Новая мутация в гене TP53, ассоциированная с наследственным раком молочной железы, у молодой пациентки тувинской национальности

Введение. Проблема идентификации в российских популяциях этноспецифических мутаций, ассоциированных с наследственными формами рака молочной железы, остается открытой. Технология высокопроизводительного секвенирования является методом выбора, однако существуют сложности интерпретации полученного массива данных при аннотировании их с использованием общепринятых баз данных. Так, для малоизученных популяций от 20 % молекулярных тестов сообщают о генетических вариантах неизвестного значения (VUS) или новых вариантах, которые ранее не были описаны. Для получения расширенной информации о вариантах высокопроизводительного секвенирования неизвестного значения необходимо использовать альтернативные подходы анализа данных. Материал и методы. Проведена реклассификация мутации неизвестного значения гена ТР53 с использованием базы данных ActiveDriveDB, которая оценивает влияние мутаций на сайты посттрансляционных модификаций, и инструмента ProteinPaint, который обеспечивает всестороннее и интуитивно понятное представление о геномных данных. Результаты. Мутация гена TP53 (rs1555526933) была обнаружена у молодой тувинки 44 лет с диагнозом РМЖ. В базе данных dbPubMed (rs1555526933, chr17:7579716, G>A, Pro27Leu) эта мутация является вариантом неизвестного значения (unknown significance) с отсутствием информации о частоте встречаемости минорного аллеля. Согласно данным инструмента ActiveDriverDB, эта мутация расположена дистально в сайте посттрансляционной модификации белков, отвечающем за связывание с киназами, регулирующими гены клеточного цикла и др. (ATM, CHEK2, CDK, MAPK). Согласно данным ProteinPoint, эта мутация находится в кодоне, где ранее была описана патогенная мутация гена TP53 p.Leu26GlnfsTer4 (NM_000546.6 (TP53): c.77_80delinsAAGAACGT (p.Leu26fs), приводящая к формированию синдрома Ли - Фраумени (группа редких наследственных опухолевых заболеваний). Заключение. Впервые у пациентки (тувинский этнос) с ранним началом РМЖ и отягощенным онкологическим анамнезом описан вариант гена TP53 (rs1555526933), который может быть связан с синдромом наследственной предрасположенности к РМЖ, включая синдром Ли - Фраумени.