Изучение генетического разнообразия генотипов дикого граната (Punica granatum L.) Азербайджана с использованием маркеров ISSR

Автор: Гаджиева С.В.

Журнал: Вестник Красноярского государственного аграрного университета @vestnik-kgau

Статья в выпуске: 3, 2020 года.

Бесплатный доступ

Цель исследования - изучение генотипов дикого граната Азербайджана из 6 географических районов. Исследование проводилось в лаборатории биотехнологии Института генетических ресурсов Национальной Академии Наук Азербайджана в 2015-2018 гг. Объектом для исследования явились 90 образцов граната, фрагменты листьев которых были собраны из 6 районов Азербайджана. Было идентифицировано 110 ПЦР-фрагмента, из них 86 оказались полиморфными. Число амплифицированных фрагментов на локус варьировало от 5 до 10, а диапазон длин полученных фрагментов находился в пределах 100-1100 п.н. В среднем один праймер инициировал синтез 7,8 фрагментов. Количество полиморфных фрагментов ДНК варьировало от 3 до 9. Минимальное число полиморфных фрагментов идентифицировалось праймерами UBC 827 и UBC 857, среднее число которых составило 6,1. В зависимости от праймера количество полиморфных локусов колебалось в пределах 57-100 %, уровень полиформизма в среднем составил 78 %. Был вычислен индекс генетического разнообразия (ИГР) по каждому ISSR локусу, среднее значение которого составило 0,77...

Еще

Дикий гранат (punica granatum l.), молекулярные маркеры, issr-праймеры, генетический полиморфизм, кластерный анализ

Короткий адрес: https://sciup.org/140248923

IDR: 140248923 | DOI: 10.36718/1819-4036-2020-3-20-28

Список литературы Изучение генетического разнообразия генотипов дикого граната (Punica granatum L.) Азербайджана с использованием маркеров ISSR

Teixeira da Silva J., Rana T.S., Narzaryd D. et al. Pomegranate biology and biotechnology // A review. Sci. Hort. 2013. V. 160. P. 85-107.
Al-Zoreky N.S. Antimicrobial activity of pomegranate (Punica granatum L.) fruit peels // Int J. Food Microbiol. 2009. V. 134. P. 244-8.
Zamani Z., Sarkhosh A., Fatahi R., Ebadi A. Genetic relationships among pomegranate genotypes studied by fruit characteristics and RAPD markers // J. Hort Sci Biotechnol. 2007. V. 82. P. 11-18.
Kazemialamuti M., Zeinalabedini M., Derazmahalleh M.M. et al. Extensive genetic diversity in Iranian pomegranate (Punica granatum L.) germplasm revealed by microsatellite markers // Sci Hort. 2012. V. 146. P. 104-114.
Ajal E.A., Jbir R., Melgarejo P. et al. Efficiency of Inter Simple Sequence Repeat (ISSR) markers for the assessment of genetic diversity of Moroccan pomegranate (Punica granatum L.) cultivars // Biochem. Syst. Ecol. 2014. V. 56. P. 24-31.
Aliyev R.T., Abbasov M.A., Mammadov A.C. Genetic identification of diploid and tetraploid wheat species with RAPD marker // Turk. J. Biol. 2007. V. 31. P. 173-180.
Doyle J.L., Doyle J.J. A rapid DNA isolation procedure for small quantities of fresh leaf tissue // Phytochem. Bull. 1987. V. 19. P. 11-15.
Hammer O., Harper D.A., Ryan P.D. Past: paleontological statistics software package for education and data analysis // Palaeontologia Electronica. 2001. V. 4. P. 1-9.
Weir B.S. Genetic Data Analysis Methods for Discrete Genetic Data. Sunderland, MA, USA: Sinauer Assoc. Inc., 1990.
Чесноков Ю.Ф. Оценка меры информационного полиморфизма генетического разнообразия // Сельскохозяйственная биология. 2015. Т. 5. С. 571-578.
Roldan-Ruiz I., Dendauw J., Vanbockstaele E. et al. AFLP markers reveal high polymorphic rates in ryegrasses (Lolium spp.) // Mol. Breed. 2000. V. 6. P. 125-134.
Yuan Z., Yin Y., Qu J., Zhu L. Population genetic diversity in Chinese pomegranate (Punica granatum L.) cultivars revealed by fuorescent-AFLP markers // J. Genet. Genom. 2007. V. 34. P. 1061-1071.
Jbir R., Hasnaoui N., Mars M. et al. Characterization of Tunisian pomegranate (Punica granatum L.) cultivars using amplified fragment length polymorphism analysis // Sci. Hortic. 2008. V. 115. P. 231-237.
Talebi M., Bahar M., Sharifnabi B., Yamchi A. Evaluation of genetic diversity among Iranian pomegranate (Punica granatum L.) cultivars, using ISSR and RAPD markers // Taxonomy and Biosystematics. 2011. V. 8. P. 35-44.
Sarkhosh A., Zamani Z., Fatahi R., Ebadi A. RAPD markers reveal polymorphism among some Iranian pomegranate (Punica granatum L.) genotypes // Scientia Horti culturae. 2006. V. 111. P. 24-29.
Omayma M.I., Rania A.A., Ibrahim A.M. Morphological and molecular evaluation of some Egyptian pomegranate cultivars // African Journal of Biotechnology. 2014. V. 13. P. 226-237.
Zahra N., Ali F., Saeed H-R. et al. Genetic variation among Iranian pomegranates (Punica granatum L.) using RAPD, ISSR and SSR markers // Aust. J. Crop Sci. 2012. V. 6 (2). P. 268-275.
Narzary D., Rana T.S., Ranade S.A. Molecular analysis of genetic diversity in Indian pomegranates using RAPD, DAMD and ISSR // Fruit, vegetable and cereal science and Biotechnology. 2010. V. 4. P. 126-143.
Carvalho A., Brito J.L., Macas B., Pinto H.G. Genetic variability analysis of a collection of Old Portuguese bread wheat using ISSRs // Options Mediterraneennes. Ser. A. Sem. Medit. 2008. V. 81. P. 35-38.
El Amine Ajal, Rania Jbir, Pilar Legua et al. Genetic diversity of Moroccan pomegranate (Punica Granatum L.) cultivars using AFLP markers // Australian Journal of Crop Science. 2015. V. 9. P. 22-29.
Noormohammadi Z., Fasihee A., Homaee-Rashidpoor S. et al. Genetic variation among Iranian pomegranates (Punica granatum L.) using RAPD, ISSR and SSR markers // Australian Journal of Crop Science. 2012. V. 6. P. 268-275.
Botstein D., White R.L., Skalnick M.H., Davies R.W. Construction of a genetic linkage map in man using restriction fragment length polymorphism // Am. J. Hum. Genet. 1980. V. 32. P. 314-331.
Najaphy A., Ashrafi Parchin R., Farshadfar E. Evaluation of genetic diversity in wheat cultivars and breeding lines using inter simple sequence repeat markers // Biotechnology & biotechnological equipment. 2011. V. 25. P. 2634-2638.
Talebi B.M., Sharifi N.B., Bahar M. Analysis of genetic diversity in pomegranate cultivars of Iran, using Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) markers // Proceedings of the Third National Congressof Biotechnology. 2003. V. 2. P. 343-345.

Еще

Статья научная