они выполнят свои нормальные функции, а также для удаления неправильно свернутых белков [1].
В геноме человека есть множество генов, которые кодируют белки убиквитин-протеасомной системы. Кроме того, протеасома 26S состоит из 33 отдельных субъединиц, каждую из которых кодируют разные гены [2]. Объем данных показывает, что гены, которые кодируют протеасомы, или их варианты могут влиять на развитие заболеваний человека. В последнее время большое внимание уделяется гену PSMA6, который кодирует протеасомную альфа-субъединицу 6 типа. Этот ген расположена в хромосоме 14q13.2. Так как ген PSMA6 является эволюционно консервативных геном альфа-семейства [3], даже несущественное изменение в трансляции этого гена могут оказать большое влияние на функционирование клеток. Воспаление считается одним из важнейших факторов в патогенезе инфаркта миокарда (ИМ). Протеасомы являются регуляторами воспаления, поэтому полиморфизмы генов протеасом играют важную роль в развитии ИМ. В исследовании Озаки и соавторов была изучена связь между полиморфизмом гена PSMA6 и ИМ у японского населения [4]. Авторы сравнили частоты генотипов 450 человек с
ИМ и 450 человек контрольной группы. В результате, один однонуклеотидный полиморфизм (ОНП) в 5 нетранслируемой области экзона 1 PSMA6 (экзон 1– 8C/G, внесенный в базу данных dbSNP как rs1048990) был связан с ИМ. Считается, что аллель G (аллель риска) может усиливать экспрессию PSMA6. Это приводит к активации белка NF-κB и, как следствие, происходит усиление воспаления [4]. Исследование, которое провели среди китайского населения, подтвердило связь между полиморфизмом гена PSMA6 и развитием ИМ [5]. Однако исследования подобного рода в других популяциях показали противоположные результаты. Отсутствие связи между полиморфизмом PSMA6 и риском инфаркта миокарда были показаны у населения Великобритании [6] и у индийского населения [7]. В исследованиях ишемической болезни сердца (ИБС), проведенных в Саудовской Аравии, ни одни из однонуклеотидных полиморфизмов PSMA6 не связан с ИБС [8]. После проведения метаанализа Ванг и соавторы высказали мнение о том, что аллель G полиморфизма rs1048990 является фактором риска, которая связанна с усиленной восприимчивостью к ИБС, но в разных этнических популяциях эта связь различается [9]. Однако, в Великобритании была обнаружена связь ОНП гена PSMA6 с диастолическим артериальным давлением [6], а также связь между rs1048990 и предрасположенностью к ишемическому инсульту была показана у кавказцев и афроамериканцев [10-13].
Благодаря исследованиям общегеномной ассоциации определено, что локус предрасположенности к раку легких находится на 15 хромосоме. Этот локус 15q24-15q25.1 содержит гены PSMA4, ген изоформы 1 субъединицы протеасомы альфа-типа. Было выявлено, что этот регион связан с риском развития рака легких у европеоидной и афроамериканской популяций [14-16]. Также было проведено исследование, которое показало, что ген PSMA4 играет одну из важнейших ролей в пролиферации раковых клеток [17]. Более того, сообщалось, что полиморфизм PSMA6 (-8 UTR C/G) играет роль фактора выживания при множественной миеломе, а аллель G можно рассматривать как прогностический фактор выживания [18].
Учитывая большое количество субъединиц и центральную важность протеасомы в физиологии человека, а также быстрые темпы обнаружения полиморфизмов протеасом, связанных с заболеваниями человека, мы должны использовать эту генетическую информацию с клинической пользой.
Список литературы Гены, кодирующие протеасомные белки
- Gomes A. Genetics of Proteasome Diseases / A. Gomes // Scientifica. - 2013. -P. 1-30.
- Xie Y. Structure, Assembly and Homeostatic Regulation of the 26S Proteasome / Y. Xie // Journal of Molecular Cell Biology. - 2010. - № 2. -P. 308-317.
- Sjakste T. Microsatellite genotyping of Chromosome 14q13.2-14q13 in the vicinity of proteasomal gene PSMA6 and association with Graves' disease in the Latvian population / T. Sjakste, J. Eglite, A. Sochnevs [et al.] // Immunogenetics. - 2004. - № 56. -P. 238-243.
- Ozaki K. A functional SNP in PSMA6 confers risk of myocardial infarction in the Japanese population / K. Ozaki, H. Sato, A. Iida [et al.] // Nature Genetics. -2006. - № 8. -P. 921-925.
- Liu X. The functional variant rs1048990 in PSMA6 is associated with susceptibility to myocardial infarction in a Chinese population / X. Wang, Y. Shen, L. Wu [et al.] // Atherosclerosis. - 2009. - № 206. -P. 199-203.
- Sjakste T. SNPs of PSMA6 gene - investigation of possible association with myocardial infarction and type 2 diabetes mellitus / T. Sjakste, I. Poudziunas, E. Ninio [et al]. // Genetika. - 2007. - № 43. -P. 553-559.
- Banerjee I. Inflammatory system gene polymorphism and the risk of stroke: a case-control study in an Indian population / I. Banerje,. V. Gupta, T. Ahmed [et al.] // Brain Res Bull. - 2008. - № 75. -P. 156-165.
- Alsmadi O. Haplotypes encompassing the KIAA0391 and PSMA6 gene cluster confer a genetic link for myocardial infarction and coronary artery disease / O. Alsmadi, P. Muiya, H. Khalak [et al.] // Ann Hum Genet. - 2009. - № 73. -P. 475-483.
- Wang H. Quantitative assessment of the influence of PSMA6 variant (rs1048990) on coronary artery disease risk / H. Wang, M. Jiang, H. Zhu [et al.] // Mol Biol Rep. - 2013. - № 40. -P. 1035-1041.
- Heckman MG. Genetic variants associated with myocardial infarction in the PSMA6 gene and Chr9p21 are also associated with ischaemic stroke / MG. Heckman, AL. Soto-Ortolaza, NN. Diehl [et al.] // Eur J Neurol. - 2013. - № 20. -P. 300-308.
- Kalis M. Association study between (TG) repeat polymorphism in PSMA6 gene and type II diabetes mellitus in Botnia / M. Kalis // Biologija. - 2003. - № 2. -P. 12-14.
- Sjakste T, Kalis M, Poudziunas I, Pirags V, Lazdins M, Groop L, et al. Association of microsatellite polymorphisms of the human 14q13.2 region with type 2 diabetes mellitus in Latvian and Finnish populations / T. Sjakste, M. Kalis, I. Poudziunas [et al.] // Ann Hum Genet. - 2007. - № 71. -P. 772-776.
- Barbieri M. The -8 UTR C/G polymorphism of PSMA6 gene is associated with susceptibility to myocardial infarction in type 2 diabetic patients / M. Barbieri, R. Marfella, MR. Rizzo, [et al.] // Atherosclerosis. - 2008. - № 201. -P. 117-123.
- Amos CI. Nicotinic acetylcholine receptor region on chromosome 15q25 and lung cancer risk among African Americans: a case-control study / CL. Amos, IP. Gorlov, Q. Dong, [et al.] // J Natl Cancer Inst. - 2010. - № 102. -P. 1199-1205.
- Hansen HM. Fine mapping of chromosome 15q25.1 lung cancer susceptibility in African-Americans / HM. Hansen, Y. Xiao, T. Rice, [et al.] // Hum Mol Genet. - 2010. - № 19. -P. 3652-3661.
- Liu P, Vikis HG, Wang D, Lu Y, Wang Y, Schwartz AG, et al. Familial aggregation of common sequence variants on 15q24-25.1 in lung cancer / P. Liu, HG. Vikis, D. Wang [et al.] //J Natl Cancer Ins. - 2008. - № 100. -P. 1326-1330.
- Liu Y. Haplotype and cell proliferation analyses of candidate lung cancer susceptibility genes on chromosome 15q24-25.1 / Y. Liu, P. Liu, W. Wen, [et al.] // Cancer Re. - 2009. - № 69. -P. 7844-7850.
- Bachmann HS. The G-allele of the PSMA6-8C>G polymorphism is associated with poor outcome in multiple myeloma independently of circulating proteasome serum levels / HS. Bachmann, J. Novotny, S. Sixt, [et al.] // Eur J Haematol. - 2010. - № 85. -P. 108-113.