Молекулярно-генетический анализ и идентификация популяций Pinus sylvestris L. в Кировской области и Пермском крае

Молекулярно-генетический анализ и идентификация популяций Pinus sylvestris L. в Кировской области и Пермском крае

Автор: Нассонова Елена Сергеевна, Васильева Юлия Сергеевна, Пришнивская Яна Викторовна, Жуланов Андрей Александрович

Журнал: Бюллетень науки и практики @bulletennauki

Рубрика: Биологические науки

Статья в выпуске: 4 т.5, 2019 года.

Бесплатный доступ

Проведен молекулярно-генетический анализ и идентификация 5 выборок Pinus sylvestris L., из Кировской области и Пермского края. Молекулярно-генетический анализ проводили с использованием ISSR-метода анализа полиморфизма ДНК. У пяти изученных выборок сосны обыкновенной выявлено 126 ISSR-маркеров, из которых 122 ( P95 =0,968) были полиморфными. Проведена молекулярно-генетическая идентификация изученных выборок сосны обыкновенной, выявлены идентификационные ISSR-маркеры и их сочетания, составлены молекулярно-генетические формулы и штрихкоды для каждой изученной выборки. Анализ генетической структуры и дифференциации P. sylvestris показал, что выборки распределились в три генетические популяции.

Еще

Issr-маркер, молекулярно-генетическая идентификация, генетическая структура

Короткий адрес: https://sciup.org/14115397

IDR: 14115397   |   DOI: 10.33619/2414-2948/41/05

Список литературы Молекулярно-генетический анализ и идентификация популяций Pinus sylvestris L. в Кировской области и Пермском крае

  • Исаев А. С. Актуальные проблемы национальной лесной политики. М.: Типография ЛЕВКО, 2009. 108 с.
  • Клейнхоф И. А. Глобальные аспекты развития лесного сектора экономики // Лесной вестник. 2008. №5. С. 115-119.
  • Блам Ю. Ш., Бабенко Т. И., Машкина Л. В. Экономические последствия государственного регулирования лесного сектора // Регион: экономика и социология. 2011. №2. С. 211-222.
  • Лесной план Кировской области на 2008-2020 годы // Министерство природных ресурсов, лесного хозяйства и экологии Кировской области. Киров, 2015. Режим доступа: www.kirovreg.ru/publ/akoup.nsf/ (дата обращения 16.03.18).
  • Ларионова А. Я., Кравченко А. Н., Экарт А. К., Орешкова Н. В. Генетическое разнообразие и дифференциация популяций лесообразующих видов хвойных в Средней Сибири // Хвойные бореальной зоны. 2007. Т. 24. №2-3. С. 235-242.
  • Rogers S. O., Bendich A. J. Extraction of DNA from milligram amounts of fresh, herbarium and mummified plant tissues // Plant Molecular Biology. 1985. V. l. №19. P. 69-76.
  • DOI: 10.1007/BF00020088
  • Zietkiewicz E. Genome fingerprinting by Simple Sequence Repeat (SSR) - Anchored Polymerase Chain Reaction Amplification // Genomics. 1994. V. 20. №2. P. 176-183.
  • DOI: 10.1006/geno.1994.1151
  • Бобошина И. В., Нечаева Ю. С., Видякин А. И., Боронникова С. В. Подбор праймеров для проведения ISSR-анализа полиморфизма ДНК Pinus sylvestris L. // Молекулярно-генетические подходы в таксономии и экологии: тезисы научной конференции. Ростов-на-Дону, 2013. С. 17.
  • Видякин А. И., Боронникова С. В., Нечаева Ю. С., Пришнивская Я. В., Бобошина И. В. Генетическая изменчивость, структура и дифференциация популяций сосны обыкновенной (Pinus sylvestris L.) на северо-востоке Русской равнины по данным молекулярно-генетического анализа // Генетика. 2015. Т. 51. №12. С. 1401-1409.
  • DOI: 10.7868/S0016675815120139
  • Yeh F. C., Young R. C., Mao J. et al. POPGENE, the Microsoft Windows-based user-friendly software for population genetic analysis of co-dominant and dominant markers and quantitative traits // Department of Renewable Resources, Univ. of Alberta, Edmonton. Alta. 1999. P. 238.
  • Peakall R. O. D., Smouse P. E. GENALEX 6: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research // Molecular ecology notes. 2006. V. 6. №1. P. 288-295. x.
  • DOI: 10.1111/j.1471-8286.2005.01155
  • Nei M. Molecular Evolutionary Genetics. New York: Columbia University Press, 1987. 512 p.
  • Nei M. Molecular population genetics and evolution. Amsterdam, 1975. 278 p.
  • Smulders M. J. M., van der Schoot J., Arens P. Trinucleotide repeat microsatellite markers for black poplar (Populus nigra L.) // Molecular Ecology Notes. 2001. V. 1. №3. P. 188-190. x.
  • DOI: 10.1046/j.1471-8278.2001.00071
  • Evanno G., Regnaut S., Goudet J. Detecting the number of clusters of individuals using the software STRUCTURE: a simulation study // Molecular ecology. 2005. V. 14. №8. P. 2611-2620. x.
  • DOI: 10.1111/j.1365-294X.2005.02553
  • Earl A., von Holdt M. STRUCTURE HARVESTER: a website and program for visualizing STRUCTURE output and implementing the Evanno method // Conservation genetics resources. 2012. V. 4. №2. P. 359-361.
  • DOI: 10.1007/s12686-011-9548-7
  • Боронникова С. В., Бобошина И. В. Пат. 2012119341 Российская Федерация A01H1/00. Способ молекулярно-генетической идентификации популяций древесных видов растений. Заявитель и патентообладатель ФГБОУ ВПО «Пермский государственный национальный исследовательский университет» №2012119341; заявл.11.05.2012; опубл. 10.02.2014.
  • Боронникова С. В. Молекулярно-генетическая идентификация и паспортизация редких и находящихся под угрозой уничтожения видов растений. Пермь, 2008. 120 с.
  • Боронникова С. В. Молекулярно-генетический анализ и оценка состояния генофондов ресурсных видов растений Пермского края. Пермь, 2013. 223 с.
Еще
Статья научная
QR-код для установки приложения SciUp Наведите камеру и скачайте бесплатное приложение SciUp