Молекулярно-генетический анализ отечественных сортов Solanum tuberosum L

Автор: Печенкина Виктория Андреевна, Жуланов Андрей Александрович, Пришнивская Яна Викторовна, Васильева Юлия Сергеевна, Боронникова Светлана Витальевна

Журнал: Бюллетень науки и практики @bulletennauki

Рубрика: Биологические науки

Статья в выпуске: 3 т.4, 2018 года.

Бесплатный доступ

Исследованы характеристики 12 сортов картофеля ( Solanum tuberosum L., Solanaceae) российского происхождения. Урожайность изученных сортов высока и варьирует в пределах от 25 до 40 т/га; среднее содержание крахмала в клубнях достигает 16%, средняя масса клубней - не менее 10 г. Среди 12 изученных 6 сортов S. tuberosum являются среднеспелыми и 6 - раннеспелыми. Для определения генетического разнообразия сортов S. tuberosum был применен ISSR (Inter Simple Sequence Repeats) - метод анализа полиморфизма ДНК с использованием ПЦР. Из 20 ISSR-праймеров были отобраны 4 наиболее эффективных для изученных сортов S. tuberosum, среди которых два динуклеотидных и два трехнуклеотидных праймера. У изученных сортов установлены 40 ISSR-PСR маркеров. Число амплифицированных ISSR-PCR маркеров S. tuberosum варьировало в зависимости от праймера от 8 (праймер ISSR-5) до 12 (праймер M3) а их размеры - от 210 (ISSR-5) до 1100 (X11) пн. На общую выборку S. tuberosum доля полиморфных локусов составила 0,575, ожидаемая гетерозиготность равна 0,071, определено число эффективных аллелей (ne=1,324). Наибольшие показатели генетического разнообразия отмечены у сорта Чародей S. tuberosum (P95 = 0,303; HE=0,105; ne=1,189). Генетически менее гетерогенен сорт Отрада (P95 = 0,161; HE=0,047; ne=1,079). У изученных сортов картофеля выявлено 9 редких ISSR-PCR маркеров, наибольшее их число выявлено у сорта Чародей (R=6). Даны рекомендации по использованию генетического потенциала изученных сортов S. tuberosum.

Еще

Issr-pcr маркеры, полиморфизм днк, отечественный сорт

Короткий адрес: https://sciup.org/14111868

IDR: 14111868   |   DOI: 10.5281/zenodo.1197620

Список литературы Молекулярно-генетический анализ отечественных сортов Solanum tuberosum L

  • Ahmadvand R., Takács A., Taller J. et al. Potato viruses and resistance genes in potato//Acta Agronomica Hungarica. 2012. V. 60. №3. P. 283-298.
  • Туболев С. С., Колчин Н. Н., Пшеченков К. А. и др. Развитие машинных технологий производства картофеля в России//Достижения науки и техники АПК. 2007. №7. С. 28-31.
  • Zietkiewicz E., Rafalski A., Labuda D. Genome Fingerprinting by Simple Sequence Repeat (SSR)-Anchored Polymerase Chain Reaction Amplification//Genomics. 1994. V. 20. №2. С. 176-183.
  • Nagaoka T., Ogihara Y. Applicability of inter-simple sequence repeat polymorphisms in wheat for use as DNA markers in comparison to RFLP and RAPD markers//TAG Theoretical and Applied Genetics. 1997. V. 94. №5. P. 597-602.
  • Rogers S. O., Bendich A. J. Extraction of DNA from milligram amounts of fresh, herbarium and mummified plant tissues//Plant Molecular Biology. 1985. V. 5. №2. P. 69-76.
  • Календарь Р. Н., Боронникова С. В. Анализ молекулярно-генетического полиморфизма природных популяций редких видов растений Урала с помощью ретротранспозонов//Биотехнология: состояние и перспективы развития: материалы IV Московского междунар. конгр. Т. 2. 2007. С. 121.
  • Антонова О. Ю., Швачко Н. А., Новикова Л. Ю. и др. Генетическое разнообразие сортов картофеля российской селекции и стран ближнего зарубежья по данным полиморфизма SSR-локусов и маркеров R-генов устойчивости//Вавиловский журнал генетики и селекции. 2016. Т. 20. №5. С. 596-606.
  • Consortium T. P. G. S. Genome sequence and analysis of the tuber crop potato//Nature. 2011. V. 475. №7355. P. 189-195.
Еще
Статья научная