Консенсусная оценка in silico общей безопасности мультитаргетных RAGE-ингибиторов
Автор: Васильев П.М., Спасов А.А., Кочетков А.Н., Перфильев М.А., Королева А.Р., Голубева А.В., Мартынова Д.О., Бабков Д.А., Литвинов Р.А.
Журнал: Волгоградский научно-медицинский журнал @bulletin-volgmed
Статья в выпуске: 2 (66), 2020 года.
Бесплатный доступ
На основе нейросетевой модели с использованием докинга среди 87 соединений разных химических классов найдено 10 веществ с возможной высокой RAGE-ингибирующей активностью. Для этих соединений с применением систем Microcosm ADMET, IT Microcosm, PASS, QikProp и on-line ресурсов admetSAR, ProTox, pkCSM, ADMET-PreServ, SwissADME, GUSAR, GEB выполнена консенсусная оценка in silico 12 токсикологических ADMET-характеристик, рассчитаны интегральные оценки общей безопасности и найдены вещества с низким уровнем токсикологических показателей.
Мультитаргетные rage-ингибиторы, консенсусный прогноз, интегральная оценка общей безопасности, сахарный диабет, болезнь альцгеймера
Короткий адрес: https://sciup.org/142225981
IDR: 142225981
Список литературы Консенсусная оценка in silico общей безопасности мультитаргетных RAGE-ингибиторов
- Консенсусная оценка in silico острой токсичности мультитаргетных RAGE-ингибиторов [Текст] / П. М. Васильев [и др.] // Вестник ВолгГМУ. - 2020. -№ 1 (73). - С. 31-33.
- Консенсусный прогноз in silico канцерогенной опасности мультитаргетных RAGE-ингибиторов [Текст] / П. М. Васильев [и др.] // Волгоградский научно-медицинский журнал. - 2020. - № 1. - С. 55-57.
- Прогноз спектра биологической активности органических соединений [Текст] / Д. А. Филимонов [и др.] // Рос. хим. ж. (Ж. Рос. хим. об-ва им. Д. И. Менделеева). - 2006. - Т. 50. - № 2. - С. 66-75.
- AdmetSAR: a comprehensive source and free tool for evaluating chemical ADMET properties [Text] / F. Cheng [et al.] // J. Chem. Inf. Model. - 2012. -Vol. 52, Iss. 11. - P. 3099-3105.
- Common neurodegenerative pathways in obesity, diabetes, and Alzheimer's disease [Text] / S. Pugazhenthi [et al.] // Biochim. Biophys. Acta Mol. Basis Dis. - 2017. - Vol. 1863. - Iss. 5. - P. 1037-1045.
- Computer modeling of blood brain barrier permeability for physiologically active compounds [Text] / O. A. Raevsky [et al.] // Biochemistry (Moscow) Supplement Series B: Biomedical Chemistry. - 2013. -Vol. 7. - № 2. - P. 95-107.
- Consensus Drug Design Using IT Microcosm [Text] / P. M. Vassiliev [et al.] // Application of Computational Techniques in Pharmacy and Medicine / еds. L. Gorb, V. Kuz'min, E. Muratov // Challenges and Advances in Computational Chemistry and Physics / еd. J. Leszczynski. - Vol. 17. - Dordrecht (Netherlands): Springer Science + Business Media, 2014. - P. 369-431.
- Mechanisms of disease: advanced glycation end-products and their receptor in inflammation and diabetes complications [Text] / S. F. Yan [et al.] // Nat. Clin. Pract. Endocrinol. Metab. - 2008. - Vol. 4. -Iss. 5. - P. 285-293.
- Neural network modeling of multitarget RAGE inhibitory activity [Text] / P. M. Vassiliev [et al.] // Biochemistry (Moscow) Supplement Series B: Biomedical Chemistry. - 2019. - Vol. 13, №. 3. -P. 256-263.
- pkCSM: predicting small-molecule pharmacokinetic properties using graph-based signatures [Text] / D. E. V. Pires [et al.] // J. Med. Chem. - 2015. -Vol. 58, Iss. 9. - P. 4066-4072.
- ProTox: a web server for the in silico prediction of rodent oral toxicity [Text] / M. N. Drwal [et al.] // Nucleic Acids Res. - 2014. - Iss. 42. - P. 53-58.
- QikProp 3.5: User Manual [Text] // Schrodinger Press. - New York (USA): Schrodinger Press, 2012. - 42 p.
- QSAR modelling of rat acute toxicity on the basis of PASS prediction [Text] / A. Lagunin [и др.] // Mol. Informatics. - 2011. - Vol. 30, Iss. 2-3. - P. 241-250.
- Receptor for AGEs (RAGE) as mediator of NF-kB pathway activation in neuroinflammation and oxidative stress [Text] / J. C. Tobon-Velasco [et al.] // CNS Neurol. Disord. Drug Targets. - 2014 -Vol. 13. - Iss. 9. - P. 1615-1626.
- SwissADME: a free web tool to evaluate pharmacokinetics, drug-likeness and medicinal chemistry friendliness of small molecules [Text] / A. Daina [et al.] // Sci. Rep. - 2017. Iss. 7. - Art. 42717.
- System for prediction of pharmacokinetic properties and toxicity of drug compounds [Text] / E. V. Radchenko [et al.] // XX Mendeleev Congress on general and applied chemistry. - 2016. -Vol. 4. - P. 424.
