Математическое моделирование инвазивной карциномы в условиях анизотропии химических полей: почкование и миграция раковых клеток

Автор: Красняков И.В.

Журнал: Российский журнал биомеханики @journal-biomech

Статья в выпуске: 3 (97) т.26, 2022 года.

Бесплатный доступ

За последнее десятилетие произошли изменения в подходе к изучению злокачественных опухолей. Стало известно, что опухоль является гетерогенным скоплением раковых клеток и в ходе своей эволюции может образовывать различные пространственные структуры для коллективной инвазии и миграции. Одним из процессов, обусловливающих злокачественность, является почкообразование раковых клеток на инвазивном фронте опухоли. Новая парадигма к рассмотрению опухоли и проявляющиеся эффекты при её эволюции требуют изучения не только медицинскими методами, но и методами математического моделирования. Применяя методы математического моделирования при изу-чении злокачественных новообразований, становится возможным взглянуть на процессы в динамике, протекающие во время роста опухоли. В данной работе мы разрабатываем математическую модель роста гетерогенной инвазивной карциномы. В основе модели лежит модель клетки с индивидуальной динамикой, что позволяет нам в определённой степени детально описать исследуемый объект. При моделировании был воспроизведён эффект почкообразования во время роста карциномы криброзного типа. Проведено качественное сравнение с результатами клинических исследований гистологических срезов. Также изме-рена количественная характеристика, индекс эпителиально-мезенхимального перехода, которая сопоставляется с фенотипом клетки в живой ткани. Показана динамика образования клеток-почек, их перемещение возле фронта опухоли и амебоидная миграция в ткани эпителия. Также показано образование вторичного очага опухоли в результате мезенхимально-эпителиального перехода. Результаты исследования позволяют демонстрировать динамику развития злокачественных образований и присущих им эффектов.

Еще

Математическое моделирование, раковые структуры, амебоидная миграция, эпителиально-мезенхимальный переход, почкование опухоли, моделирование рака

Короткий адрес: https://sciup.org/146282599

IDR: 146282599   |   DOI: 10.15593/RZhBiomeh/2022.3.03

Список литературы Математическое моделирование инвазивной карциномы в условиях анизотропии химических полей: почкование и миграция раковых клеток

  • Воротников А.В. Хемотаксис: движение, направление, управление // Успехи биологической химии. - 2011. -Т. 51. - С. 335-400.
  • Ермилова Е.В. Подвижность и поведение микроорганизмов. Том 1. Прокариоты / Е.В. Ермилова, Ж.М. Залуцкая, Т.В. Лапина. - СПб.: Изд-во С.-Петерб. ун-та, 2004. - 192 с.
  • Красняков И.В., Брацун Д.А. Математическое моделирование формирования малоклеточных групп инвазивной карциномы неспецифического типа // Российский журнал биомеханики. - 2021. - Т. 25, № 2. - С. 173-185.
  • Красняков И.В., Брацун Д.А., Письмен Л.М. Математическое моделирование роста карциномы при динамическом изменении фенотипа клеток // Компьютерные исследования и моделирование. -2018. - Т. 10, № 6. - С. 879-902.
  • Крахмаль Н.В., Завьялова М.В., Денисов Е.В. Инвазия опухолевых эпителиальных клеток: механизмы и проявления // Acta Naturae. - 2015. - Т. 7, № 2. - С. 1831.
  • Ambrossi D., Gamba A. Cell directional and chemotaxis in vascular morphogenesis // Bull. Math. Biol. - 2004. -Vol. 66. - P. 1851-1873.
  • Bratsun D.A., Krasnyakov I.V., Pismen L.M. Biomechanical modeling of invasive breast carcinoma under a dynamic change in cell phenitype: collective migration of large groups of cells // Biomechanics and Modeling in Mechanobiology. - 2019. - Vol. 19. - P. 723-743.
  • Chavey D. Tilings by regular polygons - II: a catalog of tilings // Computers & Mathematics with Applications. -1989. - Vol. 17. - P. 147-165.
  • Denisov E.V., Gerashchenko T.S., Zavyalova M.V., et al. Invasive and drug resistant expression profile of different morphological structures of breast tumors // Neoplasma. -2015. - Vol. 62. - P. 405-411.
  • Denisov E.V., Skryabin N.A., Gerashchenko T.S. et al. Clinically relevant morphological structures in breast cancer represent transcriptionally distinct tumor cell populations with varied degrees of epithelial-mesenchymal transition and CD44+CD24- stemness // Oncotarget. - 2017. - Vol. 8, N. 37. - P. 61163-61180.
  • Dilao R. Mathematical models of morphogenesis // ITM Web of Conferences. - 2015. - Vol. 4. - Art. 01001.
  • Domschke P., Trucu D., Gerisch A., et al. Mathematical modelling of cancer invasion: Implications of cell adhesion variability for tumour infiltrative growth patterns // Journal of Theoretical Biology. - 2014. - Vol. 361. - P. 41-60.
  • Franssen L.C., Lorenzi T., Burgess A., et al. A Mathematical Framework for Modelling the Metastatic Spread of Cancer // Bull. Math. Biol. - 2019. - Vol. 81. -P. 1965-2010.
  • Friedl P., Locker J., Sahai E., et al. Classifying collective cancer cell invasion // Nat. Cell. Biol. - 2012. - Vol. 14, N. 8, - P. 777-783.
  • Grigore A.D., Jolly M.K., Jia D., et al. Tumor Budding: The Name is EMT. Partial EMT // Journal of Clinical Medicine. - 2016. - Vol. 5. - Art. 51.
  • Guillot C., Lecuit T. Mechanics of epithelial tissue homeostasis and morphogenesis // Science. - 2013. - Vol. 340. - P. 1185-1189.
  • Johnston S.T., Simpson M.J., Plank M.J. Lattice-free descriptions of collective motion with crowding and adhesion // Phys. Rev. E. - 2013. - Vol. 88. - Art. 062720.
  • Koelzer V.H., Zlobec I., Lugli A. Tumor budding in colorectal cancer-ready for diagnostic practice? // Human Pathology. - 2016. - Vol. 47. - P. 4-19.
  • Lammermann T., Sixt M. Mechanical modes of 'ameboid' cell migration // Curr. Opin. Cell Biol. - 2009. - Vol. 21. - P. 636-644.
  • Lesne A., Foray N., Cathala G., Forne T., Wong H., Victor J.-M. Chromatin fiber allostery and the epigenetic code // J. Phys. Condens. Matter. - 2015. - Vol. 27. - P. 064114.
  • Lugli A., Karamitopoulou E., Panayiotides I., at al. CD8+ lymphocytes/tumour-budding index: an independent prognostic factor representing a 'pro-/anti-tumour' approach to tumour host interaction in colorectal cancer // British Journal of Cancer. - 2009. - Vol. 101. - P. 13821392.
  • Netti P.A., Baxter L.T., Boucher Y., et al. Macro- and microscopic fluid transport in living tissues: application to solid tumors // AIChE Journal. - 1997. - Vol. 43. - P. 818-834.;
  • Roberto M., Sandrine E.-M. The front and rear of collective cell migration // Nat. Rev. Mol. Cell. Biol. -2016. - Vol. 17. - P. 97-109.
  • Salm M., Pismen L.M. Chemical and mechanical signaling in epithelial spreading // Phys. Biol. - 2012. -Vol. 9, No. 2. - P. 026009-026023.
  • Sinn H.P., Kreipe H. A brief overview of the WHO classification of breast tumors, 4th edition, focusing on issues and updates from the 3rd edition // Breast Care. -2013. - Vol. 8(2). - P. 149-154.
  • Stinner B., Bretschneider T. Mathematical modelling in cell migration: tackling biochemistry in changing geometries // Biochem. Soc. Transactions. - 2020. - Vol. 48. - P. 419-428.,
  • Tabassum D.P., Polyak K. Tumorigenesis: it takes a village. // Nat. Rev. Cancer. - 2015. - Vol. 8. -P. 473-483.
  • Tashireva L.A., Zavyalova M.V., Savelieva O.E., et al. Single Tumor Cells With Epithelial-Like Morphology Are Associated With Breast Cancer Metastasis // Front. Oncol. - 2020 - Vol. 10. - Art. 50.
  • World Cancer Report Cancer research for cancer prevention / Edited by C.P. Wild, E. Weiderpass, B.W. Stewart - IARC, 2020. - 611 p.
Еще
Статья научная