Изучение углеводородокисляющей активности родококков, иммобилизованных в макропористом криогеле поливинилового спирта
Автор: Гаврин А.Ю., Елькин А.А., Куюкина М.С., Гришко В.В., Ившина И.Б.
Журнал: Вестник Пермского университета. Серия: Биология @vestnik-psu-bio
Рубрика: Микробиология
Статья в выпуске: 5, 2007 года.
Бесплатный доступ
Определены оптимальные условия иммобилизации клеток родококков в макропористый криогель поливинилового спирта. На примере биодеградации н-гексадекана и биотрансформации тиоанизола показано, что каталитическая активность иммобилизованных клеток родококков в 2-2.5 раза выше таковой у свободных клеток.
Короткий адрес: https://sciup.org/147204392
IDR: 147204392
Текст научной статьи Изучение углеводородокисляющей активности родококков, иммобилизованных в макропористом криогеле поливинилового спирта
Иммобилизованные клетки микроорганизмов широко используются в биотехнологиях получения целевых веществ (Синицин и др., 1994). Процесс иммобилизации микробных клеток способствует существенному повышению их каталитической активности и устойчивости к действию неблагоприятных факторов внешней среды. Использование криогелей различной природы для закрепления бактериальных клеток (рис. 1) обеспечивает проведение данного процесса в «мягких» условиях, т. е. при физиологических значениях температуры, pH и без применения токсичных химических веществ. Криогель на основе поливинилового спирта – это макропористый, высокопрочный, по-
Рис. 1. Клетки Rhodococcus ruber ИЭГМ 231, иммобилизованные в макропористом криогеле поливинилового спирта, в сканирующем электронном микроскопе: 1 – х 4500; 2 – х 25000
лимерный материал, получаемый в результате замораживания с последующим оттаиванием концентрированных водных растворов данного полимера (Лозинский, Плиева, Зубов, 1995).
В настоящее время наиболее разрабатываемыми в биотехнологическом отношении актинобактериями являются представители рода Rhodococcus sensu stricto (Ившина, 1997). В частности показано (Толстиков, Гришко, Ившина, 2003), что родококки катализируют реакции стереоселективного окисления фенилметилового сульфида (тиоанизола) (1) и его гомологов в соответствующие (R)- или (S)-суль-фоксиды (2), широко применяемые в химической и

фармакологической промышленности. Цель настоящей работы – изучение углеводородокисляю-щей активности иммобилизованных клеток родо-
кокков.
Материалы и методы
В работе использовали штаммы R. ruber ИЭГМ 231 и R. rhodochrous ИЭГМ 66 из Региональной профилированной коллекции алкано-трофных микроорганизмов (акроним ИЭГМ, . Культуры параллельно выращивали в мясопептонном бульоне и минеральной среде в присутствии н-гексадекана (Каталог штаммов…, 1994). В качестве носителя иммобилизованных клеток использовали криогель поливинилового спирта марки 40/2 (ГОСТ 10779-78) производства предприятия «Азот» (Невинномысск). Формирование гранул криогеля с закрепленными в них клетками родококков проводили согласно ранее описанной методике (Kuyukina et al., 2006). Для гидрофобизации криогеля использовали Rho-dococcus биосурфактант (Kuyukina et al., 2001). Сравнительное определение жизнеспособности свободных и иммобилизованных клеток родокок-ков осуществляли с помощью специфического окрашивания иодонитротетразолием фиолетовым. Каталитическую активность свободных клеток родококков, а также включенных в матрицу полимерного криогеля определяли в экспериментах по биодеградации н-гексадекана и трансформации тиоанизола. Количество остаточного н-гексадекана определяли гравиметрически. Анализ продуктов биотрансформации тиоанизола осуществляли методами тонкослойной хроматографии, а также хромато-масс-спектрометрии с использованием хромато-масс-спектрометра Agilent 6890N с квадрупольным масс-спектрометром Agilent MSD 5973N в качестве детектора и кварцевой колонкой HP-5 MS SN US 1518974`-1 (Agilent, США). Долговременное хранение гранул биокатализатора осуществляли в высушенном виде при комнатной или пониженной температурах и в физиологическом растворе при комнатной или пониженной температурах. Жизнеспособность иммобилизованных клеток в процессе хранения контролировали еженедельно в течение 10 месяцев.
Все эксперименты проводили в трехкратной повторности. Для статистической обработки полученных данных использовали программу STA-TISTICA 6.0. Достоверность различий между средними величинами оценивали с помощью t-критерия Стьюдента.
Результаты и их обсуждение
В результате исследований установлено, что для иммобилизации родококков, предварительно выращенных в мясопептонном бульоне, оптимальное объемное соотношение клеточной массы и раствора поливинилового спирта составляет 1 : 3 с добавлением 10% Rhodococcus- биосурфактанта (табл. 1). Для клеток, выращенных в присутствии н- гексадекана, такое соотношение составляет 1:2, при этом не требуется добавления Rhodococcus- биосурфактанта (табл. 2).
Таблица 1
Характеристика биокатализатора на основе иммобилизированных клеток родококков, выращенных на мясопептонном бульоне
Соотношение клеточная суспензия : криогель, v/v |
Количество клеток родококков в 1 грануле криогеля, x 103 |
Концентрация Rhodococcus -биосурфактанта, % |
Распределение гранул криогеля в двухфазной среде |
Механическая прочность гранул криогеля |
2:1 |
210 ± 1.0 |
3 |
Вода |
Низкая |
2:1 |
21.0 ± 1.0 |
5 |
Углеводород/вода |
Низкая |
2:1 |
21.0 ± 1.0 |
10 |
Углеводород/вода |
Низкая |
1:1 |
13.5 ± 1.5 |
3 |
Вода |
Низкая |
1:1 |
13.5 ± 1.5 |
5 |
Углеводород/вода |
Низкая |
1:1 |
13.5 ± 1.5 |
10 |
Углеводород/вода |
Низкая |
1:2 |
8.0 ± 0.6 |
3 |
Вода |
Высокая |
1:2 |
8.0 ± 0.6 |
5 |
Вода |
Высокая |
1:2 |
8.0 ± 0.6 |
10 |
Углеводород/вода |
Низкая |
1:3 |
6.5 ± 0.4 |
3 |
Вода |
Высокая |
1:3 |
6.5 ± 0.4 |
5 |
Вода |
Высокая |
1:3 |
6.5 ± 0.4 |
10 |
Углеводород/вода |
Высокая |
1:5 |
3.0 ± 0.2 |
3 |
Вода |
Высокая |
1:5 |
3.0 ± 0.2 |
5 |
Вода |
Высокая |
1:5 |
3.0 ± 0.2 |
10 |
Вода |
Высокая |
Подобранные условия иммобилизации обеспечивают высокую концентрацию жизнеспособных клеток, заключённых в гель, значительную механическую прочность биокатализатора и распределение гранул криогеля на границе раздела фаз «углеводород–вода». Межфазная локализация приводит к тесному взаимодействию гранул катали- затора со средой в гидрофильной и гидрофобной фазах, что способствует одновременному поступлению углеводородного субстрата, воды и кислорода к иммобилизованным клеткам.
По нашим данным, углеводородокисляющая активность закреплённых в криогеле клеток существенно выше по сравнению с таковой свободных клеток. Так, степень биодеградации н-гексадекана иммобилизованными клетками родококков достигает 51%, тогда как данный показатель для свободных клеток составляет лишь 21%. Сравнительный анализ данных по окислению тиоанизола свободными и закрепленными бактериальными клетками показал, что при использовании свободных клеток родококков полная конверсия сульфида достигается только через 3 сут после его добавле- ния, тогда как использование иммобилизованных клеток позволяет искючить двухдневную стадию подготовки биокатализатора и осуществить полную конверсию тиоанизола уже за 24 ч при условии одновременного введения биокатализатора и субстрата. При этом относительное содержание побочного продукта – сульфона тиоанизола (3) – не превышает 9.5% (рис. 2).
Таблица 2
Характеристика полученного биокатализатора на основе клеток родококков, выращенных в жидкой минеральной среде с добавлением н-гексадекана
Соотношение клеточная суспензия : криогель, v/v |
Количество клеток родо-кокков в 1 грануле криогеля, x 103 |
Распределение гранул криогеля в двухфазной среде |
Механическая прочность гранул криогеля |
2 : 1 |
12.3 ± 2.0 |
Углеводород / вода |
Низкая |
1 : 1 |
9.3 ± 1.5 |
Углеводород / вода |
Низкая |
1 : 2 |
6.2 ± 0.4 |
Углеводород / вода |
Высокая |
1 : 3 |
4.6 ± 0.6 |
Вода |
Высокая |
1 : 5 |
3.1 ± 0.7 |
Вода |
Высокая |
100 %
100 %
eLLJi 01111
-20 3
□ Тиоанизол
□ Сульфоксид
Время, сут
-
□ Сульфон
-
□ Сульфоксид □ Сульфон
Время, сут
А
Б
Рис. 2. Динамика накопления продуктов биотрансформации тиоанизола с использованием свободных (А) и иммобилизованных (Б) клеток R. rhodoсhrous ИЭГМ 66
Установлено, что оптимальным способом долгосрочного поддержания полученного биокатализатора является его хранение в высушенном виде при комнатной или пониженной температурах. При этом жизнеспособность иммобилизованных клеток родо-кокков сохраняется на уровне 60–80% в течение 10 месяцев.
Исследования поддержаны грантами Программы Президиума РАН “Молекулярная и клеточная биология” и РФФИ № 04-04-97518-р_офи; 07-04-97612-р_офи.
Список литературы Изучение углеводородокисляющей активности родококков, иммобилизованных в макропористом криогеле поливинилового спирта
- Ившина И.Б. Бактерии рода Rhodococcus: биоразнообразие, детекция, иммунодиагностика: Дис. …д-ра биол. наук. Пермь, 1997.
- Каталог штаммов Региональной профилированной коллекции алканотрофных микроорганизмов/Под ред. И.Б. Ившиной. М.: Наука, 1994. 163 с.
- Лозинский В.И., Плиева Ф.М., Зубов А.Л. Применение криогелей поливинилового спирта в биотехнологии. Сверхмакропористые носители для иммобилизации молекул//Биотехнология. 1995. № 1. С. 32-37.
- Синицин А.П. и др. Иммобилизованные клетки микроорганизмов. М.: Изд-во МГУ, 1994. 288 с.
- Толстиков А.Г., Гришко В.В., Ившина И.Б. Энантиоселективное биокаталитическое окисление органических сульфидов в хиральные сульфоксиды//Современные проблемы асимметрического синтеза/Под ред. А.Г. Толстикова. Екатеринбург, 2003. С. 165-205.
- Kuyukina M.S. et al. Immobilization of hydrocarbonoxidizing bacteria in poly(vinyl alchohol) cryogels hydrophobized using a biosurfactant//J. Microbiol. Methods. 2006. Vol. 65. P. 596-603.
- Kuyukina M.S. et al. Recovery of Rhodococcus biosurfactants using methyl-tertiary butyl ether extraction//J. Microbiol. Methods. 2001. Vol. 46. P. 149-156.