Использование GWAS анализа для идентификации полиморфизмов в генах, сопряженных с признаками молочной продуктивности на примере крупного рогатого скота комбинированных пород

На компонентный состав молока животных оказывают влияние не только средовые факторы (кормление, технология содержания, сезон года и стадия лактации), но и генетические (порода, генотип, происхождение и др.). Наиболее интересным с научной точки зрения является оценка влияния генотипа особи на изменение количественных параметров белковой и жировой фракций молока. Наиболее эффективными стоит считать поиск генов и однонуклеотидных полиморфизмов (SNP) в них входящих на основе анализа полногеномных ассоциаций для определенной выборки животных одной породы (популяции). Здесь могут быть применены как непрерывные числовые величины (прямые фенотипы, оценка племенной ценности, стандартизированные отклонения), так и пороговые значения (группировка особей по качественным параметрам: здоровье, уровни удоя и состава компонентов в молоке и др.). С развитием технологий выращивания и использования животных люди начали искать методы селекции более продуктивных особей в популяции. Одним из мощных инструментов для идентификации вариаций геномов животных является полногеномный анализ ассоциаций (GWAS). Получаемые результаты анализа полногеномных ассоциаций дают представление о значениях достоверности ассоциаций, формировании либо отсутствии локусов количественных признаков (QTL), наличии полиморфизмов в межгенных и генных участках генома. Использование данного метода позволяет проводить идентификацию значимых полиморфизмов не только среди пород скота разного направления продуктивности, но и внутри популяций животных одной породы. В обзорной статье представлены некоторые исследования в области анализа полногеномных ассоциаций на примере крупного рогатого скота молочно-мясного или комбинированного направления продуктивности.