Моделирование актин-миозинового мотора скелетных мышц: влияние температуры и биохимических параметров на механику стационарных сокращений
Автор: Шворина Е.Н.
Журнал: Российский журнал биомеханики @journal-biomech
Статья в выпуске: 1 (63) т.18, 2014 года.
Бесплатный доступ
Кинетическая схема взаимодействия миозиновых поперечных мостиков с актином, АТФ и продуктами ее гидролиза, АДФ и неорганическим фосфатом состоит из нескольких присоединенных к актину и отсоединенных от него состояний миозиновой головки и функций перехода из одного состояния в другое. Соответствующая математическая модель представляет собой систему дифференциальных уравнений первого порядка в частных производных для плотностей распределения концентраций мостиков в каждом из состояний. Цель работы состояла в создании программного продукта для расчета различных кинетических моделей мышечного сокращения, а также в разработке конкретной кинетической модели, воспроизводящей результаты экспериментальных исследований стационарных сокращений мышцы при различных значениях температуры и концентраций АТФ, АДФ и неорганического фосфата. Реализован программный модуль, позволяющий рассчитать микро- и макроскопические характеристики мышечного волокна при изометрическом сокращении в условиях полной активации и в ходе стационарного укорочения с постоянной скоростью. Разработана модель, включающая в себя семь присоединенных и три отсоединенных состояния миозинового мостика, которая представляет собой обобщение модели Ferenczi et al. (2005), предложенной ранее для описания структурных изменений в сокращающихся мышечных клетках. Расчеты воспроизводят экспериментальные зависимости динамической жесткости волокна, развиваемой им силы и скорости потребления АТФ от скорости деформации (укорочения) волокна, температуры и концентраций субстрата и продуктов гидролиза АТФ.
Актин, миозин, мышечное сокращение, модель
Короткий адрес: https://sciup.org/146216127
IDR: 146216127
Список литературы Моделирование актин-миозинового мотора скелетных мышц: влияние температуры и биохимических параметров на механику стационарных сокращений
- Цатурян А.К., Антипов Д.M. Кинетическая модель мышцы: моделирование стационарных сокращений//Биофизика. -1991. -Т. 36, № 4. -С. 669-675.
- Bershitsky S.Y., Tsaturyan A.K. The elementary force generation process probed by temperature and length perturbations in muscle fibres from the rabbit//The Journal of Physiology. -2002. -Vol. 540, № 3. -P. 971-988.
- Caremani M., Dantzig J., Goldman Y.E., Lombardi V., Linari M. Effect of inorganic phosphate on the force and number of myosin cross-bridges during the isometric contraction of permeabilized muscle fibers from rabbit psoas//Biophysical Journal. -2008. -Vol. 95, № 12. -P. 5798-5808.
- Cooke R., Bialek W. Contraction of glycerinated muscle fibers as a function of the ATP concentration//Biophysical Journal. -1979. -Vol. 28, № 2. -P. 241-258.
- Cooke R., Pate E. The effects of ADP and phosphate on the contraction of muscle fibers//Biophysical Journal. -1985. -Vol. 48, № 5. -P. 789-798.
- Coupland M.E., Puchert E., Ranatunga K.W. Temperature dependence of active tension in mammalian (rabbit psoas) muscle fibres: effect of inorganic phosphate//The Journal of Physiology. -2001. -Vol. 536, № 3. -P. 879-891.
- Coupland M.E., Pinniger G.J., Ranatunga K.W. Endothermic force generation, temperature-jump experiments and effects of increased [MgADP] in rabbit psoas muscle fibres//The Journal of Physiology. -2005. -Vol. 567, № 2. -P. 471-492.
- Dantzig J.A., Hibberd M.G., Trentham D.R., Goldman Y.E. Cross-bridge kinetics in the presence of MgADP investigated by photolysis of caged ATP in rabbit psoas muscle fibres//The Journal of Physiology. -1991. -Vol. 432 -P. 639-680.
- Dantzig J.A., Goldman Y.E., Millar N.C., Lacktis J., Homsher E. Reversal of the cross-bridge force-generating transition by photogeneration of phosphate in rabbit psoas muscle fibres//The Journal of Physiology. -1992. -Vol. 451. -P. 247-278.
- Dantzig J.A., Barsotti R.J., Manz S., Sweeney H.L., Goldman Y.E. The ADP release step of the smooth muscle cross-bridge cycle is not directly associated with force generation//Biophysical Journal. -1999. -Vol. 77, № 1. -P. 386-397.
- Eisenberg E., Hill T.L., Chen Y. Cross-bridge model of muscle contraction. Quantitative analysis//Biophysical Journal. -1980. -Vol. 29, № 2. -P. 195-227.
- Ferenczi M.A., Goldman Y.E., Simmons R.M. The dependence of force and shortening velocity on substrate concentration in skinned muscle fibres from Rana temporaria//The Journal of Physiology. -1984. -Vol. 350. -P. 519-543.
- Ferenczi M.A., Bershitsky S.Y., Koubassova N., Siththanandan V., Helsby W.I., Panine P., Roessle M., Narayanan T., Tsaturyan A.K. The "roll and lock" mechanism of force generation in muscle//Structure. -2005. -Vol. 1, № 13. -P. 131-141.
- Ford L.E., Huxley A.F., Simmons R.M. Tension transients during steady shortening of frog muscle fibres//The Journal of Physiology. -1985. -Vol. 361. -P. 131-150.
- Geeves M.A., Holmes K.C. The molecular mechanism of muscle contraction//Advances in Protein Chemistry. -2005. -Vol. 71. -P. 161-193.
- Gyimesi M., Kintses B., Bodor A., Perczel A., Fischer S., Bagshaw C.R., Málnási-Csizmadia A. The mechanism of the reverse recovery step, phosphate release, and actin activation of Dictyostelium myosin II//The Journal of Biological Chemistry. -2008. -Vol. 283, № 13. -P. 8153-8163.
- He Z.H., Bottinelli R., Pellegrino M.A., Ferenczi M.A., Reggiani C. ATP consumption and efficiency of human single muscle fibers with different myosin isoform composition//Biophysical Journal. -2000. -Vol. 79, № 2. -P. 945-961.
- Huxley A.F. Muscle structure and theories of contraction//Progress in Biophysics and Biophysical Chemistry. -1957. -Vol. 7. -P. 255-318.
- Karatzaferi C., Chinn M.K., Cooke R. The force exerted by a muscle cross-bridge depends directly on the strength of the actomyosin bond//Biophysical Journal. -2004. -Vol. 87, № 4. -P. 2532-2544.
- Lewalle A., Steffen W., Stevenson O., Ouyang Z., Sleep J. Single-molecule measurement of the stiffness of the rigor myosin head//Biophysical Journal. -2008. -Vol. 94, № 6. -P. 2160-2169.
- Linari M., Caremani M., Piperio C., Brandt P., Lombardi V. Stiffness and fraction of myosin motors responsible for active force in permeabilized muscle fibers from rabbit psoas//Biophysical Journal. -2007. -Vol. 92, № 7. -P. 2476-2490.
- Linari M., Dobbie I., Reconditi M., Koubassova N., Irving M., Piazzesi G., Lombardi V. The stiffness of skeletal muscle in isometric contraction and rigor: the fraction of myosin heads bound to actin//Biophysical Journal. -1998. -Vol. 74, № 5. -P. 2459-2473.
- Málnási-Csizmadia A., Woolley R.J., Bagshaw C.R. Resolution of conformational states of Dictyostelium myosin II motor domain using tryptophan (W501) mutants: implications for the open-closed transition identified by crystallography//Biochemistry. -2000. -Vol. 39, № 51. -P. 16135-16146.
- Pate E., Cooke R. A model of cross-bridge action: the effects of ATP, ADP and Pi//Journal of Muscle Research and Cell Motility. -1989. -Vol. 10. -P. 181-196.
- Pate E., Wilson G.J., Bhimani M., Cooke R. Temperature dependence of the inhibitory effects of orthovanadate on shortening velocity in fast skeletal muscle//Biophysical Journal. -1994. -Vol. 66, № 5. -P. 1554-1562.
- Piazzesi G., Reconditi M., Koubassova N., Decostre V., Linari M., Lucii L., Lombardi V. Temperature dependence of the force-generating process in single fibres from frog skeletal muscle//The Journal of Physiology. -2003. -Vol. 549, № 1. -P. 93-106.
- Propp M.B. A model of muscle contraction based upon component studies//Lectures on Mathematics in the Life Sciences. -1986. -Vol. 16. -P. 61-74.
- Rall J.A., Woledge R.C. Influence of temperature on mechanics and energetics of muscle contraction//American Journal of Physiology. -1990. -Vol. 259, № 2. -P. R197-R203.
- Smith D.A., Geeves M.A. Strain-dependent cross-bridge cycle for muscle//Biophysical Journal. -1995. -Vol. 69. -P. 524-537.
- Steffen W., Sleep J. Using optical tweezers to relate the chemical and mechanical cross-bridge cycles//Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences. -2004. -Vol. 359, № 1452. -P. 1857-1865.
- Stienen G.J., Kiers J.L., Bottinelli R., Reggiani C. Myofibrillar ATPase activity in skinned human skeletal muscle fibres: fibre type and temperature dependence//The Journal of Physiology. -1996. -Vol. 493, № 2. -P. 299-307.
- Takagi Y., Shuman H., Goldman Y.E. Coupling between phosphate release and force generation in muscle actomyosin//Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences. -2004. -Vol. 359, № 1452. -P. 1913-1920.
- Tesi C., Colomo F., Nencini S., Piroddi N., Poggesi C. Modulation by substrate concentration of maximal shortening velocity and isometric force in single myofibrils from frog and rabbit fast skeletal muscle//The Journal of Physiology. -1999. -Vol. 516, № 3. -P. 847-853.
- Tesi C., Colomo F., Nencini S., Piroddi N., Poggesi C. The effect of inorganic phosphate on force generation in single myofibrils from rabbit skeletal muscle//Biophysical Journal. -2000 -Vol. 78, № 6. -P. 3081-3092.
- Thirlwell H., Corrie J.E., Reid G.P., Trentham D.R., Ferenczi M.A. Kinetics of relaxation from rigor of permeabilized fast-twitch skeletal fibers from the rabbit using a novel caged ATP and apyrase//Biophysical Journal. -1994. -Vol. 67, № 6. -P. 2436-2447.
- Urbanke C., Wray J. A fluorescence temperature-jump study of conformational transitions in myosin subfragment 1//Biochemical Journal. -2001. -Vol. 358, № 1. -P. 165-173.
- Zeng W., Conibear P.B., Dickens J.L., Cowie R.A., Wakelin S., Málnási-Csizmadia A., Bagshaw C.R. Dynamics of actomyosin interactions in relation to the cross-bridge cycle//Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences. -2004. -Vol. 359, № 1452. -P. 1843-1855.