Моделирование гидролиза животного белка эндопротеазами in silico

В последнее время повышенным спросом пользуются продукты питания с функциональной направленностью, способствующие укреплению здоровья. Перспективным сырьем для такой продукции могут быть субпродукты мясные, например свиные желудки, богатые источником биологически доступного белка. Целью данного исследования была оценка потенциальной биологической активности различных изолятов белка животного происхождения. В качестве объекта исследования был использован белок, идентифицированный в базе UniProt, как VIP_PIG (P01284) или глюкагоноподобный белок. С помощью компьютерного моделирования был проведен анализ прогнозирования вероятности появления биоактивных пептидов после гидролиза белка с помощью протеиназы К, термолизина и пепсина (рН>2). Установлено, что данные протеазы продемонстрировали высокий потенциал в расщеплении белка на фрагменты. Пепсин (рН>2) способствовал образованию большего количества пептидов в гидролизате. Наиболее длинный пептид FTSDFSR был обнаружен в образцах, подвергшихся обработке термолизином, в то же время данный пептид обладал самой высокой молекулярной массой (859,3944 кДа). Пептид VKKY был признан наиболее часто встречающимся в образцах, обработанных всеми тремя ферментами, и был первым по массе (537,3395) при обработке пепсином (рН>2). Впоследствии были синтезированы шесть биоактивных пептидов, имеющих баллы пептидного ранкера выше 0,5. Дальнейшая работа исследования будет направлена на определение токсичности, аллергенности, а также наличия терапевтического эффекта in silico и in vivo.