Изучение генов, контролирующих реакцию дегалогенирования, бактерий-деструкторов 4-хлорбензоата

Автор: Шумковa Е.С., Лобова И.В., Ананьина Л.Н., Плотникова Е.Г.

Журнал: Вестник Пермского университета. Серия: Биология @vestnik-psu-bio

Статья в выпуске: 5, 2007 года.

Бесплатный доступ

Методом полимеразной цепной реакции проведен скрининг бактерий-деструкторов 4-хлорбензойной кислоты на наличие fcb-генов, контролирующих реакцию дегалогенирования 4-хлорбензоата. Установлено, что Arthrobacter sp. H4, H5, Pseudomonas fluorescens H2, Micrococcus sp. G120 и Rhodococcus ruber Р25 содержат fcbA и fcbB гены, кодирующие 4ХБК-СоА-лигазу и 4ХБК-СоА-дегалогеназу, соответственно. Уровень сходства fcb-генов штамма R. ruber Р25 с деструкторами 4ХБК рода Arthrobacter cjcnfdkztn 95-99%.

Короткий адрес: https://sciup.org/147204393

IDR: 147204393

Список литературы Изучение генов, контролирующих реакцию дегалогенирования, бактерий-деструкторов 4-хлорбензоата

Карасевич Ю.Н. Основы селекции микроорганизмов, утилизирующих синтетические органические соединения. М.: Наука, 1982. 144 с.
Кулинский В.И. Обезвреживание ксенобиотиков.//Соросов. образов. журн. 1999. № 1. C. 8-12.
Рыбкина Д.О. Исследование аэробных бактерий, разлагающих полихлорированные бифенилы и хлорбензойные кислоты: Дис. …канд. биол. наук. Пермь, 2003. 181 с.
Рыбкина Д.О., Гусев В.А., Плотникова Е.Г. Почвенные микроорганизмы, разлагающие ароматические углеводороды и карбоновые кислоты.//Вестн. Перм. ун-та. 2005. № 6. Биология. С. 115-122.
Abraham W.R. et al. Polychlorinated biphenyldegrading microbial communities in soils and sediments.//Curr. Opin. Microbiol. 2002. Vol. 5. P. 246-253.
Arensdorf J.J., Focht D.D. A meta cleavage pathway for 4-chlorobenzoate, an intermediate in the metabolism of 4-chlorobiphenyl by Pseudomonas cepacia P166.//Appl. Environ. Microbiol. 1995. Vol. 61. P. 443-447.
Ausbel F.M. et al. Short protocols in molecular biology. Third edition. 1995. 450 p.
Chae J.C. et al. Genetic structure and functional implication of the fcb gene cluster for hydrolytic dechlorination of 4-chlorobenzoate from Pseudomonas sp. DJ-12.//Gene. 2000. Vol. 258. P. 109-116.
Dua M. et al. Biotechnology and bioremediation: successes and limitations.//Appl. Microbiol. Biothechnol. 2002. Vol. 59. P. 143-152.
Fava F. et al. Degradation and dechlorination of lowchlorinated biphenyls by a three-membered bacterial co-culture.//Appl. Microbiol. Biotechnol. 1994. Vol. 41. P. 117 -123.
Fava F. et al. Aerobic dechlorination of lowchlorinated biphenyls by bactterial biofilms in packed-bed batch bioreactors.//Appl. Microbiol. Biotechnol. 1996. Vol. 45. P. 562-568.
Gartemann K.H. and Eichenlaub R. Isolation and characterization of IS1409, an insertion element of 4-chlorobenzoate-degrading Arthrobacter sp. strain TM1, and development of a system for transposon mutagenesis//J. Bacteriol. 2001. Vol. 183. P. 3729-3736.
Havel J., Reineke W. Total degradation of various chlorobiphenyls by cocultures and in vivo constructed hybrid pseudomonads.//FEMS Microbiol. Lett. 1991. Vol. 78. P. 163-170.
Hickey W.J., Searles D.B., Focht D.D. Enhanced mineralization of polychlorinated biphenyls in soil inoculated with chlorobenzoate-degradin bacteria.//Appl. Environ. Microbiol. 1993. Vol. 59. P. 1194-1200.
Hrywna Y. et al. Construction and characterization of two recombinant bacteria that grow on ortho-and para-substituted chlorobiphenyls.//Appl. Environ. Microbiol. 1999. Vol. 65. P. 2163-2169.
Kim S., Picardal F.W. A novel bacterium that utilizes monochlorobiphenyls and 4-chlorobenzoate as a growth substrates.//FEMS Microb. Letters. 2000. V.185. P. 225-229.
Marko M.A., Chipperfield R., Birnboim H.C. A procedure for the large-scale isolation of highly purified plasmid DNA using alkaline extraction and binding to glass powder.//Analit. Biochem. 1982. Vol. 121. P. 382-388.
Rodrigues J.L. et al. Degradation of aroclor 1242 dechlorination products in sediments by Burkholderia xenovorans LB400 (ohb) and Rhodococcus sp. strain RHA1 (fcb).//Appl Environ Microbiol. 2006. Vol. 72. P. 2476-2482.
Schmitz A. et al. Cloning and sequence analysis of genes for dehalogenation of 4-chlorobenzoate from Arthrobacter sp. strain SU.//Appl. Environ. Microbiol. 1992. Vol.58. P. 4068-4071.
Tsoi T.V. et al. Cloning and expression of the Arthrobacter globiformis KZT-1 fcb gene encoding dehalogenase (4-chlorobenzoatehydroxylase) in E. coli.//FEMS Microbiol. Lett. 1991. Vol. 81. P. 165-170.
Zaitsev G.M. et al. Genetic control of degradation of chlorinated benzoic acids in Arthrobacter globiformis, Corynebacterium sepedonicum and Pseudomonas cepacia strains.//FEMS Microbiol. Lett. 1991. Vol. 81. P. 171-176.

Еще

Статья научная