Молекулярно-генетический анализ редкого вида растения Pulsatilla patens (L.) Mill. Северного Казахстана
Автор: Пинаева Юлия Юрьевна, Бельтюкова Надежда Николаевна, Пришнивская Яна Викторовна, Султангазина Гульнар Жалеловна, Бейшова Индира Салтановна, Ульянов Вадим Александрович, Бейшов Рустем Салтанович
Журнал: Бюллетень науки и практики @bulletennauki
Рубрика: Биологические науки
Статья в выпуске: 5 т.6, 2020 года.
Бесплатный доступ
Изучено генетическое разнообразие 5 ценопопуляций редкого вида растений Pulsatilla patens (L.) Mill., распространенных на территории Павлодарской, Акмолинской и Костанайской областей Республики Казахстан. Для определения показателей генетического разнообразия был применен метод межмикросателлитного анализа ДНК (ISSR - Inter Simple Sequence Repeats) с использованием полимеразной цепной реакции с 5 праймерами: ISSR-1, ISSR-3, M1, M27, X11. Число полиморфных фрагментов ДНК в суммарной выборке растений варьировало от 9 до 28, а их размеры - от 200 до 1420 пн. Доля полиморфных локусов в общей выборке P. patens явилась высокой и составила 0,965, ожидаемая гетерозиготность равна 0,162, а число эффективных аллелей - 1,361. Показатели генетического разнообразия выше у ценопопуляции из Костанайской области (с. Боровское) HE=0,209, ne=1,743, и ниже у популяции из Павлодарской области HE=0,131, ne=1,597. В изученных ценопопуляциях P...
Ценопопуляция, метод межмикросателлитного анализа (issr)
Короткий адрес: https://sciup.org/14116244
IDR: 14116244 | DOI: 10.33619/2414-2948/54/03
Список литературы Молекулярно-генетический анализ редкого вида растения Pulsatilla patens (L.) Mill. Северного Казахстана
- Красная книга Казахстана. 2-е изд., испр. и доп. Астана: АртРпп1ХХ1, 2014. Т. 2. Растения. 452 с.
- Szczecińska M., Sramko G., Wołosz K., Sawicki J. Genetic diversity and population structure of the rare and endangered plant species Pulsatilla patens (L.) Mill in East Central Europe // PLoS One. 2016. V. 11. №3. e0151730. DOI: 10.1371/journal.pone.0151730
- Боронникова С. В. Молекулярно-генетический анализ и оценка состояния генофондов ресурсных видов растений Пермского края. Пермь, 2013. 239 с.
- Zietkiewicz E., Rafalski A., Labuda D. Genome fingerprinting by simple sequence repeat (SSR)-anchored polymerase chain reaction amplification // Genomics. 1994. V. 20. №2. P. 176-183. DOI: 10.1006/geno.1994.1151
- Гостимский С. А., Кокаева З. Г., Боброва В. К. Использование молекулярных маркеров для анализа генома растений // Генетика. 1999. Т. 35. №11. С. 1538-1549.
- Rogers S. O., Bendich A. J. Extraction of DNA from milligram amounts of fresh, herbarium and mummified plant tissues // Plant molecular biology. 1985. V. 5. №2. P. 69-76.
- DOI: 10.1007/BF00020088
- Шакирова А. Р. Подбор эффективных ISSR-праймеров для редких видов растений Pulsatilla flavescens (Zucc.) Juz. и Pulsatilla patens (L.) Mill. // Симбиоз-Россия 2019: материалы XI Всерос. Конгр. молодых ученых-биологов с межд. участием (Пермь, 13-15 мая 2019 г.). Пермь, 2019. C. 162-164.
- Yeh F. C., Mao J., Young R. C. POPGENE, the Microsoft Windows-based user-friendly software for population genetic analysis of co-dominant and dominant markers and quantitative traits. Alta, Department of Renewable Resources. Edmonton: Univ. of Alberta, 1999.
- Peakall R. O. D., Smouse P. E. GENALEX 6: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research // Molecular ecology notes. 2006. V. 6. №1. P. 288-295.
- DOI: 10.1111/j.1471-8286.2005.01155.x
- Williams J. G. K. et al. DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers // Nucleic acids research. 1990. V. 18. №22. P. 6531-6535.
- DOI: 10.1093/nar/18.22.6531
- Nei M. Molecular evolutionary genetics. New York: Columbia Univ. press, 1987.
- Lewontin R. C. The apportionment of human diversity // Evolutionary biology. New York, Springer, 1972. P. 381-398.
- DOI: 10.1007/978-1-4684-9063-3_14
- Животовский Л. А. Показатели внутрипопуляционного разнообразия // Журн. общ. биологии. 1980. Т. 41. № 6. С. 828-836.
- Шакирова А. Р. Молекулярно-генетические исследования редких видов растений рода Pulsatilla Mill. Пермского края с применением ISSR-метода // Симбиоз-Россия 2019: материалы XI Всерос. Конгр. молодых ученых-биологов с межд. участием (Пермь, 13-15 мая 2019 г.): Перм. гос. нац. исслед. ун-т, 2019. C. 161-162.
