Использование аберрантно метилированных генов SEPT9 и ViM для клинической диагностики колоректального рака
Автор: Бровкина Ольга Игоревна, Гордиев Марат Гордиевич, Ходырев Дмитрий Сергеевич, Никитин Алексей Георгиевич, Аверьянов Александр Вячеславович
Журнал: Клиническая практика @clinpractice
Рубрика: Оригинальные исследования
Статья в выпуске: 4 (28), 2016 года.
Бесплатный доступ
Определение эпигенетических нарушений имеет большое значение для ранней диагностики колоректального рака (КРР). Для получения модели диагностической тест-системы с высокими показателями чувствительности и специфичности мы определяли частоту метилирования в генах SEPT9 и VIM. При анализе эпигенетических нарушений нами также учитывались мутации в генах семейства RAS. В нашей работе подтверждается наличие аберрантного метилирования в генах SEPT9 и VIM в клетках опухоли. ДНК образцов опухоли была достоверно чаще метилирована, чем ДНК образцов прилежащей ткани (P =8,67E-19 для гена SEPT9 и P=8,68E-19 для гена VIM). В группе пациентов, имеющих мутации в генах KRAS или NRAS, ДНК опухолевых образцов достоверно чаще метилирована в генe SEPT9 (P=0.0018), в отличие от ДНК опухолевых образцов пациентов, не несущих данных мутаций. Нами было продемонстрировано, что использование совокупности маркеров метилирования позволяет улучшить чувствительность тест- систем, используемых в диагностике КРР.
Колоректальный рак, аберрантное метилирование, гены sept9
Короткий адрес: https://sciup.org/143164611
IDR: 143164611
Список литературы Использование аберрантно метилированных генов SEPT9 и ViM для клинической диагностики колоректального рака
- Jones P.A., Baylin S.B. 2007. The Epigenomics of Cancer. Cell. 2007;128: 683-692.
- Wild N., Andres H., Rollinger W., et al. A combination of serum markers for the early detection of colorectal cancer. Clin Cancer Res. 2010;16(24):6111-21 DOI: 10.1158/1078-0432.CCR-10-0119
- Leon S.A., Shapiro B., Sklaroff D.M., Yaros M.J. Free DNA in the serum of cancer patients and the effect of therapy. Cancer Res. 1977;37: 646-650.
- Russell S.E.H., Hall P.A. Do septins have a role in cancer? Br. J. Cancer. 2005;93: 499-503.
- Kinoshita M., Noda M. Roles of septins in the mammalian cytokinesis machinery. Cell Struct Funct. 2001;26: 667-670.
- Joo E., Tsang C.W., Trimble W.S. Septins: traffic control at the cytokinesis intersection. Traffic Cph. Den. 2005;6: 626-634.
- McDade S.S., Hall P.A., Russell S.E.H. Translational control of SEPT9 isoforms is perturbed in disease. Hum Mol Genet. 2007;16: 742-752.
- Estey M.P., Di Ciano-Oliveira C., Froese C.D., Bejide M.T., Trimble W.S. Distinct roles of septins in cytokinesis: SEPT9 mediates midbody abscission. J Cell Biol. 2010;191: 741-749.
- Zou H., Harrington J.J., Shire A.M., et al. Highly methylated genes in colorectal neoplasia: implications for screening. Cancer Epidemiol Biomarkers Prev. 2007 Dec;16(12):2686-96.
- Brenner D.E., Rennert G. Fecal DNA biomarkers for the detection of colorectal neoplasia: attractive, but is it feasible? J Natl Cancer Inst. 2005; 97: 1107-9.
- Schneider K.U., Dietrich D., Fleischhacker M., et al. Correlation of SHOX2 Gene Amplification and DNA Methylation in Lung Cancer Tumors. BMC Cancer. 2011 Mar 22;11:102 DOI: 10.1186/1471-2407-11-102
- Mikeska T., Craig J.M. DNA Methylation Bio-markers: Cancer and Beyond. Genes. 2014;5:821-864.
- Linardou H., Briasoulis E., Dahabreh I.J., et al. 2011. All about KRAS for clinical oncology practice: gene profile, clinical implications and laboratory recommendations for somatic mutational testing in colorectal cancer. Cancer Treat. Rev. 2011;37: 221-233.
- Ying H.-Q., Wang F., He B.-S., et al. The involvement of Kras gene 3’-UTR polymorphisms in risk of cancer and influence on patient response to anti-EGFR therapy in metastatic colorectal cancer: a meta-analysis. OncoTargets Ther. 2014;7: 1487-1496.
- Кит О.И., Водолажский Д.И., Дваденко К.В., et al. 2016. Аберрантное метилирование промоторных участков генов APC, CDH13 и MGMT у больных колоректальным раком. Сибирский Онкологический Журнал. 2016;15: 48-55.
- Cerottini J.P., Caplin S., Saraga E., Givel J.C., Benhattar J. The type of K-ras mutation determines prognosis in colorectal cancer. Am J Surg. 1998;175: 198-202.
- Беляева А.В. Мутации в гене K-RAS у больных колоректальным раком. Автореф. дис....канд. мед. наук. Спб.: 2012.-27 с.
