Идентификация атипичного пестивируса крупного рогатого скота в биологических образцах

Идентификация атипичного пестивируса крупного рогатого скота в биологических образцах

Автор: Котенева С.В., Максютов Р.А., Глотова Т.И., Глотов А.Г.

Журнал: Сельскохозяйственная биология @agrobiology

Рубрика: Ветеринарная вирусология, иммунология

Статья в выпуске: 6 т.52, 2017 года.

Бесплатный доступ

Атипичный HoBi-подобный пестивирус крупного рогатого скота (BVDV3) - неклассифицированный кандидат в члены рода Pestivirus семейства Flaviviridae. Агент выделен впервые в 2004 году из эмбриональной сыворотки крупного рогатого скота, полученной в Бразилии, и проявляет высокую степень сходства с возбудителем вирусной диареи - болезни слизистых оболочек крупного рогатого скота (ВД-БС КРС). Его присутствие в популяции крупного рогатого скота и диких жвачных животных потенциально может снижать эффективность контрольных программ ВД-БС КРС. Целью наших исследований стала разработка способа выявления атипичного пестивируса при помощи полимеразной цепной реакции в биологических продуктах и изучение его циркуляции среди домашних и диких жвачных. Были подобраны синтетические олигонуклеотидные праймеры, комплементарные позициям 9202-9218 и 9501-9521 генома референтного штамма D32/00_'HoBi' (AB871953.1), отработан режим постановки реакции и подобраны ее основные компоненты. Диагностическая чувствительность ПЦР составила 7,4½10-1 копий/мкл. Тест обладает высокой специфичностью и не выявляет РНК вируса вирусной диареи 1-го и 2-го типов, а также близкородственного вируса классической чумы свиней. При помощи разработанной ПЦР исследовали 18 образцов эмбриональных сывороток крупного рогатого скота из различных источников, 11 видов перевиваемых линий клеточных культур, используемых для культивирования вирусов в нескольких научно-исследовательских институтах России, 10 живых вакцин, 1803 пробы биологического материала, из которых 189 - внутренних органов, 1383 - сыворотки крови крупного рогатого скота, 168 - сыворотки крови северных оленей, 63 - крови маралов. Присутствие вируса установлено только в семи образцах (лотах) эмбриональной сыворотки, полученной от двух производителей и изготовленной в Южной Америке. Результаты филогенетического анализа ампликонов показали, что все семь положительных лотов группируются с BVDV-3, штамм D32/00_'HoBi' (бразильская группа). Вирус не обнаружен в перевиваемых линиях культур клеток, отечественных и импортных вакцинах. Нами не найдено доказательств циркуляции вируса среди крупного рогатого скота различных пород, в том числе иностранных, на территории Краснодарского края, Сибири и Республики Казахстан, а также у северных оленей Таймыра и Ямала, маралов Алтайского края. Однако присутствие вируса в эмбриональной сыворотке, использовавшейся при производстве вакцин, не исключает его распространения на территории России. Полученные данные подтверждают необходимость совершенствования методов диагностики пестивирусов крупного рогатого скота, а также ужесточения правил международной торговли эмбриональной сывороткой.

Еще

Атипичный пестивирус, hobi-подобный вирус, праймеры, полимеразная цепная реакция, культуры клеток, эмбриональные сыворотки, вакцины, филогенетический анализ, крупный рогатый скот, северные олени, маралы

Короткий адрес: https://sciup.org/142214106

IDR: 142214106   |   DOI: 10.15389/agrobiology.2017.6.1259rus

Список литературы Идентификация атипичного пестивируса крупного рогатого скота в биологических образцах

  • Ridpath J.F. Bovine viral diarrhea virus: global status. Vet. Clin. North Am. Food Anim. Pract., 2010, 26(1): 105-121 ( ) DOI: 10.1016/j.cvfa.2009.10.007
  • Ridpath J. The contribution of infections with bovine viral diarrhea viruses to bovine respiratory disease. Vet. Clin. North Am. Food Anim. Pract., 2010, 26(2): 335-348 ( ) DOI: 10.1016/j.cvfa.2010.04.003
  • Глотов А.Г., Глотова Т.И. Вирусная диарея: значение в патологии воспроизводства крупного рогатого скота. Ветеринария, 2015, 4: 3-8.
  • Гулюкин М.И., Юров К.П., Глотов А.Г., Донченко Н.А. Стратегия борьбы с вирусной диареей -болезнью слизистых крупного рогатого скота в животноводческих хозяйствах Российской Федерации. Вопросы вирусологии, 2013, 6: 13-18.
  • Bauermann F.V., Ridpath J.F., Weiblen R., Flores E.F. HoBi-like viruses: an emerging group of pestiviruses. Journal of Veterinary Diagnostic Investigation, 2013, 25(1):6-15 ( ) DOI: 10.1177/1040638712473103
  • Schirrmeier H., Strebelow G., Depner K., Hoffmann B., Beer M. Genetic and antigenic characterization of an atypical pestivirus isolate, a putative member of a novel pestivirus species. J. Gen. Virol., 2004, 85: 3647-3652 ( ) DOI: 10.1099/vir.0.80238-0
  • Rodrigues W.B., Otonel R.A., Fritzen J.T. Natural infection of calf with an atypical bovine pestivirus (BVDV-3). In: Proc. XXII National Meeting of Virology & VI Mercosur Meeting of Virology (Atibaia, Brazil). Virus Rev. Res., 2011, 16: 74.
  • Avalos-Ramirez R., Orlich M., Thiel H.-J.,Becher P. Evidence for the presence of two novel Pestivirus species. Virology, 2001, 286: 456-465 ( ) DOI: 10.1006/viro.2001.1001
  • Larska M., Polak M.P., Riitho V. Kinetics of single and dual infection of calves with an Asian atypical bovine pestivirus and a highly virulent strain of bovine viral diarrhoea virus 1. Comparative Immunology, Microbiology and Infectious Diseases, 2012, 35: 381-390 ( ) DOI: 10.1016/j.cimid.2012.03.003
  • Xia H., Vijayaraghavan B., Belák S., Liu L. Detection and identification of the atypical bovine pestiviruses in commercial foetal bovine serum batches. PLoS ONE, 2011, 6(12): е28553 ( ) DOI: 10.1371/journal.pone.0028553
  • Ståhl K., Kampa J., Alenius S., PerssonWadman A., Baule C., Aiumlamai S., Belák S. Natural infection of cattle with an atypical "HoBi"-like pestivirus-implications for BVD control and for the safety of biological products. Vet. Res., 2007, 38: 517-523 ( ) DOI: 10.1051/vetres:2007012
  • Haider N., Rahman M.S., Khan S.U., Mikolon A., Gurley E.S., Osmani M.G., Shanta I.S., Paul S.K., Macfarlane-Berry L., Islam A., Desmond J., Epstein J.H., Daszak P., Azim T., Luby S.P., Zeidner N., Rahman M.Z. Identification and epidemiology of a rare HoBi-like pestivirus strain in Bangladesh. Transbound. Emerg. Dis., 2014, 61(3): 193-198 ( ) DOI: 10.1111/tbed.12218
  • Decaro N., Lucente M.S., Mari V., Cirone F., Cordioli P., Camero M., Sciarretta R., Losurdo M., Lorusso E., Buonavoglia C. Atypical pestivirus and severe respiratory disease in calves, Europe. Emerg. Infect. Dis., 2011, 17: 1549-1552 ( ) DOI: 10.3201/eid1708.101447
  • Decaro N., Lucente M.S., Mari V., Sciarretta R., Pinto P., Buonavoglia D., Martella V., Buonavoglia C. Hobi-like pestivirus in aborted bovine fetuses. J. Clin. Microbiol., 2012, 50(2): 509-512 ( ) DOI: 10.1128/JCM.05887-11
  • Decaro N., Mari V., Pinto P., Lucente M.S., Sciarretta R., Cirone F., Col-aianni M.L., Elia G., Thiel H.J., Buonavoglia C. "Hobi"-like pestivirus: Both biotypes isolated from diseased animal. J. Gen. Virol., 2012, 93: 1976-1983 ( ) DOI: 10.1099/vir.0.044552-0
  • Mishra N., Rajukumar K., Pateriya A., Kumar M., Dubey P., Behera S.P., Verma A., Bhardwaj P., Kulkarni D.D., Vijaykrishna D., Reddy N.D. Identification and molecular characterization of novel and divergent HoBi-like pestiviruses from naturally infected cattle in India. Vet. Microbiol., 2014, 174(1-2): 239-246 ( ) DOI: 10.1016/j.vetmic.2014.09.017
  • Глотов А.Г., Глотова Т.И. Атипичные пестивирусы крупного рогатого скота. Сельскохозяйственная биология, 2015, 50(4): 399-408 ( ) DOI: 10.15389/agrobiology.2015.4.399rus
  • Xia H., Larska M., Giammarioli M., DeMia G.M., Cardeti G., Zhou W., Alenius S., Belák S., Liu L. Genetic detection and characterization of atypical bovine pestiviruses in foetal bovin sera claimed to be of Australian origin. Transbound. Emerg. Dis., 2013, 60(3): 284-288 ( ) DOI: 10.1111/j.1865-1682.2012.01341.x
  • Thompson J.D., Higgins D.G., Gibson T.J. CLUSTAL W: improving the sensitivity of progressive multiple sequence alignment through sequence weighting, positions-specific gap penalties and weight matrix choice. Nucleic Acids Res., 1994, 22: 4673-4680.
  • Tamura K., Dudley J., Nei M., Kumar S. MEGA4: molecular evolutionary genetics analysis (MEGA) software version 4.0. Mol. Biol. Evol., 2007, 24: 1596-1599.
  • Felsenstein J. Phylogenies and the comparative method. The American Naturalist, 1985, 125(1): 1-15.
  • Юров К.П., Аноятбекова А.М., Алексеенкова С.В. Новый пестивирус -Хоби вирус -контаминант вакцины против чумы мелких жвачных животных. Ветеринария, 2016, 10: 8-10.
Еще
Статья научная
QR-код для установки приложения SciUp Наведите камеру и скачайте бесплатное приложение SciUp