Иммуногенетическая характеристика потенциальных доноров гемопоэтических стволовых клеток, проживающих на территории Иркутской области

стволовых клеток (ГСК). Успешность данной процедуры, напрямую влияющая на увеличение показателей выживаемости пациентов, прежде всего связана с генетической совместимостью реципиента и донора по системе HLA (Human Leukocyte Antigens). Отсутствие потенциальных родственных доноров у большинства пациентов, нуждающихся трансплантации в ГСК, а также высокая вариабельность HLA-генотипов даже внутри одной популяции, являются факторами, подчеркивающими важность расширения национального регистра,в том числе за счет привлечения потенциальных доноров ГСК из малоизученных популяций.

Цель исследования — изучение профилей распределения частот встречаемости HLA-аллелей в разрешении 2-fields и гаплотипов потенциальных доноров ГСК, проживающих на территории Иркутской области.

Материалы и методы. В исследование были включены 753 образца цельной крови, полученных от проживающих на территории Иркутской области взрослых индивидуумов, самоопределившихся как буряты, привлеченных в качестве потенциальных доноров ГСК. Препараты ДНК для проведения HLA-типирования были получены из замороженных образцов цельной крови методом колоночной фильтрации с помощью наборов QIAamp DNA Blood Mini Kit (QIAgen, Германия). Высокоразрешающее HLA-типирование 403образцов было проведено по технологии секвенирования с использованием наборов реагентов HLAssure SE SBT Kit (TBG Diagnostics Limited, Тайвань). Капиллярный электрофорез осуществляли с помощью генетического анализатора 3730 (Thermo Fisher Scientific, США), полученные сиквенсы анализировали в программном обеспечении AccuType TM (Texas Bio GeneInc, США). HLA-типирование 350 образцов осуществляли по технологии NGS (Next Generation Sequencing) с использованием тест-системы VariFind™ HLA Solution IL-v1 (ПАРСЕК ЛАБ,Россия). Секвенирование проводили на приборе MiSeq™ System (Illumina Inc., Калифорния). Анализ данных выполняли с помощью VariFind™ HLA Software (ПАРСЕК ЛАБ, Россия). Определение частот HLA-аллелей и их гапло- типов методом максимального правдоподобия с помощью EM-алгоритма для полилокусных данных осуществляли с использованием ПО Arlequin v.3.5. Стандартные отклонения рассчитаны при начальном значении итераций равном 100.

Результаты . В ходе исследования выявлено 33 аллеля по локусу HLA-А, 64 — по локусу HLA-В, 36 — по локусу HLA-С, 43 — по локусу HLA-DRB1 и 20 — по локусу HLA-DQB1. Частоту встречаемости более 10 % в локусе HLA-A имеют аллели A*24:02 (20,65 %), A*02:01 (15,41 %) и A*01:01 (10,82). Тремя наиболее распространенными аллелями локуса HLA-B являются В*40:02 (12,22 %), B*51:01 (9,03 %) и B*37:01 (6,97 %). Самыми частыми вариантами, выявленными в локусе HLA-С, стали С*03:04 (17,00 %), C*06:02 (15,74 %) и C*07:02 (9,63 %). Для локусов II класса частотой встречаемости более 10 % характеризуются аллели DRB1*07:01 (13,68 %), DRB1*04:01 (11,42 %) и DQB1*03:01 (29,88 %), DQB1*02:02 (11,16 %). В ходе анализа был определен 621 HLA-гаплотип из возможных 14936, наиболее распространенным является A*01:01-B*37:01-C*06:02-DRB1*10:01-QB1*05:01, имеющий частоту встречаемости 3,25 %. Частоту встречаемости более 2 % так же имеют следующие гаплотипы: A*23:01-B*44:03-C*04:01-DRB1*07:01-DQB1*02:02 (2,51 %), A*24:02-B*40:02-C*03:04-DRB1*04:01-DQB1*03:01 (2,35 %), A*02:01-B*13:02-C*06:02-DRB1*07:01-DQB1*02:02 (2,26 %), A*33:03-B*58:01-C*03:02-DRB1*13:02-DQB1*06:09 (2,06 %). По результатам исследования зарегистрированы два новых аллеля: HLA-C*02:151 С*06:02:48.

Выводы . 1. Анализ полученных данных выявил сходство HLA-профиля изученной популяции с профилями некоторых популяций монгольских народов,практически не представленных в российском регистре. 2. Идентифицированные новые аллели и ряд генетических отличий от большинства российских популяций подчеркивают актуальность дальнейшего изучения населения, проживающего на территории Российской Федерации.