Локализованные моды дисторсии в структуре двойной спирали ДНК

Наймарк О.Б.

Журнал: Российский журнал биомеханики @journal-biomech

Статья в выпуске: 4 (34) т.10, 2006 года.

Бесплатный доступ

Так как реальные механизмы некоторых биологических процессов, включающие дезоксирибонуклеиновую кислоту (ДНК), до сих пор неизвестны, биологи уделяют все большее внимание структурным аспектам с целью выяснить действительные механизмы репликации (повторение процесса), транскрипции (первого этапа реализации генетической информации в клетке, результатом которого является биосинтез молекул рибонуклеиновой кислоты (РНК) на матрице ДНК) и денатурации (процесса расщепления белковых молекул). В настоящей работе сделаны попытки на основе решения статистической задачи о поведении ансамбля дефектов предложить уравнение движения в виде специальной формы уравнения Гинзбурга-Ландау для параметров порядка, отражающего поведение локализованных дисторсий в структуре ДНК, и исследовать динамические свойства данной системы. Показано, что динамика локализованных мод дисторсии может быть связана с новым типом критических явлений - структурно-скейлинговыми переходами, которые характерны для неравновесных систем с «медленной динамикой». Установлен вид дополнительного параметра порядка для данных систем - структурный параметр скейлинга, который играет роль «эффективных температур» неравновесной системы. Проведенный анализ автомодельных решений выявил существование трех типов коллективных мод в ансамблях дефектов в соответствующих интервалах структурного параметра скейлинга. Показано соответствие характерных коллективных мод трем типам универсальных статистических распределений в суперстатистике неравновновесных систем с медленной динамикой. Обсуждается возможная связь динамики коллективных мод с механизмами транскрипции и репликации.

дезоксирибонуклеиновая кислота (днк) \ двойная спираль \ структура \ ансамбль дефектов \ статистический анализ \ параметр порядка \ скейлинг \ неравновесные системы

Похожие статьи в разделе Механика

Топологические солитоны в двухцепочечной модели ДНК
Топологические солитоны в двухцепочечной модели ДНК

Закирьянов Фарит Кабирович, Хамзин Салават Рифовим, Юлмухаметов Константин Раисович

Топологические солитоны в однородной асимметричной модели молекулы ДНК
Топологические солитоны в однородной асимметричной модели молекулы ДНК

Закирьянов Фарит Кабирович, Хамзин Салават Рифович

Некоторые автомодельные закономерности развития поврежденности при квазихрупком разрушении твёрдых тел
Некоторые автомодельные закономерности развития поврежденности при квазихрупком разрушении твёрдых тел

Пантелеев Иван Алексеевич, Плехов Олег Анатольевич, Наймарк Олег Борисович

Короткий адрес: https://sciup.org/146215872

IDS: 146215872   |   УДК: 531/534: