Микросателлитные локусы для идентификации сортов льна масличного селекции ВНИИМК: подбор информативных праймеров и оптимальных условий ПЦР ДНК
Автор: Челюстникова Т.А., Гучетль С.З., Антонова Т.С.
Рубрика: Селекция и семеноводство сельскохозяйственных растений
Статья в выпуске: 2 (178), 2019 года.
Бесплатный доступ
Целью исследования данной работы является подбор информативных микросателлитных локусов и оптимальных условий ПЦР ДНК для создания молекулярно-генетических паспортов льна селекции ВНИИМК. Материалом для исследования служили восемь образцов льна масличного лаборатории селекции льна ВНИИМК: ВНИИМК 620, К4193, К4194, К4195, К4196, К4197, К4198, К4199. ДНК выделяли из растений, выращенных до стадии «елочки», с использованием СТАВ-буфера. Для проведения работы были выбраны 10 микросателлитных локусов. В результате работы для каждой пары праймеров, в соответствии с их нуклеотидной последовательностью, был произведен подбор оптимальной температуры отжига. Она составила от 58 до 60 оС. ПЦР ДНК с данными праймерами выявила 11 микросателлитных локусов у восьми генотипов льна. В зависимости от локуса число аллелей варьировало от 2 до 4 (в среднем 3 аллеля на локус). Эффективное число аллелей ne составило от 1,42 до 3,22, а значение индекса полиморфного информационного содержания PIC - от 0,30 до 0,69...
Лен, днк, полимеразная цепная реакция, микросателлиты
Короткий адрес: https://sciup.org/142220380
IDR: 142220380 | DOI: 10.25230/2412-608X-2019-2-178-41-46
Список литературы Микросателлитные локусы для идентификации сортов льна масличного селекции ВНИИМК: подбор информативных праймеров и оптимальных условий ПЦР ДНК
- Галкин Ф.М. Лён масличный: селекция, семеноводство, технология возделывания и уборки/Под ред. Н.И. Бочкарёва. -Краснодар, 2008. -С. 7-65.
- Дьяков А.Б. Физиология и экология льна. -Краснодар, 2006. -214 с.
- Лукомец В.М., Кочегура А.В., Рябенко Л.Г. Современное состояние производства и научного обеспечения льна масличного//Роль льна в улучшении среды обитания и активном долголетии человека: материалы междунар. науч.-практ. семинара, г. Торжок, 26-28 сентября 2011 г. -Тверь: Твер. гос. ун-т, 2012. -С. 33-43.
- Плугатарь Ю.В., Бабкина Р.Д., Супрун И.И., Науменко Т.С., Алексеев Я.И. Оценка сортов груш, выделенных из генофондовой коллекции Никитского ботанического сада по комплексу хозяйственно ценных признаков с помощью микросателлитных маркеров//Вавиловский журнал генетики и селекции. -2018. -№. 22 (1). -С. 60-68 DOI: 10:18699|VJ18.322
- Чесноков Ю.А. ДНК-фингепринт и анализ генетического разнообразия у растений//Сельскохозяйственная биология. -2005. -№ 1. -С. 20-40.
- Brown S.M., Szewc McFadden A.K., Kresovich S. Development and application of simple sequence repeat (SSR) loci for plant genome analysis//In: Methods of genome analysis in plants/Ed. P.P. Jauhar. -N.-Y., London, Tokyo, 1996. -P. 147-159.
- Рамазанова С.А., Гучетль С.З., Челюстникова Т.А., Антонова Т.С. Полиморфизм микросателлитных локусов ДНК у сортов сои селекции ВНИИМК//Современные проблемы научного обеспечения производства подсолнечника: сборник докладов междунар. науч.-практ. конф., посвященной 120-летию со дня рождения акад. В.С. Пустовойта. ВНИИ масличных культур. -2006. -С. 234-239.
- Гучетль С.З., Челюстникова Т.А., Рамазанова С.А., Антонова Т.С. Молекулярно-генетическая характеристика инбредных линий подсолнечника по изоферментным маркерам и ДНК-профилям//Масличные культуры. Науч.-тех. бюл. ВНИИМК. -2004. -Вып. 2 (131). -С. 42-46.
- Cloutier S., Ragupathy R., Niu Z., Duguid S. SSR-based linkage map of flax (Linum usitatissimum L.) and mapping of QTLs underlying fatty acid composition traits//Mol. Breed. -2011. -V. 13 (4). -P. 437-451
- DOI: 10.1007/s11032-010-9494-1
- Ущаповский И.В., Лемеш В.А., Богданова М.В., Гузенко Е.В. Особенности селекции и перспективы применения молекулярно-генетических методов в генетико-селекционных исследованиях льна (Linum usitatissimum L.)//Сельскохозяйственная биология. -2016. -Т. 51. -№ 5. -С. 602-616
- DOI: 10.15389/agrobiology.2016.5.602rus
- Varshney R.K., Glaszmann J.C., Leung H., Ribaut J.M. More genomic resources for less-studied crops//Trends. Biotechnol. -2010. -V. 28 (9). -P. 452-460
- DOI: 10.1016/j.tibtech.2010.06.007
- Xin Deng, SongHua Long, DongFeng He, Xiang Li, YuFu Wang, DongMei Hao, CaiSheng Qiu and XinBo Chen. Isolation and characterization of polymorphic microsatellite markers from flax (Linum usitatissmum L.)//African Journal of Biotechnology. -2011. -Vol. 10 (5). -P. 734-739.
- Леонова И.Н. Молекулярные маркеры: использование в селекции зерновых культур для идентификации, интрогрессии и пирамидирования генов//Вавиловский журнал генетики и селекции. -2013. -Т. 17. -№ 2. -С. 314-325.
- Гучетль С.З., Фролов С.С., Зайцев Р.Н., Кузнецова Е.С. Паспортизация линий и гибридов подсолнечника селекции Армавирской опытной станции ВНИИМК: подбор оптимальных ДНК локусов и условий ПЦР//Масличные культуры. Науч.-тех. бюл. ВНИИМК. -2017. -Вып. 3 (171). -С. 23-28.
- Saghai-Maroof M.A., Soliman K.M., Jorgensen R A., Allard R.W. Ribosomal DNA spacer-length polymorphisms in barley: Mendelian inheritance, chromosomal location, and population dynamics//PNAS USA. -1984. -V. 81. -P. 8014-8018.
- Использование ПЦР-анализа в генетико-селекционных исследованиях: Научно-методическое руководство/Под ред. Сиволапа Ю.М. -Киев: Аграрна наука, 1998. -156 с.
- Айала Ф., Дж. Кайгер. Современная генетика. Т. 3. -М.: Мир, 1988. -332 с.
