Характеристики гистотопографии мегакариоцитову больных эссенциальной тромбоцитемией в зависимости от наличия мутации JAK2 или CALR

Цель. Оценить среднее количество (СК) мегакариоцитов, СК мегакариоцитарных кластеров, СК мегакариоцитов в одном кластере, СК кластеров в 1 мм² и СК мегакариоцитов в 1 мм² в биопсиях костного мозга у больных ЭТ с подтвержденной мутацией JAK2 или CALR.

Материалы и методы. Исследовали 60 биопсий костного мозга больных ЭТ, которые были разделены на две группы: больные с мутацией JAK2 (N=30) и больные с мутацией CALR (N=30). Гистологические препараты, окрашенные гематоксилином и эозином или азуром и эозином с помощью сканера Pannoramic 250 Flash III переводились в цифровой формат. В программе Pannoramic Viewer (3DHISTECH) определяли координаты каждого мегакариоцита на срезе и экспортировали в виде таблицы. Дальнейшая обработка координат с целью анализа пространственных особенностей расположения мегакариоцитов в костном мозге была выполнена на языке программирования Python с помощью алгоритма кластеризации DBSCAN (Densitybased spatial clustering of applications with noise). Для анализа использовались следующие параметры алгоритма: минимальное количество соседних мегакариоцитов, необходимых для образования кластера — 3,максимальное расстояние между ними — 100 мкм, расстояние между мегакариоцитами — евклидово. Для описания связи гистотопографических характеристик мегакариоцитов с мутационным статусом использовали логистический регрессионный анализ.

Результаты . Были получены следующие гистотопографические характеристики мегакариоцитов у больных ЭТ с мутацией JAK2: СК мегакариоцитов — 593.6±334.2, СК мега-кариоцитарных кластеров — 62.8±30.9, СК мегакариоцитов в одном кластере — 5.9±2.3 СК кластеров в 1 мм²–2.24±1.03, СК мегакариоцитов в 1 мм²–21.30±12.62. Гистотопогра-фические характеристики мегакариоцитов у больных ЭТ с мутацией CALR: СК мегакариоцитов — 816.5±484.2, СК мегакариоцитарных кластеров — 83.9±39.5, СК мегакариоцитов в одном кластере — 7.2±2.9, СК кластеров в 1 мм²–2.09±0.96, СК мегакариоцитов в 1 мм²– 20.15±9.76. Модель логистической регрессии на основе данных кластеризации была статистически значима (χ²(5)=24.73, p=0.003 Nagelkerke R²=44.4 %) и в 80.3 % случаев правильно классифицировала наличие мутации JAK2 или CALR. Коэффициент при свободном члене — 5.86(1.90). Включенные перемен-ные:СК мегакариоцитов в одном кластере (–1.38(0.45), p-value=0.002, отношение шансов — 0.25, 95 % ДИ 0.10–0.61), СК мегакариоци-

V Всероссийская научно-практическая конференция с международным участием «ГЕНЕТИКА ОПУХОЛЕЙ КРОВЕТВОРНОЙ СИСТЕМЫ —

ОТДИАГНОСТИКИ К ТЕРАПИИ»

Санкт-Петербург 26–27 апреля 2019 г.

тов на мм2 (0.62(0.30), p-value=0.04, отношение шансов — 1.87, 95 % ДИ 1.03–3.39).

Выводы. Выявленные с помощью алгоритма кластеризации DBSCAN различия гистотопо-графических характеристик мегакариоцитов при исследовании биопсий костного мозга у больных эссенциальной тромбоцитемией с мутацией JAK2 или CALR позволяют связать мутационный статус и особенности строения мегакариоцитарного ростка.