Характеристика генетического разнообразия пород и кроссов индеек (Meleagris gallopavo), разводимых в России

Мясо индейки (Meleagris gallopavo) характеризуется постным составом и высоким содержанием белка и приобретает все большую популярность. В индейководстве практикуется получение межпородных и межлинейных кроссов, поскольку кроссы, как правило, имеют более высокие продуктивные показатели по сравнению с породами. С разработкой платформ для высокопроизводительного SNP-генотипирования начался этап поиска геномных вариантов, лежащих в основе формирования мясных и откормочных качеств индеек. До настоящего времени не было создано стандартизированных панелей микросателлитных маркеров для генетической характеристики пород и популяций индеек. В связи с этим продолжается выявление новых и апробация ранее известных локусов у различных пород и кроссах индеек. В настоящей работе мы впервые установили, что современная популяция бронзовой северокавказской породы (2025 год) индеек Meleagris gallopavo имеет более высокие значения генетического и аллельного разнообразия по сравнению с архивной популяцией этой породы в 2011 году, в которой, в свою очередь, были выявлены достоверные значения инбридинга. Отечественные кроссы Виктория и Универсал характеризовались сопоставимыми значениями генетического разнообразия и более высокими значениями аллельного разнообразия по сравнению с иностранными промышленными кроссами. Генетическая дифференциация между исследуемыми породами и кроссами индеек варьировала от незначительной до высокой. Цель работы — оценить генетическое разнообразие и дифференциацию пород и кроссов индеек, разводимых в России, а также изменения популяционно-генетических показателей у индеек бронзовой северокавказской и черной тихорецкой пород в процессе разведения. Работу проводили в 2025 году. Образцы цельной крови индеек (Meleagris gallopavo) бронзовой северокавказской (популяция 2025 года, n= 48) и черной тихорецкой (популяция 2025 года, n= 34) пород были отобраны в Селекционно-генетическом центре Северо-Кавказская зональная опытная станция по птицеводству» — филиал ФНЦ ВНИТИП (Ставропольский край, Георгиевский р-н, с. Обильное). Образцы цельной крови популяций бронзовой северокавказской (популяция 2011 года, n= 13), черной тихорецкой (популяция 2011 года, n= 15), узбекской палевой (n= 13), белой московской (n= 15), белой широкогрудой (n= 29), серебристой северокавказской (n= 9), белой северокавказской (n= 14), а также кроссов B.U.T.6 (n= 12), Big-6 (n= 20), Big -10 (n= 18), Виктория (n= 14) и Универсал (n= 9) были получены из биоколлекции Банк генетического материала домашних и диких видов животных и птицы ФГБНУ ФИЦ ВИЖ им. академика Л.К. Эрнста (УНУ № 498808). Анализ по шести микросателлитам MNT036, MNT0115, MNT0247, MNT0348, MNT0370 и WT54 выполняли на генетическом анализаторе ABI3130xl («Applied Biosystems, Inc.», США). В R пакете diveRsity были рассчитаны показатели генетического разнообразия и значения генетической дифференциации, а также выполнена оценка степени миграции генов между популяциями. Генетическая сеть была построена в программе SplitsTree 4.14.5. Кластерный анализ проводили в программе Structure 2.3.4. Значения наблюдаемой гетерозиготности варьировали от 0,319 в популяции бронзовой северокавказской породы 2011 года до 0,600 в узбекской палевой породе среди пород и от 0,444 в кроссе B.U.T.6 до 0,620 в кроссе Big-10. Значения аллельного разнообразия варьировали от 3,335 (B.U.T.6) до 4,284 (Универсал) среди кроссов и от 3,000 (серебристая северокавказская) до 4,215 (бронзовая северокавказская популяция 2025 года) среди пород. Популяция черной тихорецкой породы 2025 года характеризовалась более высоким аллельным разнообразием по сравнению с архивной (3,612 и 3,026), но практически не отличалась по наблюдаемой гетерозиготности. Обе популяции имели схожую генетическую структуру и кластеризовались совместно (FST = 0,09, Jost`s D = 0,07). Популяция бронзовой северокавказской породы 2025 года характеризовалась более высоким генетическим (HO 0,507 и 0,319) и аллельным разнообразием (AR 4,215 и 3,290) по сравнению с популяцией 2011 года. Популяции 2011 и 2025 годов различались по генетической структуре и кластеризовались отдельно друг от друга. Это указывает на генетические изменения, произошедшие в бронзовой северокавказской породе, причины которых будут изучены более подробно в наших следующих работах с увеличенным числом микросателлитных локусов и анализом последовательностей полного генома.