Исследование влияния ламин-ассоциированных доменов на экспрессию генов

Бесплатный доступ

В статье проведен обзор современных методов анализа ламин-ассоциированных доменов генома и связанных с ними белков, регулирующих экспрессию эукариотических генов в краткосрочной и долгосрочной перспективе, важных для поиска молекулярных механизмов контроля состояния этих регионов генома. Закономерным выводом исследования является обоснование необходимости дальнейших исследований ламинов и ассоциированных с ними доменов для систематического подхода к диагностике, профилактике и лечению ламинопатий.

Ламины, клеточное ядро, экспрессия генов, геном, ламинопатии, дифференцировка клеток, гистоны, хромосомы

Короткий адрес: https://sciup.org/170186681

IDR: 170186681   |   DOI: 10.24411/2500-1000-2019-11512

Список литературы Исследование влияния ламин-ассоциированных доменов на экспрессию генов

  • Pickersgill, H., Kalverda, B., de Wit, E., Talhout, W., Fornerod, M., and van Steensel, B. (2006). Characterization of the Drosophila melanogaster genome at the nuclear lamina. Nat. Genet. 38, 1005-1014.
  • Kind, J., Pagie, L., de Vries, S.S., Nahidiazar, L., Dey, S.S., Bienko, M., Zhan, Y., Lajoie, B., de Graaf, C.A., Amendola, M., et al. (2015). Genome-wide maps of nuclear lamina interactions in single human cells. cell 163, 134-147.
  • Guelen, L., Pagie, L., Brasset, E., Meuleman, W., Faza, M.B., Talhout, W., Eussen, B.H., de Klein, A., Wessels, L., de Laat, W., and van Steensel, B. (2008). Domain organization of human chromosomes revealed by mapping of nuclear lamina interactions. Nature 453, 948-951.
  • Peric-Hupkes, D., Meuleman, W., Pagie, L., Bruggeman, S.W., Solovei, I., Brugman, W., Graf, S., Flicek, P., Kerkhoven, R.M., van Lohuizen, M., et al. (2010). Molecular maps of the reorganization of genome-nuclear lamina interactions during differentiation. Mol. Cell 38, 603-613.
  • Meuleman, W., Peric-Hupkes, D., Kind, J., Beaudry, J.B., Pagie, L., Kellis, M., Reinders, M., Wessels, L., and van Steensel, B. (2013). Constitutive nuclear lamina-genome interactions are highly conserved and associated with A/T-rich sequence. Genome Res. 23, 270-280.
  • Robson, M.I., de Las Heras, J.I., Czapiewski, R., LeˆTha'nh, P., Booth, D.G., Kelly, D.A., Webb, S., Kerr, A.R., and Schirmer, E.C. (2016). Tissue-specific gene repositioning by muscle nuclear membrane proteins enhances repression of critical developmental genes during myogenesis. Mol. Cell 62, 834-847.
  • Shevelyov, Y.Y., Lavrov, S.A., Mikhaylova, L.M., Nurminsky, I.D., Kulathinal, R.J., Egorova, K.S., Rozovsky, Y.M., and Nurminsky, D.I. (2009). The B-type lamin is required for somatic repression of testis-specific gene clusters. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 106, 3282-3287.
Еще
Статья научная