Классификация методом кластеризации сортов сои коллекции ВИР по хозяйственно ценным показателям
Автор: Омельянюк Л.В., Ященко Ю.И., Асанов А.М.
Рубрика: Селекция, семеноводство и биотехнология сельскохозяйственных растений
Статья в выпуске: 4 (200), 2024 года.
Бесплатный доступ
Исследования проведены в 2021 -2023 гг. в ФГБНУ «Омский АНЦ» в южной лесостепи Омской области. Представлены результаты комплексной оценки 63 коллекционных образцов сои из Всероссийского института генетических ресурсов растений имени Н.И. Вавилова (ВИР) различного эколого-географическое происхождения: Россия (30 шт.), Украина (7 шт.), Польша (7 шт.), Республика Беларусь (6 шт.), Швеция (4 шт.), Канада (3 шт.). Полевые испытания, учеты и наблюдения проводили по методике ВИР (2018), статистическую обработку данных - по пособию Б. А. Доспехова (1985) с использованием пакета прикладных программ Microsoft Excel. Кластеризацию осуществляли методом невзвешенной попарной группировки с усреднением (UPGMA) с помощью стандартных функций GNU Octave по 14 хозяйственно ценным показателям: высота растения и прикрепления нижнего боба, количество: продуктивных веток и узлов, бобов и семян с растения; масса семян с растения и масса 1000 семян; доля в семенах белка и жира; полевая всхожесть, сохранность растений; урожайность семян с 1 м2; продолжительность вегетационного периода. Применение метода кластерного анализа позволило систематизировать сорта сои по степени выраженности хозяйственно ценных параметров. Выявлено шесть кластеров, различающихся по анализируемым показателям. Наиболее многочисленны первые три кластера, в которые вошли 15, 22 и 16 образцов соответственно. Сорта из третьего кластера являются источниками раннепелости (96 сут.), но они самые короткостебельные (59,3 см) с недостаточно высоким прикреплением нижних бобов (9,1 см) и низкоурожайные (204,2 г/м2). Образцы самых мало численных четвертого и пятого кластеров (соответственно 2 и 3 шт.) представляют наибольший интерес для селекции на повышение урожайности: Персона и Гармония (ВНИИ сои, Россия), Антрацит (Украина). При урожайности от 352 до 361 г/м2 (достоверно выше стандарта Сибириада) они имели оптимальные высоту стебля (более 82 см) и уровень прикрепления нижних бобов (11-12 см).
Соя (glycine max l. merrill), сорт, коллекция, раннеспелость, южная лесостепь, западная сибирь
Короткий адрес: https://sciup.org/142243658
IDR: 142243658 | DOI: 10.25230/2412-608X-2024-4-200-32-38
Текст научной статьи Классификация методом кластеризации сортов сои коллекции ВИР по хозяйственно ценным показателям
Введение . До настоящего времени основным фактором, сдерживающим продвижения сои в более северные регионы, являлась продолжительность её вегетационного периода, поэтому важное значение для расширения зоны возделывания данной культуры имеет отбор раннеспелых, продуктивных и экологически приспособленных к конкретным почвенно-климатическим условиям сортов [1; 2]. Это усиливает актуальность изучения коллекции ВИР, которая многие десятилетия обеспечивает селекционеров исходным материалом, происходящим из различных стран мирового производства культуры [3]. От исходного материала во многом зависит эффективность селекционной работы с соей: чем он богаче и генетически разнообразнее, тем быстрее можно получить ожидаемый результат [4]. В генофонде культурной сои выявлено больше 300 генетических источников раннеспелости, слабой фотопериодической чувствительности и низкой требовательности к температурным условиям. Из них можно выбрать родительские формы для селекции сортов сои по различным направлениям использования для северных регионов ее возделывания [5].
Ввиду большого сортового разнообразия и широкого спектра изучаемых признаков, необходимости систематизации исходного материала на основе результатов его анализа, актуальное значение имеет использование многомерных статистических методов, в частности кластерного анализа. Методы кластеризации применяются в различных научно-технических областях с целью решения задач сегментации для объединения объектов в группы со схожими характеристиками, а также сжатия большого объема информации и построения научно обоснованных классификаций [6; 7; 8]. Мировой опыт показывает, что кластерные структуры в настоящее время являются одним из наиболее действенных механизмов, позволяющих решить существующие в агропромышленном комплексе проблемы. Например, выявлено наличие высокого кластерного потенциала у соевого подкомплекса Амурской области, что доказывает целесообразность формирования соевого кластера, который позволит повысить конкурентоспособность агропромышленного комплекса и, как следствие, экономики региона в целом [9].
Цель исследования – систематизация сортов сои мировой селекции по основным хозяйственно ценным показателям на основе кластерного анализа для рационального их использования в селекции.
Материалы и методы. Исследования проводили в 2021–2023 гг. в ФГБНУ «Омский АНЦ» в южной лесостепи Омской области. Почвенный покров опытного поля – чернозём выщелоченный среднемощный тяжелосуглинистый, содержание гумуса около 6 % (по Тюрину), рН сол 6,5. По данным лаборатории агрохимии Омского АНЦ, содержание в слое 0–40 см: нитратного азота среднее, подвижного фосфора повышенное, обменного калия (по Чирикову) высокое.
В качестве объектов исследования использованы 63 коллекционных образца сои (семена местной репродукции), которые были присланы до 2019 г. из Всероссийского института генетических ресурсов растений имени Н.И. Вавилова (ВИР) и стабильно вызревали в сибирских условиях. Они имеют различное эколого-географическое происхождение: Россия (30 шт.), Украина (7 шт. ), Польша (7 шт.), Республика Беларусь (6 шт.), Швеция (4) шт., Канада (3 шт.).
Посев проводился вручную в начале III-й декады мая на полях селекционного севооборота лаборатории селекции зернобобовых культур, предшественник – озимые зерновые. Делянка однорядковая, длиной 2 м. Количество семян в делянке – 40 шт., площадь питания растений – 5 × 60 см, учетная площадь делянки – 1,2 м2. Повторность двукратная. Через каждые 12 номеров высевался сорт Сибирячка (общепринятый стандарт в регионе в 2021 г., а также сорт Сибириада (общепринятый стандарт в регионе с 2022 г.). В течение вегетации агрокультуры проводили несколько ручных прополок и рыхлений междурядий. Фенологические наблюдения – не реже двух раз в неделю. Уборка растений вручную по мере их созревания. У позднеспелых образцов убраны только растения, имеющие выполненные бобы.
Полевые испытания, учеты и наблюдения проводили по методике ВИР [10], статистическую обработку данных – в соответствии с методикой полевого опыта До-спехова Б.А. [11] с использованием пакета прикладных программ Microsoft Excel.
Кластеризацию – методом невзвешенной попарной группировки с усреднением (UPGMA) с помощью стандартных функций GNU Octave.
Для кластерного анализа использованы данные всех 63 сортов по 14 хозяйственно ценным показателям: высота растения, высота прикрепления нижнего боба; количество продуктивных веток и узлов, бобов и семян с растения; масса семян с растения и масса 1000 семян; доля в семенах белка и жира; полевая всхожесть и сохранность растений; урожайность семян с 1 м2; продолжительность вегетационного периода.
По данным Гидрометеорологического центра, в черте г. Омска период май – сентябрь в годы исследований характеризовался очень контрастными погодными условиями (рис. 1).

Рисунок 1 – Среднемесячная температура и сумма осадков (май – сентябрь 2021–2023 гг.)
В 2021 г. средняя температура воздуха достигала 16,7 °С (+1,2 °С к норме), сумма осадков – 168,0 мм (71,2 % от нормы), ГТК 0,58. Засуха особенно сильно проявилась в конце мая и июля. В 2022 г. средняя температура воздуха была на уровне 16,1 °С (+0,5 °С к норме), сумма осадков – 255,6 мм (107,8 % от нормы), ГТК 0,95. Не смотря на низкое значение ГТК (0,78), в 2023 г. сложились более благоприятные погодные условия для сои: средняя температура воздуха – 16,8 °С (+1,2 °С к норме), сумма осадков – 193 мм (81 % от нормы).
Результаты и обсуждение. Дифференциация сортообразцов позволила выявить шесть кластеров (рис. 2), различающихся по анализируемым показателям.
В изучаемой выборке сортообразцов наиболее многочисленные первые три кластера, лидер – второй (22 шт., или 63 %) (табл. 1). Из второго кластера можно рекомендовать в качестве исходного материала по комплексу хозяйственно ценных показателей образцы Денi и Зуша (табл. 2). В первый кластер (15 шт., или 24 %) во- шло шесть ценных сортов: Мезенка, Ос-монь, Припять, Сибириада (стандарт), Пруденс, ОАС Vision.
Шестнадцать сортов (25 %), относящихся к третьему кластеру, являются источниками раннеспелости (95,5 сут.), но они самые короткостебельные (59,3 см) с недостаточно высоким прикреплением нижних бобов (9,1 см) и низкоурожайные (204,2 г/м2), поэтому могут быть рекомендованы для селекции лишь два: Л 52/14, Алтай.
Образцы самых малочисленных четвертого и пятого кластеров представляют наибольший интерес для селекции на повышение урожайности: Гармония, Надежда, Персона и Антрацит (среднее значение их урожайности 369 г/м2). Они имеют самый высокий стебель (более 82 см), прикрепление нижних бобов на высоте 11–12 см.
В шестой кластер вошли самые непродуктивные сорта (194,3 г/м2) с низким прикреплением нижнего боба (7,9 см).

Рисунок 2 – Дендрограмма сходства – различия сортообразцов сои по комплексу хозяйственно ценных показателей (2021–2023 гг.)
Характеристика хозяйственно ценных показателей сортов сои в среднем по кластерам
Среднее за 2021–2023 гг.
Показатель |
Номер кластера |
Средне-взвешенное |
|||||
1 |
2 |
3 |
4 |
5 |
6 |
||
Количество сортообразцов, шт. |
15 |
22 |
16 |
2 |
3 |
5 |
∑ 63 |
Высота растения, см |
78,6 |
75,0 |
59,3 |
88,9 |
82,6 |
70,0 |
75,7 |
Количество веток, шт. |
2,4 |
2,0 |
1,9 |
2,3 |
2,9 |
2,9 |
2,4 |
Высота прикрепления нижнего боба, см |
11,9 |
11,2 |
9,1 |
12,1 |
11,1 |
7,9 |
10,6 |
Количество узлов на растении, шт. |
20,2 |
18,9 |
16,7 |
22,0 |
26,4 |
23,1 |
21,2 |
Количество бобов на растении, шт. |
42,7 |
43,7 |
36,3 |
49,8 |
58,3 |
54,5 |
47,6 |
Количество семян на растении, шт. |
96,0 |
90,3 |
72,9 |
108,7 |
153,6 |
83,5 |
100,9 |
Масса семян с растения, г |
13,9 |
11,9 |
10,0 |
16,6 |
18,9 |
10,3 |
13,6 |
Масса 1000 семян, г |
146,2 |
136,9 |
142,5 |
151,7 |
120,2 |
140,1 |
139,6 |
Содержание белка, % |
37,3 |
37,1 |
37,6 |
36,2 |
37,2 |
38,7 |
37,4 |
Содержание жира, % |
17,9 |
17,6 |
16,8 |
17,2 |
18,2 |
16,3 |
17,3 |
Полевая всхожесть, % |
75,4 |
70,7 |
66,0 |
75,2 |
68,5 |
72,0 |
71,3 |
Сохранность, % |
96,5 |
97,2 |
96,7 |
96,1 |
98,1 |
82,6 |
94,5 |
Урожайность с 1 м², г |
320,7 |
261,2 |
204,2 |
379,2 |
357,9 |
194,3 |
286,2 |
Вегетационный период, сут. |
102,2 |
99,8 |
95,5 |
105,1 |
100,2 |
102,2 |
100,8 |
По итогам трехлетнего изучения установлено, что потенциальную селекционную ценность представляет ряд сортов из России, по два из Украины и Канады, один из Республики Беларусь, все они отличаются высокой семенной продуктивностью и оптимальной для сибирских условий продолжительностью вегетационного периода (табл. 2). Новый стандарт Сибири-ада достоверно превысили по урожайности четыре сорта, но они позднее его на 6– 14 суток, а сорт Надежда имел очень низкий процент белка в семенах – 34 % (-6 % к стандарту).
Заключе ние. Применение метода кластерного анализа позволило систематизировать сорта сои по степени выраженности хозяйственно ценных параметров, сформировать шесть основных кластеров, наиболее схожих по комплексу изучаемых признаков, и провести их сравнительную оценку.
Полученные результаты свидетельствуют о перспективности использования в селекционных программах сортов из коллекции генетических ресурсов растений ВИР в качестве источников хозяйственно ценных признаков для повышения урожайности и качества семян сои в Сибирском регионе. В контрастных условиях зоны рискованного земледелия достоверно выше нового стандарта Сибириада была урожайность у сортов, имеющих оптимальную высоту стебля и уровень прикрепления нижних бобов: Персона [12] и Гармония [13] (ВНИИ сои, Россия), Антрацит (Украина). Выделены сорта по комплексу показателей: Россия – Осмонь [14] (ВНИИЗБК, лучше стандарта Сибирячка по четырем из семи представленных в таблице 2 признаков), Гармония (пять признаков); Канада – ОАС Vision и Пруденс (четыре признака).
Характеристика лучших сортообразцов сои
Среднее за 2021–2023 гг.
Название сорта / номер кластера |
Страна |
Вегетационный период***, сут. |
Высота, см |
Урожайность, г/м² |
Масса 1000 зерен, г |
Белок, % |
Жир, % |
|
стебля |
прикрепления нижнего боба |
|||||||
Сибирячка, стандарт / 2 |
Россия |
93 |
66 |
9 |
258 |
145 |
38 |
18 |
Сибириада, стандарт / 1 |
93 |
69 |
11* |
327* |
143 |
40* |
19 |
|
Л 52/14 / 3 |
84* |
52 |
5 |
216 |
161** |
40* |
17 |
|
Алтай / 3 |
93 |
63 |
10 |
234 |
128 |
39 |
17 |
|
Зуша / 2 |
94 |
67 |
11* |
255 |
166* |
38 |
17 |
|
Мезенка / 1 |
102 |
81** |
11* |
336* |
120 |
36 |
19 |
|
Осмонь / 1 |
99 |
79** |
14* |
342* |
124 |
36 |
20* |
|
Персона / 5 |
99 |
95** |
11* |
356** |
126 |
36 |
17 |
|
Гармония / 4 |
107 |
95** |
11* |
361** |
167** |
39* |
17 |
|
Надежда / 4 |
104 |
83** |
13** |
398** |
137 |
34 |
17 |
|
ОАС Vision / 1 |
Канада |
103 |
81** |
11* |
334* |
176** |
39 |
17 |
Пруденс / 1 |
103 |
83** |
11* |
308* |
165** |
37 |
18 |
|
Антрацит / 5 |
Украина |
102 |
77* |
15** |
352** |
122 |
38 |
17 |
Денi / 2 |
107 |
70 |
11* |
266 |
113 |
37 |
19 |
|
Припять / 1 |
Беларусь |
105 |
72 |
7 |
346* |
139 |
39 |
18 |
НСР 05 |
- |
9,6 |
1,3 |
25,3 |
14,1 |
1,9 |
1,5 |
* – достоверно лучше стандарта Сибирячка, ** – достоверно лучше стандарта Сибириада; *** – продолжительность вегетационного периода
Список литературы Классификация методом кластеризации сортов сои коллекции ВИР по хозяйственно ценным показателям
- Заостровных В.И., Кадуров А.А. Селекционная ценность исходного материала сои в условиях лесостепи Западной Сибири // Зернобобовые культуры – развивающееся направление в России: сб. мат-лов 1-го Междунар. форума. – Омск: Полиграфический центр КАН, 2016. – С. 44–49.
- Тлеулина З.Т., Омельянюк Л.В., Кипшакбаева Г.А. Комплексная оценка сортов сои мировой селекции в условиях Северного Казахстана // Масличные культуры. – 2023. – Вып. 1 (193). – С. 26–32. DOI: 10.25230/2412-608X-2023-1-193-26-32.
- Сеферова И.В., Перчук И.Н., Бойко А.П. Результаты изучения коллекционных образцов сои на Адлерской опытной станции ВИР в 2016–2018 гг. // Зернобобовые и крупяные культуры. – 2020. – № 3 (35). – С. 51–57. DOI: 10.24411/2309-348X-2020-11185.
- Зинченко А.В., Лынник Д.А., Сидорик И.В., Дидоренко С.В. Изучение скороспелости коллекционного материала сои в условиях Северного Казахстана // Зернобобовые и крупяные культуры. – 2022. – № 2 (42). – С. 33–40. DOI: 10.24412/2309-348X-2022-2-33-40.
- Сеферова И.В. Соя в условиях северо-за-пада Российской Федерации // Масличные культуры. Науч.-тех. бюл. ВНИИМК. – 2016. – Вып. 3 (167). – С. 101–105.
- Кодирова Г.А., Кубанкова Г.В., Литвиненко О.В. Классификация сортов сои амурской селекции по биохимическим показателям методом кластеризации // Вестник КрасГАУ. – 2022. – № 11. – С. 54–61. DOI: 10.36718/1819-4036-2022-11-54-61.
- Мусинов К.К., Сурначев А.С. Изучение коллекционных образцов пшеницы мягкой озимой с использованием кластерного анализа и метода главных компонент // Достижения науки и техники АПК. – 2024. – Т. 38. – № 3. – С. 4–9. DOI: 10.53859/02352451-2024-38-3-4.
- Klyuchko O.M. Cluster analysis in biotech-nology // Biotechnologia Acta. – 2017. – V. 10. – No. 5. – P. 5–18.
- Пашина Л.Л., Малашонок А.А. Оценка кластерного потенциала соевого подком-плекса Амурской области // Вестник Воронежского ГАУ. – 2017. – № 1 (52). – С. 199–206. DOI: 10.17238/issn2071-2243.2017.1.199.
- Коллекция мировых генетических ресурсов зерновых бобовых ВИР: пополнение, сохранение и изучение / Под науч. ред. М.А. Вишняковой. 2-е изд. – СПб.: ВИР, 2018. – 143 с.
- Доспехов Б.А. Методика полевого опыта (с основами статистической обработки результатов исследований). – М.: Агропромиздат, 1985. – 351 с.
- Соя Гармония от ВНИИ сои: [Электронный ресурс]. – Главный сайт для агрономов России. – Режим доступа: https://glavag-ronom.ru/base/seeds/maslichnie-soya-garmoniya-vnii-soi-6907646?ysclid=m1t3c7mgqi199495997 (дата обращения 01.10.2024).
- Соя Персона от ВНИИ сои: [Электронный ресурс]. – Главный сайт для агрономов России. – Режим доступа: https://glavag-ronom.ru/base/seeds/maslichnie-soya-persona-vnii-soi-9053050?ysclid=m1t3iill2r700346293 (дата обращения 01.10.2024).
- Соя Осмонь: [Электронный ресурс]. – Официальный сайт Федерального научного центра зернобобовых и крупяных культур. – Режим доступа: https://vniizbk.ru/progress/vari-eties/13-soya/437-2019-12-30-07-30-10.html (дата обращения 01.10.2024).