Метод извлечения значимой информации из масс-спектров пептидов
Автор: Макаров В., Самокиш А., Лютвинский Я.И.
Журнал: Научное приборостроение @nauchnoe-priborostroenie
Рубрика: Масс-спектрометрия для биотехнологии
Статья в выпуске: 2 т.14, 2004 года.
Бесплатный доступ
Описан метод обработки масс-спектров пептидов с целью извлечения информации о массах молекул пробы. Предметом обработки является массив данных о молекулярных пиках, выделенных на стадии предварительной обработки. Метод основан на анализе и декомпозиции структуры масс-спектра и предполагает использование статистических данных о форме изотопных распределений молекулярных пиков пептидов, которые получены методом численного моделирования на множестве идеализированных масс-спектров пептидов. Приводится описание алгоритма, реализующего предложенный метод, а также результаты обработки набора тестовых данных.
Короткий адрес: https://sciup.org/14264342
IDR: 14264342 | УДК: 621.384.668.8:
Data mining method for peptide mass spectra
A data mining method performing isotope and charge state decomposition of peptide mass spectra is described. The method uses the peak table as an input and is based on the analysis and decomposition of the mass spectrum structure. Isotope cluster statistics is used as a base of decomposition. This statistic is calculated on a set of simulated mass spectra. The described method is programmed as a fast routine. The results of real spectra decomposition are presented.
